李冬玲
- 作品数:6 被引量:31H指数:2
- 供职机构:中国农业大学理学院应用化学系更多>>
- 发文基金:中央高校基本科研业务费专项资金国家科技支撑计划国家基础科学人才培养基金更多>>
- 相关领域:理学化学工程农业科学更多>>
- 基于昆虫OBP7晶体结构的新型EBF类似物的生物合理设计
- 当蚜虫受到外界干扰时,会释放出主要成分为(反)-β-法尼烯(EBF)的蚜虫报警信息素。昆虫气味结合蛋白OBP可以负责调控EBF,通过识别气味小分子并携带使其穿过亲水性淋巴液到达嗅觉受体,发挥生物功能。因此,本文运用分子对...
- 王珊珊孙玉凤陈文雅李冬玲彭炜段红霞杨新玲
- 关键词:气味结合蛋白分子对接生物合理设计
- 基于GID1A的苯邻二甲酰亚胺类化合物的3D-QSAR研究
- AC-94,377属于苯邻二甲酰亚胺类化合物,是目前报道的唯一具有赤霉素(GA)活性的化合物.本文采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)对24个苯邻二甲酰亚胺类化合物及活性GA分子...
- 李冬玲张微微彭炜王珊珊段红霞杨新玲
- 关键词:植物生长调节剂构效关系
- 文献传递
- 多巴胺D2受体的同源模建研究
- 2012年
- 多巴胺是大脑中含量最丰富的儿茶酚胺类神经递质,主要通过多巴胺受体调控中枢神经系统的多种生理功能,其中多巴胺D2受体与药物成瘾、精神分裂症、帕金森病等多种疾病的发生相关。然而多巴胺D2受体的晶体结构至今尚未解析出来,给相关疾病的药物设计与开发带来困难。本文采用同源模建的方法,用目前与多巴胺D2受体同源性最高的多巴胺D3受体(3PBL)作为模板,构建多巴胺D2受体的三维结构。经过优化和分子动力学模拟,用Profile-3D和Ramachandran plot对模型进行评估,然后用多巴胺D2受体拮抗剂千金藤啶碱(stepholidine,SPD)进行对接验证,证明构建的多巴胺D2受体模型合理、可靠。
- 芮亚然刘维国李冬玲张严
- 关键词:多巴胺D2受体同源模建分子动力学模拟分子对接
- 基于昆虫气味结合蛋白的新型酰基哌啶类化合物的构效关系被引量:4
- 2013年
- 利用Sybyl7.3软件对29个具有驱避活性的新型酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白AgamOBPl的结合模式进行研究,发现二者之间的结合以疏水作用和水桥作用为主.其中酰基哌啶类化合物末端的疏水片段可与AgamOBPl结合腔内狭长的疏水通道产生相互作用.同时,其关键药效基团——酰基氧可通过HOHl53与AgamOBPl中的关键残基Twll4和Gly92或Cys95形成多重氢键作用.利用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)构建了新型酰基哌啶类化合物的三维定量构效关系(3D—QSAR)模型,其交叉验证系数r:。分别为0.650和0.587.研究表明,在CoMSIA模型中,疏水场、静电场和立体场组合所得的三维构效关系模型最佳,其中尤以疏水场对这类酰基哌啶类化合物的驱避活性最为重要.基于AgamOBPl靶标结合口袋特征和酰基哌啶类化合物的3D—QSAR模型得出具有驱避活性的酰基哌啶类化合物的构效关系如下:在酰基C上引入一定碳链长度的疏水基团可使化合物表现出驱避活性,其中又以含9~10个C的化合物的驱避活性最佳,这与AgamOBPl结合口袋的疏水性质密不可分;当酰基端碳链长度一定时,在哌啶环上不宜引入立体效应过大的取代基,这是由AgamOBPl结合口袋的大小决定的;与哌啶N相连的酰基作为氢键受体基团,对于化合物识别与结合AgamOBPl蛋白至关重要.
- 陈文雅王珊珊李冬玲彭炜赵静馥段红霞
- 关键词:气味结合蛋白分子对接三维定量构效关系
- 基于OBP1的酰基哌啶类驱避化合物的构效关系研究
- 本文利用SYBYL7.3软件对具有驱避活性的酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白OBP1结合模式进行研究,发现二者之间的相互作用主要是水桥作用和疏水作用.基于二者结合模式得出酰基哌啶类化合物的构效关系为:当哌啶环上取代基大小和...
- 陈文雅王珊珊李冬玲彭炜段红霞杨新玲
- 关键词:生物活性构效关系
- 文献传递
- 赤霉素及其功能类似物与赤霉素受体的研究进展被引量:27
- 2013年
- 赤霉素是一类以贝壳杉烯为骨架的植物激素,现已鉴定出136种赤霉素结构,但仅有少部分具有调节植物生长和发育的生理功能。近年来,赤霉素受体的研究取得了重大突破,尤其是最近成功鉴定了拟南芥Arabidopsis thaliana中GA3/GA4-GID1A-DELLA复合物的晶体结构,这为基于受体蛋白结构进行新型赤霉素功能类似物的生物合理设计奠定了重要基础。主要针对赤霉素及其功能类似物的化学结构与合成、赤霉素受体蛋白的结构特征及其与赤霉素类化合物分子间的相互识别规律进行归纳和总结,以期能够为以生物靶标蛋白为导向,开发新型骨架的赤霉素功能类似物提供参考。
- 李冬玲段红霞刘鸿晨王珊珊彭炜杨新玲
- 关键词:赤霉素