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庞红侠
作品数:
2
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供职机构:
西北农林科技大学生命科学学院
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相关领域:
生物学
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合作作者
范彦辉
西北农林科技大学生命科学学院
师奇
西北农林科技大学
陶士珩
西北农林科技大学生命科学学院
陈金锋
中国科学院遗传与发育生物学研究...
王文娟
西北农林科技大学生命科学学院
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作者
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庞红侠
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师奇
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范彦辉
传媒
1篇
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1篇
2008
1篇
2005
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随机蛋白质序列全局对位最优分的理论分布研究
序列对位是最常用的一类生物信息学研究方法。它在序列的功能、结构及进化关系预测、数据库搜索,系统发生树构建等方面有着广泛用途。然而,序列对位所得到的分值本身并不能说明太多问题,还需要进一步判定它在统计上是否显著,即随机得到...
庞红侠
关键词:
极值分布
氨基酸
序列对
随机化
形状参数
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大鼠与小鼠内含子中插入、缺失与替换的速度与模式
2008年
研究了啮齿类动物大鼠与小鼠内含子中插入(insertion)、缺失(deletion)和替换(substitution)发生的速度与模式.结果表明,缺失比插入发生的频率高,在大鼠和小鼠中单个碱基的插入与缺失发生频率最高.插入与缺失发生次数随长度的增加而迅速减少,二者的理论分布都符合幂次法则(power-law).在大鼠内含子中,AT→GC的替换频率高于GC→AT,但在小鼠内含子中GC→AT的替换频率高于AT→GC.大鼠与小鼠内含子中存在的缺失偏好表明,由于可能降低转录与剪切的效率,内含子中的插入比缺失更容易受到自然选择的制约.此外,大鼠与小鼠内含子中的替换模式表明,其内含子的组成及GC含量都处于非平衡状态.
范彦辉
师奇
陈金锋
王文娟
庞红侠
唐教伟
陶士珩
关键词:
内含子
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