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陈文雅
作品数:
3
被引量:4
H指数:1
供职机构:
中国农业大学理学院应用化学系
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发文基金:
中央高校基本科研业务费专项资金
国家基础科学人才培养基金
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相关领域:
理学
化学工程
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合作作者
段红霞
中国农业大学理学院应用化学系
李冬玲
中国农业大学理学院应用化学系
王珊珊
中国农业大学理学院应用化学系
彭炜
中国农业大学理学院应用化学系
杨新玲
中国农业大学理学院应用化学系
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气味结合蛋白
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构效关系
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分子对接
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三维定量构效...
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生物合理设计
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构效关系研究
机构
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中国农业大学
作者
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彭炜
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3篇
王珊珊
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1篇
第十三届全国...
年份
3篇
2013
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3
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基于昆虫OBP7晶体结构的新型EBF类似物的生物合理设计
当蚜虫受到外界干扰时,会释放出主要成分为(反)-β-法尼烯(EBF)的蚜虫报警信息素。昆虫气味结合蛋白OBP可以负责调控EBF,通过识别气味小分子并携带使其穿过亲水性淋巴液到达嗅觉受体,发挥生物功能。因此,本文运用分子对...
王珊珊
孙玉凤
陈文雅
李冬玲
彭炜
段红霞
杨新玲
关键词:
气味结合蛋白
分子对接
生物合理设计
基于OBP1的酰基哌啶类驱避化合物的构效关系研究
本文利用SYBYL7.3软件对具有驱避活性的酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白OBP1结合模式进行研究,发现二者之间的相互作用主要是水桥作用和疏水作用.基于二者结合模式得出酰基哌啶类化合物的构效关系为:当哌啶环上取代基大小和...
陈文雅
王珊珊
李冬玲
彭炜
段红霞
杨新玲
关键词:
生物活性
构效关系
文献传递
基于昆虫气味结合蛋白的新型酰基哌啶类化合物的构效关系
被引量:4
2013年
利用Sybyl7.3软件对29个具有驱避活性的新型酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白AgamOBPl的结合模式进行研究,发现二者之间的结合以疏水作用和水桥作用为主.其中酰基哌啶类化合物末端的疏水片段可与AgamOBPl结合腔内狭长的疏水通道产生相互作用.同时,其关键药效基团——酰基氧可通过HOHl53与AgamOBPl中的关键残基Twll4和Gly92或Cys95形成多重氢键作用.利用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)构建了新型酰基哌啶类化合物的三维定量构效关系(3D—QSAR)模型,其交叉验证系数r:。分别为0.650和0.587.研究表明,在CoMSIA模型中,疏水场、静电场和立体场组合所得的三维构效关系模型最佳,其中尤以疏水场对这类酰基哌啶类化合物的驱避活性最为重要.基于AgamOBPl靶标结合口袋特征和酰基哌啶类化合物的3D—QSAR模型得出具有驱避活性的酰基哌啶类化合物的构效关系如下:在酰基C上引入一定碳链长度的疏水基团可使化合物表现出驱避活性,其中又以含9~10个C的化合物的驱避活性最佳,这与AgamOBPl结合口袋的疏水性质密不可分;当酰基端碳链长度一定时,在哌啶环上不宜引入立体效应过大的取代基,这是由AgamOBPl结合口袋的大小决定的;与哌啶N相连的酰基作为氢键受体基团,对于化合物识别与结合AgamOBPl蛋白至关重要.
陈文雅
王珊珊
李冬玲
彭炜
赵静馥
段红霞
关键词:
气味结合蛋白
分子对接
三维定量构效关系
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