沈虎峻
- 作品数：5 被引量：3H指数：1
- 供职机构：中国科学院大连化学物理研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学医药卫生自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 蛋白质折叠的并行预测方法
- 本发明涉及蛋白质折叠的并行预测方法，包括以下步骤：不同的蛋白质结构通过分子动力学模拟得到；设定不同温度，通过副本互换得到更多不同构象的蛋白质结构；采用共轭帽分子分割法对不同构象的蛋白质结构进行分割，将每个氨基酸从蛋白质中...
- 李国辉沈虎峻张鼎林
- 文献传递
- 蛋白质折叠的并行预测方法
- 本发明涉及蛋白质折叠的并行预测方法，包括以下步骤：不同的蛋白质结构通过分子动力学模拟得到；设定不同温度，通过副本互换得到更多不同构象的蛋白质结构；采用共轭帽分子分割法对不同构象的蛋白质结构进行分割，将每个氨基酸从蛋白质中...
- 李国辉沈虎峻张鼎林
- 文献传递
- 高精度生物大分子多尺度模型的建立及应用研究
- 生物大分子模拟不论在化学生物学、生物物理化学、药物设计,还是在舍命科学、生物医药和生物能源与技术等领域都有着极其重要的研究价值和科学意义。尽管经过了近半个世纪的发展取得了长足的进步,但是由于生物学实验技术的快速发展和医药...
- 李国辉李焱彭向达沈虎峻王洪磊张鼎林
- 基于粗粒化模型对有机溶剂的分子动力学模拟被引量：3
- 2011年
- 在基于Boltzmann分布对四种基本构象进行MonteCarlo取样后,通过与全原子模型的范德华势比较得到了Gay-Berne(GB)参数.又在对用量化计算得到的分子体系的电势进行电荷、偶极矩和四极矩的拟合后,得到了电多极展开势(EMP)参数.利用得到的粗粒化参数,基于粗粒化模型,对CHCl3及四氢呋喃(THF)两种有机溶剂进行了分子动力学模拟(MDS),并将结果同全原子模拟进行了比较.计算结果表明用粗粒化模型从整体上能重复全原子模型的模拟结果,但在某些细节的计算与全原子模型有偏差,其原因可能是目前工作仅考虑了单位点情况,为此今后在对具有复杂结构的分子进行粗粒化模拟时还应考虑合理放置及增加相互作用位点.
- 许佩军唐媛媛张静张知博王昆邵颖沈虎峻毛英臣
- 关键词：径向分布函数分子动力学模拟
- 肿瘤靶向MRI/NIR双模态自组装探针的构建及基于新型粗粒化分子模型的理论探索
- 靶向MRI/NIR多模态探针可以有效地兼顾MRI高空间分辨率以及NIR成像灵敏、快速等优势,在医学基础研究和肿瘤临床诊断中具有重要的应用价值.为解决MRI成像对比度差、近红外光学成像穿透能力低以及肿瘤识别缺乏特异性等核心...
- 谭明乾沈虎峻郭昕高倩
