您的位置： 专家智库 > >

张鼎林

作品数：22 被引量：10H指数：1
供职机构：中国科学院大连化学物理研究所更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：自动化与计算机技术生物学理学化学工程更多>>

合作作者

文献类型

  • 19篇专利
  • 2篇会议论文
  • 1篇期刊文章

领域

  • 3篇自动化与计算...
  • 1篇生物学
  • 1篇化学工程
  • 1篇理学

主题

  • 10篇动力学
  • 8篇动力学模拟
  • 8篇分子
  • 7篇粗粒化
  • 5篇电势
  • 5篇原子
  • 5篇生物大分子
  • 5篇静电
  • 5篇静电势
  • 4篇细胞
  • 4篇细胞基因
  • 4篇粒化
  • 4篇基因
  • 4篇建模方法
  • 4篇核糖
  • 4篇核糖体
  • 3篇蛋白
  • 3篇蛋白质
  • 3篇原子模型
  • 3篇分子力场

机构

  • 22篇中国科学院

作者

  • 22篇李国辉
  • 22篇张鼎林
  • 10篇李焱
  • 6篇楚慧郢
  • 5篇张跃斌
  • 3篇沈虎峻
  • 2篇徐贝思
  • 1篇曹了然

传媒

  • 1篇物理化学学报
  • 1篇第八届全国化...
  • 1篇中国化学会第...

年份

  • 2篇2024
  • 1篇2023
  • 2篇2022
  • 1篇2020
  • 2篇2018
  • 4篇2017
  • 2篇2016
  • 3篇2015
  • 3篇2014
  • 1篇2013
  • 1篇2012
共 22 条 记 录，以下是 1-10
全选 清除 导出
排序方式：
生物大分子模拟的理论计算研究新方法
生物大分子模拟是化学生物学与创新药物发现中非常重要的研究课题。分子力场对于生物大分子模拟理论计算研究起到决定性的作用。现有的可极化分子力场虽然精度很高,但是计算速度非常慢,很难用于复杂体系长时间分子动力学模拟。我们提出了...
李国辉李焱楚慧郢张明波彭向达张鼎林
关键词：量子力学计算人工神经网络预测
分子动力学模拟技术在生物分子研究中的进展（英文）被引量：10
2017年
在当今科学探索中,分子动力学模拟作为实验的辅助,替代甚至引导,有越来越大的重要性。在这篇综述里,我们概括介绍了分子模拟领域的发展历史,特别是专注于近期的进展,包括新的分子力场,增强采样技术以及在研究生物分子体系方面的最新成果。
曹了然张春煜张鼎林楚慧郢张跃斌李国辉
关键词：分子动力学模拟分子力场酶促反应
一种计算机预测蛋白功能的方法
本发明涉及一种计算机预测蛋白功能的方法，包括以下步骤：对生物大分子的原子之间的距离进行半粗粒化统计，得到生物大分子之间相互作用的半粗粒化统计势函数；利用半粗粒化统计势函数在目标蛋白周围空间找到相互作用的热点区域；结合分子...
李国辉徐贝思张鼎林
文献传递
与蛋白质相互作用的DNA骨架位置预测方法
本发明涉及与蛋白质相互作用的DNA骨架位置预测方法，包括以下步骤：DNA关键点的确定；DNA空间构象使用粗粒化统计势能函数大规模的搜索；针对第二步到的构象，使用精细的可极化力场对序列进行细选。本发明采用序列分析蛋白核酸界...
李国辉张鼎林
文献传递
BP神经网络预测二肽模型多极展开属性计算方法
本发明涉及基于BP神经网络预测二肽模型多极展开属性计算方法，包括以下步骤：通过量子力学计算软件Gaussian优化不同二肽构象的结构，并计算其物理化学参数及原子间相互距离；选择部分二肽构象的原子的物理化学参数以及原子间相...
李国辉李焱彭向达张鼎林
一种基于有限元表示的分子模拟方法
本发明涉及一种基于有限元表示的分子模拟方法，包括以下步骤：获取生物大分子的空间点云数据做表面三角网格剖分，并生成有限元；取有限元外表面每一个三角形表面的几何中心作为待拟合电荷的位置；通过对有限元大分子周围静电势的拟合得到...
李国辉张鼎林李焱 钟青庐楚慧郢张跃斌
文献传递
基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法
本发明涉及基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法，构建用3个粒子表示一个核苷酸的模型。其中包括该粗粒化模型中各粒子的键联关系方式；该粗粒化模型中各粒子参数的拟合方法；该粗粒化模型与全原子模型映射关系的拟合方法。本发...
李国辉张鼎林李焱
蛋白质折叠的并行预测方法
本发明涉及蛋白质折叠的并行预测方法，包括以下步骤：不同的蛋白质结构通过分子动力学模拟得到；设定不同温度，通过副本互换得到更多不同构象的蛋白质结构；采用共轭帽分子分割法对不同构象的蛋白质结构进行分割，将每个氨基酸从蛋白质中...
李国辉沈虎峻张鼎林
文献传递
一种基于有限元表示的分子模拟方法
本发明涉及一种基于有限元表示的分子模拟方法，包括以下步骤：获取生物大分子的空间点云数据做表面三角网格剖分，并生成有限元；取有限元外表面每一个三角形表面的几何中心作为待拟合电荷的位置；通过对有限元大分子周围静电势的拟合得到...
李国辉张鼎林李焱 钟青庐楚慧郢张跃斌
一种细胞基因翻译过程建模方法
本发明涉及一种细胞基因翻译过程建模方法，包括以下步骤：根据物种的实验数据得到每一个基因在每一个离散时间点该基因是否表达；查询每个离散时间点的基因，如果基因表达，则初始化；否则不进行初始化；通过各时间点上各基因对应的mRN...
李国辉张鼎林赵然
文献传递
全选 清除 导出
共3页<123>
聚类工具0