陈金锋
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:西北农林科技大学生命科学学院生物信息学研究中心更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 大鼠与小鼠内含子中插入、缺失与替换的速度与模式
- 2008年
- 研究了啮齿类动物大鼠与小鼠内含子中插入(insertion)、缺失(deletion)和替换(substitution)发生的速度与模式.结果表明,缺失比插入发生的频率高,在大鼠和小鼠中单个碱基的插入与缺失发生频率最高.插入与缺失发生次数随长度的增加而迅速减少,二者的理论分布都符合幂次法则(power-law).在大鼠内含子中,AT→GC的替换频率高于GC→AT,但在小鼠内含子中GC→AT的替换频率高于AT→GC.大鼠与小鼠内含子中存在的缺失偏好表明,由于可能降低转录与剪切的效率,内含子中的插入比缺失更容易受到自然选择的制约.此外,大鼠与小鼠内含子中的替换模式表明,其内含子的组成及GC含量都处于非平衡状态.
- 范彦辉师奇陈金锋王文娟庞红侠唐教伟陶士珩
- 关键词:内含子
- 基因分型错误对病例对照方法估计疾病外显率可靠性的影响
- 2010年
- 目的探讨基因分型错误对病例对照方法估计疾病外显率的影响及其程度。方法将描述基因分型错误的数学模型整合到基于病例对照样本的疾病外显率估计中,重点研究基因分型错误对于疾病外显率估计值可靠性的影响。结果基因分型错误的发生可以影响病例对照方法估计疾病外显率的精确度,影响的程度除了与错误发生频率有关外,还与基因型频率,疾病模型等因素有关。结论鉴于致病等位基因在人群中的分布频率通常很低,在估计单个致病基因位点上特定基因型的疾病外显率时,基因分型错误是一个不可忽视的影响疾病外显率估计精确性的重要因素。
- 范巍陈金锋陶士珩