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师奇
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供职机构:
西北农林科技大学
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相关领域:
生物学
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合作作者
范彦辉
西北农林科技大学生命科学学院
庞红侠
西北农林科技大学生命科学学院
陶士珩
西北农林科技大学生命科学学院
陈金锋
中国科学院遗传与发育生物学研究...
王文娟
西北农林科技大学生命科学学院
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范彦辉
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2008
1篇
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大鼠与小鼠内含子中插入、缺失与替换的速度与模式
2008年
研究了啮齿类动物大鼠与小鼠内含子中插入(insertion)、缺失(deletion)和替换(substitution)发生的速度与模式.结果表明,缺失比插入发生的频率高,在大鼠和小鼠中单个碱基的插入与缺失发生频率最高.插入与缺失发生次数随长度的增加而迅速减少,二者的理论分布都符合幂次法则(power-law).在大鼠内含子中,AT→GC的替换频率高于GC→AT,但在小鼠内含子中GC→AT的替换频率高于AT→GC.大鼠与小鼠内含子中存在的缺失偏好表明,由于可能降低转录与剪切的效率,内含子中的插入比缺失更容易受到自然选择的制约.此外,大鼠与小鼠内含子中的替换模式表明,其内含子的组成及GC含量都处于非平衡状态.
范彦辉
师奇
陈金锋
王文娟
庞红侠
唐教伟
陶士珩
关键词:
内含子
人、黑猩猩内含子的比较研究揭示其功能限制与复杂进化
DNA序列的保守性反映了其功能上的不同限制,这一原则,是比较基因组学研究方法最为重要的基石之一。根据这一原则,以人、黑猩猩的直系同源基因为研究目标,探索在这两个近缘物种分歧之后内含子的进化与功能上的限制。我们统计了内含子...
师奇
关键词:
黑猩猩
内含子
自然选择
基因组结构
外显子
同源基因
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