殷晓晨
- 作品数:4 被引量:18H指数:2
- 供职机构:上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 中药祛湿化瘀方对非酒精性脂肪性肝病大鼠肠道菌群结构的影响
- 非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease, NAFLD)是包括单纯性脂肪肝到脂肪性肝硬化的组疾病谱,已经成为许多国家慢性肝病的主要病因。近年来大量研究表明,高脂饮食诱导的肠道...
- 殷晓晨
- 关键词:非酒精性脂肪性肝病中药变性梯度凝胶电泳
- 文献传递
- 肠道硫酸盐还原菌DGGE分析技术的建立被引量:2
- 2013年
- 目的建立分析肠道内硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)组成的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)技术,并用于分析10例健康人粪便样品中的SRB组成。方法从GenBank中下载13株脱硫弧菌科细菌的腺苷酰硫酸还原酶α亚基基因(aprA)的序列,利用Clustal X、Simulated PCR(SPCR)软件比较、评估了2对针对aprA基因的引物(AprA-3-FW/APS-RV和AprA-1-FW/AprA-5-RV)用于扩增粪便样品中的SRB的特异性。确定PCR引物和条件,进一步摸索并建立DGGE分析体系。结果 Clustal X和SPCR软件分析的结果均表明引物AprA-3-FW/APS-RV优于AprA-1-FW/AprA-5-RV。实际PCR的结果也显示AprA-1-FW/AprA-5-RV扩增效率低并有非特异扩增。建立DGGE体系,对10例健康人肠道中SRB的分析显示,每个个体肠道中SRB的种类有1到5种不等。结论基于aprA序列的DGGE技术是分析肠道SRB组成的有效方法。
- 刘辰雷殷晓晨龙文敏费娜赵立平庞小燕
- 关键词:硫酸盐还原菌DGGE肠道菌群
- 高脂饲料诱导的肥胖大鼠肠道内硫酸盐还原菌的定量检测被引量:1
- 2012年
- 目的检测高脂饲料诱导大鼠肥胖过程中,大鼠肠道内硫酸盐还原菌(sulfate-reducing bacteria,SRB)的数量变化,为研究SRB与肥胖的关系提供参考。方法 20只Wistar大鼠随机分为2组(每组10只),一组饲喂高脂饲料(HFD组)18周,另一组饲喂正常饲料(NCD组,即对照组)18周。以编码腺苷酰硫酸还原酶α亚基的基因(aprA)作为分子标记,通过荧光定量PCR的方法检测两组大鼠在0、8和18周,肠道内SRB的数量变化;同时,以16S rRNA基因作为标记基因定量大鼠肠道内总菌的数量,以计算肠道内SRB在总菌中的比例变化。结果分组饲喂8周后,高脂饲料饲喂组大鼠的体重与正常饲料组相比显著升高。对SRB的定量结果显示,饲喂8周和18周,高脂饲料组大鼠肠道内SRB的数量和含量与正常饲料组相比显著升高。结论大鼠肠道中的硫酸盐还原菌与饮食诱导的肥胖密切相关,为进一步研究SRB在肥胖及其相关代谢疾病的发生发展中的作用提供了依据。
- 冯雨佳张旭刘辰雷殷晓晨赵立平陈峰庞小燕
- 关键词:硫酸盐还原菌肥胖大鼠荧光定量PCR
- 重度肥胖症患者膳食干预前后肠道内硫酸盐还原菌的定量检测被引量:9
- 2012年
- 目的检测重度肥胖症患者膳食干预过程中,肠道内硫酸盐还原菌(SRB)的数量变化,为进一步研究SRB与肥胖的关系提供参考。方法以SRB基因组中的重要功能基因-腺苷酰硫酸(APS)还原酶基因作为指示基因,通过实时定量PCR的方法检测了12名重度肥胖症患者在进行膳食干预过程中随着体重的降低,肠道内SRB的数量变化,同时以16S rRNA基因对肠道内总菌进行定量来计算SRB占总菌的相对比例。结果膳食干预过程中,随着患者体重的显著降低,其肠道内SRB占总菌的比例也显著下降。在维持期,患者体重仍和干预前有显著差异,但较干预期有所回升;其体内SRB含量也显著低于干预前,但相比干预期,有所上升。结论研究结果提示肠道菌群中SRB细菌与肥胖的发展有密切关系,为后续研究SRB细菌的功能和作用机理奠定了基础。
- 殷晓晨费娜肖水明申剑赵立平庞小燕
- 关键词:硫酸盐还原菌重度肥胖症膳食干预定量PCR