何晓丽
- 作品数：1 被引量：3H指数：1
- 供职机构：苏州大学医学部更多>>
- 发文基金：国家大学生创新性实验计划项目更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 近红外光谱结合支持向量机对STR基因座的化学模式识别分型被引量：3
- 2010年
- 利用近红外光谱(NIRS)结合支持向量机(SVM)模式识别原理建立了微卫星(短串联重复序列,STR)的分型方法。以D16S539基因座的10-10、10-11和11-11 3种不同基因型为例,研究了包含该多态性位点的脱氧核糖核酸(DNA)片段的聚合酶链反应(PCR)扩增条件和NIRS检测条件,建立了标准化扩增条件和检测条件,以此条件获得了基因分型的标准物及其标准NIRS。以标准光谱为识别变量,建立该3类基因型的SVM判别模型,有效地克服了光谱共线性,并对少样本数表现出良好的稳定性,模型预测率100%。该方法不需任何检测前处理,而只需一步PCR扩增和NIRS检测即可实现STR分型,具有简单、快速、低成本等优点。
- 郭莉萍徐容任丽何晓丽姚敏贺华兰谢洪平
- 关键词：近红外光谱支持向量机短串联重复序列基因型
