高凌云
- 作品数:7 被引量:26H指数:2
- 供职机构:皖南医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部人文社会科学研究基金安徽省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 基于机器学习和智能优化的肿瘤基因表达数据挖掘研究
- 目的:DNA微阵列技术通过同步追踪大量基因的表达水平而得到基因表达谱数据,广泛应用于生物医学各个领域。基因表达数据的一个重要研究方向就是肿瘤等重大遗传性疾病的病理诊断与分类研究。肿瘤作为一种由特定基因序列和表达变异引起的...
- 高凌云
- 关键词:支持向量机
- 文献传递
- 脊髓腹角神经元单细胞膜片钳技术建立及相关受体分析
- 目的:建立新生大鼠脊髓腹角神经元急性分离方法及单细胞膜片钳记录技术,以深入研究脊髓腹角神经元上各受体的分布、分型和作用机制,为揭开脊髓的运动调制奠定基础,为运动神经元疾病的治疗提供思路。方法:选用鼠龄7-12 d的新生S...
- 高凌云
- 关键词:脊髓急性分离新生大鼠
- 文献传递
- 基于对称不确定性和SVM递归特征消除的信息基因选择方法被引量:14
- 2017年
- 基因表达谱中存在大量与肿瘤分类无关的基因,严重降低肿瘤诊断的准确率.基因表达谱还存在高维小样本、噪声大等问题,增加肿瘤诊断的难度.为了获取基因数量较少且分类能力较强的信息基因子集,文中提出基于对称不确定性(SU)和支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)的信息基因选择方法.首先利用SU评估基因和类标签之间的相关性,根据SU定义近似马尔科夫毯,快速消除大量无关和冗余基因.然后利用SVM-RFE进一步剔除冗余基因,获取有效的信息基因子集.实验表明,文中方法可以在选取维数较少或相等的信息基因子集情况下获取较高的肿瘤分类性能.
- 叶明全高凌云伍长荣万春圆
- 关键词:基因选择支持向量机肿瘤分类
- α7-nAChR基因敲除小鼠海马神经元突触传递和神经网络的电生理表型(英文)被引量:1
- 2019年
- 研究显示,含有α7亚基的烟碱型乙酰胆碱受体(α7 nicotinic acetylcholine receptor,α7-nAChR)基因敲除(α7 KO)的小鼠表现出很少的功能表型。本文旨在研究α7 KO对小鼠海马电生理特征的影响。用标准胞外场电位记录评估α7 KO对小鼠海马CA3-CA1突触传递的影响,用穿孔膜片钳记录检测小鼠海马单个神经元γ-氨基丁酸A型受体(γ-aminobutyric acid A-type receptor, GABA_A-R)的电生理学表型。结果显示,与野生型小鼠相比,α7 KO小鼠海马CA1神经元场兴奋性突触后电位(field excitatory postsynaptic potential, fEPSP)斜率显著降低,卡巴胆碱诱发的θ振荡显著减少。在给予GABA_A-R激动剂蝇覃醇(muscimol)条件下,与野生型小鼠相比,α7 KO小鼠海马CA1和CA3神经元I–V曲线均向去极化方向明显移动。以上结果提示,α7KO小鼠海马CA3-CA1突触传递显著受损,GABA_A-R成熟显著延迟,表明α7-nAChR基因缺失可显著改变海马的电生理功能,这可能为α7-nAChR在海马功能和海马相关疾病中作用的理解提供了新的认识。
- 郑超高凌云张环环查盈盈汪萌芽
- 关键词:烟碱型乙酰胆碱受体基因敲除突触传递
- Orexin-A对脊髓腹角神经元基本电生理参数及尼古丁电流的作用被引量:1
- 2019年
