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苏金锋

作品数：1 被引量：3H指数：1
供职机构：广州中医药大学中药学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇阳春砂
  • 1篇转录
  • 1篇转录组
  • 1篇萜类
  • 1篇酶基因
  • 1篇克隆
  • 1篇基因
  • 1篇基因克隆
  • 1篇基因挖掘
  • 1篇合酶基因

机构

  • 1篇广州中医药大...

作者

  • 1篇王焕
  • 1篇杨锦芬
  • 1篇詹若挺
  • 1篇邓可
  • 1篇苏金锋
  • 1篇王虹
  • 1篇王腾

传媒

  • 1篇广州中医药大...

年份

  • 1篇2016
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
阳春砂基于转录组的萜类合酶基因挖掘及一个单萜合酶基因的克隆被引量：3
2016年
【目的】深入挖掘阳春砂转录组中挥发性萜类合酶相关基因,为全面认识阳春砂挥发性萜类代谢途径和分子调控模式奠定基础。【方法】整理前期工作获得的阳春砂2个转录组的数据,筛选已注释的及利用本地blast方法再注释的萜类合成途径的unigene;并通过对部分候选unigene的表达量与挥发性萜类化合物含量的相关性分析及生物信息学分析,进一步筛选出相关基因;采用PCR及重组载体构建的方法克隆其中一个单萜合酶基因,并对其编码蛋白序列进行分析。【结果】筛选得到10个挥发性萜类合成上游途径相关unigene及11个下游萜类合酶基因;相关性分析证明候选基因与阳春砂主要挥发性萜类有较强相关性;并成功克隆得到Av TPS1基因,其序列包含1 803 bp的开放阅读框,编码600个氨基酸;其编码蛋白含有单萜合酶蛋白特有的DDXXD、RRX8W和NSE/DTE等保守基序,N端含有一段叶绿体转运肽;系统进化分析表明Av TPS1属于TPS-b亚家族。【结论】结合转录组、表达谱数据的深入挖掘和与挥发性萜类化合物数据的关联,有效筛选出了阳春砂多个值得后续研究的萜类合酶基因;其中对Av TPS1的克隆及生物信息学分析为后续功能鉴定提供了基础。
邓可杨锦芬王腾王虹王焕苏金锋詹若挺
关键词：阳春砂转录组基因克隆
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