黄钰 作品数:8 被引量:13 H指数:3 供职机构: 华中农业大学信息学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中央高校基本科研业务费专项资金 湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队计划项目 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 生物学 文化科学 更多>>
针对MEAs数据的集成分析系统的研究 2010年 针对在神经科学研究中,处理海量异构多电极阵列(MEAs)数据的软件系统普遍缺乏有效的算法集成机制以及协同工作模式,该文提出基于Java环境构建一个工作流管理系统MEAs-System。该系统不仅提供一致的数据和算法接口,而且包含多用户管理模块以支撑协同工作模式,此外,在该系统上还实现了一个MEAs数据分析模块,该模块集成了一系列统计学算法,分类算法以及可视化算法。基于MEAs-System系统这种易于集成数据源和算法工具的高可扩展性结构,可以为神经科学领域的相关研究人员提供一个理想的集成分析平台。 黄钰 胡滨 景秀 王建勇关键词:MEAS 软件系统 生物事件触发词识别方法研究 被引量:1 2015年 从生物文献中抽取生物事件对于生物领域的知识挖掘起着重要的作用,而事件触发词的识别是生物事件抽取的一个关键步骤。系统分别采用词汇及其上下文特征、短语标记特征、词聚类特征以及统计的词典特征构造不同的基于词级的CRF模型,用于生物事件触发词的标记。然后针对不同的触发词类型选择对应最优的标记模型,构造了一个混合CRF模型。在BioNLP 2009ST语料库上进行了实验评估,结果表明提出的方法取得了很好的性能,为生物事件的抽取建立了良好的基础。 魏小梅 黄钰 陈波 姬东鸿关键词:生物事件 CRF模型 BROWN CLUSTER Java语言程序设计的新三段式教学 被引量:5 2011年 针对当前高等院校计算机专业对Java语言程序设计教学内容和方法改革的需要,详细分析了Java语言的教学现状,结合对以前旧三段式教学的认识,从教学内容,方法和实践等方面,提出了基础、实践、课题参与的新三段式教学改革思路。 黄钰 王建勇关键词:教学改革 JAVA GSAS:针对基因序列的集成分析系统 2013年 以J2EE环境为基础构建1个基于工作流的基因序列分析系统GSAS(gene sequence analysis system),该系统提供统一的数据、算法接口和可视化的图形界面,集成多种关键的序列分析算法和工具,同时实现异构数据的整合。GSAS所采用的工作流机制为基因序列分析领域提供了协作研究的解决方案。 黄钰 李平 李儒苗 魏小梅 胡滨 王建勇关键词:基因序列 接口 软件系统 一种基于随机游走模型的关键蛋白质预测方法 被引量:4 2016年 为了解决目前的关键蛋白质预测方法对生物功能的分析不够深入的情况,利用蛋白质复合物信息,提出1种基于随机游走模型,结合蛋白质相互作用网络中的边聚集系数等数据来预测关键蛋白质的RWP(random walk method for predicting essential proteins)算法。在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)蛋白质相互作用网络上,以敏感度、特异性、阳性预测值、阴性预测值、准确率等5个统计学指标为评价标准,将RWP与介数中心性、度中心性、信息中心性、CSC算法及LIDC算法等5种用于预测关键蛋白质的方法进行对比实验。结果表明:RWP在关键蛋白质识别率等方面优于这5种测度方法,它具有较好的预测关键蛋白质的性能。 杨莉萍 路松峰 黄钰关键词:随机游走模型 蛋白质互作网络 蛋白质复合物 针对MEAs数据的集成分析系统的研究 针对在神经科学研究中,处理海量异构多电极阵列(MEAs)数据的软件系统普遍缺乏有效的算法集成机制以及协同工作模式,本文提出基于Java环境构建一个工作流管理系统MEAs-System。该系统不仅提供一致的数据和算法接口,... 黄钰 胡滨 景秀 王建勇关键词:JAVA环境 可扩展性 基于Fisher判别法的一种DNA序列分类方法 被引量:3 2013年 针对DNA序列分类的分属问题,提出采用Fisher判别法进行分类。根据氨基酸分子的性质,构建DNA序列对应的特征向量空间,然后对训练集中的A、B两类DNA序列提取特征,建立Fisher判别函数。应用该判别函数对测试集中的182个DNA序列进行分类实验,结果表明该方法具有很好的分类准确度。 杨莉萍 路松峰 胡和平 黄钰关键词:生物信息学 特征提取 生物信息学网格服务注册中心 2009年 以分子生物学领域中主流的生物信息学应用软件包和服务为对象,研究建立一个统一的生物信息学网格服务注册中心,为在此中心注册的分子生物学不同领域、不同组织开发的应用服务提供统一个半自动化的服务搜索引擎和远程调用平台。 许庆炜 黄钰关键词:生物信息学 网格