- 目的:研究orexin-A对脊髓腹角神经元基本电生理参数及烟碱型乙酰胆碱受体(nAChR)的作用。方法:使用7~12d的新生SD大鼠。麻醉后,将含有腰骶膨大的脊髓分离并切片。用木瓜蛋白酶(papain,0.18g/30mL人工脑脊液消化切片并孵育40min。显微镜下选取腹角,使用抛光的巴斯德吸管进行神经元的急性机械分离。对贴壁的健康神经元进行穿孔膜片钳记录。结果:①急性分离的脊髓腹角神经元状态良好,具有形状多样的胞体和完整的突起;②9个急性分离的脊髓腹角神经元有自发动作电位;③持续灌流orexin-A(OXA)2min后,在5例细胞记录到4个脊髓腹角神经元的自发动作电位放电频率增加了(63.64±5.25)%,幅度等参数无明显变化;④在15个神经元,有12例细胞给予0.3mmol/L尼古丁诱导出内向电流,幅度为(142.97±75.02)pA,用100nmol/LOXA进行2min的预处理,可显著抑制电流幅度至(69.07±61.07)pA(P<0.001),抑制率为(54.75±22.62)%;⑤在9个神经元中有7例细胞给予尼古丁诱导的电流幅度为(129.31±69.38)pA,将100nmol/LOXA共同施用于神经元,尼古丁诱导的电流幅度降为(68.61±34.98)pA,在此基础上,通过施用orexin-1受体(OX1R)拮抗剂SB334867(10μmol/L)2min后可阻断OXA对尼古丁诱导电流的抑制作用,电流幅值为(93.46±56.45)pA。因此,SB334867可完全取消OXA对尼古丁电流的抑制作用。但对于另两例神经元,SB334867并未阻断OXA的抑制作用。结论:Orexin-A可能通过OX1R对脊髓大部分腹角神经元的尼古丁电流具有抑制作用,但不能排除orexin-2受体(OX2R)也参与OXA作用的可能性。
- 黄艳高凌云朱苏月张环环汪萌芽郑超
- 关键词:OREXIN-A
- 基于人工蜂群和SVM的基因表达数据分类被引量:9
- 2018年
- 基因表达数据存在高维、小样本、高噪声等特性,使得相应的肿瘤分类诊断面临着一定的挑战。为了实现更加精确的分类准确率,利用人工蜂群(artificial bee colony,ABC)算法对支持向量机(support vector machine,SVM)的核函数参数和惩罚因子进行优化,采用准确率作为分类模型的适应度函数,提出一种基于ABC和SVM的基因表达数据分类方法 ABC-SVM。在6种公开的肿瘤基因表达数据集上进行试验,并对比分析其他的分类方法。结果表明,在筛选得到的较少信息基因基础上,ABC-SVM可获得更高的肿瘤分类准确率,对肿瘤样本类型进行更有效的分类预测。
- 叶明全高凌云万春圆
- 关键词:人工蜂群支持向量机基因表达数据肿瘤分类生物信息学
- 急性分离的脊髓腹角神经元膜片钳记录技术被引量:2
- 2017年
- 目的:建立急性分离的脊髓腹角神经元膜片钳记录技术以深入研究脊髓腹角神经元上受体的作用。方法:选用6~11 d的新生SD大鼠,麻醉后分离出含腰骶膨大的脊髓,制备切片,给予酶消化,切除背角,将腹角吹打分离出单细胞,进行膜片钳记录。结果:(1)分离的腹角神经元形态良好,胞体呈纺锤形、三角形和多边形伴多条细长突起;(2)7个神经元记录到自发动作电位,其细胞电生理特性为:静息电位(-61.88±16.70)mV;阈电位(-47.39±8.02)mV;锋电位幅值(55.79±17.17)mV;超射(8.39±7.70)mV;放电频率(13.54±9.97)Hz;(3)7个神经元给予1 mmol/L谷氨酸诱发电流幅值(324.56±90.54)pA,翻转电位(19.43±12.10)mV;8个神经元给予2 mmol/L尼古丁诱发电流幅值(296.91±77.44)pA,翻转电位(29.06±14.88)mV。结论:急性分离脊髓腹角神经元膜片钳记录技术切实可行,可用于脊髓腹角神经元相关调质或药物的作用机理研究。
- 高凌云张环环查盈盈郑超汪萌芽
- 关键词:脊髓急性分离新生大鼠