刘伟奇
- 作品数：6 被引量：9H指数：2
- 供职机构：上海海洋大学食品学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科学技术委员会资助项目上海市科技兴农推广项目更多>>
- 相关领域：农业科学轻工技术与工程生物学理学更多>>
- 不同来源的副溶血性弧菌CRISPR检测及其比较分析
- 为了探究不同来源的副溶血性弧菌的规律成簇间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)特点,本研究对42株临床分离...
- 刘伟奇董旭日刘海泉潘迎捷赵勇
- 关键词：副溶血性弧菌CRISPR
- 文献传递
- 引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病的副溶血弧菌MLST新序列型被引量：7
- 2018年
- 针对12株引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病(AHPND)的致病性副溶血弧菌,运用多位点测序技术,分析致病菌株的遗传特征。实验选择副溶血弧菌的7个管家基因dnaE、gyrB、recA、dtdS、pntA、pyrC及tnaA,对12株AHPND致病菌扩增测序。将核酸序列上传至PubMLST数据库进行比对后获得每株菌的序列型。收集其他地区AHPND致病性副溶血弧菌的多位点序列分型(MLST)数据,采用eBURSTV3及MEGA5.0软件进行遗传进化分析。结果显示,2014年中国广东分离的AHPND致病株属于一个新序列型ST1710(42、134、99、79、141、41、51),仅与库中ST415及ST975同源性较高。目前,急性肝胰腺坏死致病株的9种ST型可归为2个克隆组和5个单体。经系统发育树进一步分析可知新序列型ST1710与单体ST975遗传关系相近。本研究首次报道中国AHPND分离株的序列型,丰富了PubMLST数据库,并为其遗传进化研究奠定了理论基础。
- 孙明玉冯博张昭寰徐马俊坤刘伟奇刘海泉潘迎捷赵勇
- 关键词：凡纳滨对虾副溶血弧菌
- 常见食源性致病菌CRISPR系统结构与功能研究进展被引量：2
- 2017年
- 近年发现细菌和古细菌中广泛存在规律成簇间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)系统,该系统能够有效地防御噬菌体等外源基因元件的入侵,限制基因的水平转移。而在食源性致病菌中CRISPR系统除了免疫防御功能以外,还可能具有调节细菌毒力等的其他功能。并且食源性致病菌的CRISPR系统呈现出的多样性在不同菌株之间存在差异,这种差异为食源性致病菌的遗传进化、分子分型提供了更为可靠的依据。因此,近年来针对食源性致病菌中CRISPR系统结构与功能的研究逐渐成为热点。为了进一步探究CRISPR系统在食源性致病菌中的作用机制与应用前景,本文综述了几种常见的食源性致病菌CRISPR系统的基本结构及相关功能的研究进展。
- 刘伟奇王旭刘海泉潘迎捷赵勇
- 关键词：食源性致病菌
- 副溶血性弧菌CRISPR的检测及其结构分析
- 2017年
- 【目的】检测副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus,简称VP)中规律成簇间隔的短回文序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR),并对不同来源的VP中CRISPR位点的结构多样性进行分析。【方法】根据CRISPR DB数据库中公布的VP中确定的CRISPR结构序列CRISPR-1及文献中新发现的疑似CRISPR结构序列CRISPR-2设计引物,对不同来源的79株VP进行PCR扩增。利用CRISPR Finder分析CRISPR结构,采用生物信息学方法对不同来源VP的CRISPR位点结构多样性进行比较分析。【结果】79株VP中CRISPR-1的检出率为92.41%,CRISPR-2的检出率为96.20%,同时具有这2个位点的菌株占总数的89.87%,只有1株菌被检出不含有任何位点。分别比较不同来源的菌株CRISPR-1、CRISPR-2位点的重复序列发现不存在序列差异,而临床菌株的这2个CRISPR位点在间隔序列上比环境分离菌株存在更多的变异。2个CRISPR位点根据间隔序列的不同在VP中一共组成8种CRISPR谱型(编号A-H),除F谱型外,A-E、G谱型均只在临床分离菌株中发现,而在环境分离菌中还发现不含任何位点的H型。【结论】CRISPR在VP中普遍存在。环境分离菌株与临床分离菌株中CRISPR的结构存在差异。
- 刘伟奇董旭日汤荣陈雯静洪庆刘海泉潘迎捷潘迎捷
- 关键词：副溶血性弧菌CRISPR
- 应用CRISPR-Cas9系统编辑大肠杆菌qseB基因的研究进展
- CRISPR-Cas9系统是利用crRNA和tracrRNA形成复合体与Cas9蛋白结合，对靶位点进行准确的剪切，诱发细胞的修复机制进行修复，从而产生突变。本文运用CRISPR-Cas9基因编辑技术与λ-Red重组系统偶...
- 苟怡刘伟奇刘海泉赵勇
- 关键词：大肠杆菌
- 常见食源性致病菌CRISPR系统结构与功能研究进展
- 近年发现细菌和古细菌中广泛存在规律成簇间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)系统,该系统能够有效地防御噬菌...
- 刘伟奇潘迎捷赵勇
- 关键词：食源性致病菌
