李国辉
- 作品数：39 被引量：10H指数：1
- 供职机构：中国科学院大连化学物理研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 基于下一代分子力场的分子模拟与设计理论计算方法的发展及应用
- 分子模拟与设计在化学、材料、生命科学、生物医药、生物能源以及生物技术等领域一直都占据着非常重要的研究地位和具有广泛的使用价值.它不仅能够帮助实验工作者更加深入而准确地理解实验现象,而且还能够帮助实验工作者进行虚拟实验,尝...
- 李国辉
- 细胞膜全原子可极化分子力场的建立与应用以及完全自主知识产权高精度生物分子动力学模拟程序的实现
- <正>已知测序的蛋白中有超过30%的蛋白质是膜蛋白,而且已经验证作为药物靶标的蛋白中有超过一半是膜蛋白。膜蛋白所处的微观环境-细胞膜组成异常复杂有别于传统各向同性的溶液环境。有多达64种磷脂分子以及胆固醇等有机分子组成,...
- 李国辉
- 文献传递
- 一种计算机预测蛋白功能的方法
- 本发明涉及一种计算机预测蛋白功能的方法，包括以下步骤：对生物大分子的原子之间的距离进行半粗粒化统计，得到生物大分子之间相互作用的半粗粒化统计势函数；利用半粗粒化统计势函数在目标蛋白周围空间找到相互作用的热点区域；结合分子...
- 李国辉徐贝思张鼎林
- 文献传递
- 理论与计算生物物理化学
- 在生物分子结构与功能的动态模拟、机理解析以及理论预测方法学方面，首次提出并建立了新型高精度粗粒化分子模型，使计算速度比全原子模型大幅提高的同时，计算精度仍然保持全原子精度;在国际上率先建立了细胞膜磷脂分子的高精度全原子可...
- 李国辉
- 飞秒激光控制化学反应的研究
- 楼南泉沙国河王秀岩徐大力韩克利姜波解金春王利陆靖杜四德范康年刘建勇孙萌涛尹淑慧张建阳张柏林胡勇军丛书林孙志刚刘红平杨凇许继君李国辉邵昉伟王顺包涵
- 中国科学院大连化学物理研究所分子反应动力学国家重点实验室于1994年开始飞秒(飞秒是100亿亿分之一秒)激光化学的研究，与美国加州大学伯克利分校化学系合作，研制飞秒激光器和建立飞秒激光化学实验室，同时在飞秒激光控制化学反...
- 关键词：
- 关键词：飞秒化学反应
- 与蛋白质相互作用的DNA骨架位置预测方法
- 本发明涉及与蛋白质相互作用的DNA骨架位置预测方法，包括以下步骤：DNA关键点的确定；DNA空间构象使用粗粒化统计势能函数大规模的搜索；针对第二步到的构象，使用精细的可极化力场对序列进行细选。本发明采用序列分析蛋白核酸界...
- 李国辉张鼎林
- 文献传递
- 基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法
- 本发明涉及基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法，构建用3个粒子表示一个核苷酸的模型。其中包括该粗粒化模型中各粒子的键联关系方式；该粗粒化模型中各粒子参数的拟合方法；该粗粒化模型与全原子模型映射关系的拟合方法。本发...
- 李国辉张鼎林李焱
- 蛋白质折叠的并行预测方法
- 本发明涉及蛋白质折叠的并行预测方法，包括以下步骤：不同的蛋白质结构通过分子动力学模拟得到；设定不同温度，通过副本互换得到更多不同构象的蛋白质结构；采用共轭帽分子分割法对不同构象的蛋白质结构进行分割，将每个氨基酸从蛋白质中...
- 李国辉沈虎峻张鼎林
- 文献传递
- 一种基于分块迭代法的高精度原子电荷计算方法
- 2017年
- 原子电荷是研究生物分子的重要物理化学参数。本文在系统分块法的基础上,通过迭代的量化计算,得到多分子体系在特定环境下的高精度原子电荷,并提出一套完整的多分子体系原子电荷计算方法,Partition Iterative Quantum(PIQ)。本文采用若干种主要的生物体系作为测试体系,验证了所提方法的可行性。并以完全的量子化学计算得到的原子电荷为标准,比较了不同初始电荷设置方式对计算精度和效率的影响。说明了所提方法是可以被应用于不同尺度的分子体系的电荷计算中。
- 李焱汤天宝金乐李冬婷李国辉许佩军
- 关键词：原子电荷分子力场
- 一种基于有限元表示的分子模拟方法
- 本发明涉及一种基于有限元表示的分子模拟方法，包括以下步骤：获取生物大分子的空间点云数据做表面三角网格剖分，并生成有限元；取有限元外表面每一个三角形表面的几何中心作为待拟合电荷的位置；通过对有限元大分子周围静电势的拟合得到...
- 李国辉张鼎林李焱 钟青庐楚慧郢张跃斌
