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徐敏杰
作品数:
2
被引量:7
H指数:2
供职机构:
复旦大学生殖与发育研究院
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发文基金:
上海市“科技创新行动计划”
国家自然科学基金
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
医药卫生
自动化与计算机技术
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合作作者
窦同海
复旦大学生命科学学院遗传工程国...
吴奇涵
复旦大学生殖与发育研究院
陆雁
上海中医药大学附属岳阳中西医结...
龚亚斌
上海中医药大学附属岳阳中西医结...
许玲
上海中医药大学附属岳阳中西医结...
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医药卫生
主题
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选择性剪接
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循环DNA
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循环肿瘤细胞
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中医肿瘤
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肿瘤
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小细胞肺癌
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非小细胞肺癌
1篇
肺癌
机构
2篇
复旦大学
1篇
上海中医药大...
1篇
悉尼大学
作者
2篇
窦同海
2篇
徐敏杰
1篇
施俊
1篇
许玲
1篇
龚亚斌
1篇
周雁
1篇
江建平
1篇
陆雁
1篇
刘匆
1篇
高原
1篇
吴奇涵
传媒
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复旦学报(自...
1篇
检验医学与临...
年份
1篇
2017
1篇
2016
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2
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癌症相关基因选择性剪接进化数据库的构建
被引量:3
2016年
选择性剪接是真核生物基因调控的基本调节机制之一,与各种类型的生理和病理活动相关.癌症相关基因的不正常剪接可能与多种癌症的发生发展有关.作为选择性剪接进化的主体,选择性剪接外显子展示了其在不同物种中多样的进化功能.本文系统整理了2 989个癌症相关基因的各项功能,通过比较基因组学的分析方法总结了癌症相关基因的选择性剪接外显子的功能和进化关系,建立了癌症相关基因选择性剪接进化数据库(ASeeDB数据库).ASeeDB包含癌症相关基因外显子区域的进化保守性、结构域预测、Ka/Ks值、以及基因、转录本、外显子区域3个层次的表达量统计等信息,结合这些信息用户可以方便的检索有研究意义的基因或者外显子.外显子区域蛋白质结构域的预测可以帮助了解其可能的功能,而外显子是否存在选择性剪接又可以推及包含该外显子的转录本是否具有相似的功能以及推测剪接是否会对蛋白质功能发生影响.数据库提供的物种间的序列比对可以帮助用户发现没有注释的外显子区域或者是保留的失去功能的外显子.相比于基因层面的Ka/Ks,数据库提供的外显子层面的Ka/Ks对于发现适应性进化事件具有更高的敏感性,可以更加方便地预示基因中未知功能的区域.
徐敏杰
窦同海
徐佳熹
江建平
刘匆
付茂宾
高原
陈诚文
张亮
周雁
关键词:
癌症
选择性剪接
数据库
外显子
液态活检在非小细胞肺癌中的应用及对中医肺癌研究的启示
被引量:4
2017年
肺癌是全球癌症发病率和死亡率最高的疾病之一,其中非小细胞肺癌占83%。NSCI.C以肿瘤组织的病理学诊断为金指标,可用于组织学分型、分子病理诊断、预后判断与治疗方案选择。然而由于肿瘤的异质性和进化,
陆雁
姚依勃
窦同海
徐敏杰
吴奇涵
龚亚斌
施俊
董其瀚
许玲
关键词:
中医肿瘤
循环DNA
循环肿瘤细胞
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