刘辰雷
- 作品数:4 被引量:8H指数:2
- 供职机构:上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 肠道硫酸盐还原菌DGGE分析技术的建立被引量:2
- 2013年
- 目的建立分析肠道内硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)组成的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)技术,并用于分析10例健康人粪便样品中的SRB组成。方法从GenBank中下载13株脱硫弧菌科细菌的腺苷酰硫酸还原酶α亚基基因(aprA)的序列,利用Clustal X、Simulated PCR(SPCR)软件比较、评估了2对针对aprA基因的引物(AprA-3-FW/APS-RV和AprA-1-FW/AprA-5-RV)用于扩增粪便样品中的SRB的特异性。确定PCR引物和条件,进一步摸索并建立DGGE分析体系。结果 Clustal X和SPCR软件分析的结果均表明引物AprA-3-FW/APS-RV优于AprA-1-FW/AprA-5-RV。实际PCR的结果也显示AprA-1-FW/AprA-5-RV扩增效率低并有非特异扩增。建立DGGE体系,对10例健康人肠道中SRB的分析显示,每个个体肠道中SRB的种类有1到5种不等。结论基于aprA序列的DGGE技术是分析肠道SRB组成的有效方法。
- 刘辰雷殷晓晨龙文敏费娜赵立平庞小燕
- 关键词:硫酸盐还原菌DGGE肠道菌群
- 肠道内硫酸盐还原菌的多样性分析
- 硫酸盐还原菌(sulfate reducing bacteria, SRB)是一类以硫酸盐为呼吸链终端电子受体从而氧化有机物和氢气以获取能量的一类厌氧微生物。硫酸盐还原菌不仅抑制丁酸盐的产生,而且消耗肠道内已有的丁酸盐;...
- 刘辰雷
- 关键词:硫酸盐还原菌多样性细胞毒性生理特性糖尿病
- 一种肠道硫酸盐还原菌的增菌培养基被引量:1
- 2013年
- 目的针对已经分离、纯化的肠道硫酸盐还原菌,建立一种能快速、高效地培养菌体的培养基。方法比较营养丰富的GAM肉汤与常用于培养硫酸盐还原菌的选择性培养基Postgate的培养效果,摸索在GAM肉汤中添加不同浓度的硫酸盐对两种肠道硫酸盐还原菌-Desulfovibrio desulfuricans和Desulfovibrio intestinalis的培养效果。确定效果最佳的改良GAM培养基配方,并测定在该培养基中D.desulfuricans的生长曲线。结果与Postgate培养基相比,GAM肉汤能在2 d内快速培养D.desulfuricans,但培养至6 d时细菌数量大幅降低。在GAM肉汤中添加Na2SO4与FeSO4,在实验浓度范围内,均显著地促进硫酸盐还原菌的生长。在此基础上改良GAM肉汤培养基,培养得到的细菌数量较GAM肉汤显著提高。D.desulfuricans的生长曲线显示,2 d时细菌生长达到最高峰,数量可达3.5×107CFU/mL;培养6 d,细菌数量为7.3×106CFU/mL。结论基于GAM肉汤改良而得到的增菌培养基,能快速、高效地培养肠道硫酸盐还原菌,为后续进一步研究肠道硫酸盐还原菌的生理功能提供了支持。
- 陈坤赵宇峰冯雨佳刘辰雷李学明赵立平庞小燕
- 关键词:硫酸盐还原菌增菌培养基肠道微生物
- 高脂饲料诱导的肥胖大鼠肠道内硫酸盐还原菌的定量检测被引量:2
- 2012年
- 目的检测高脂饲料诱导大鼠肥胖过程中,大鼠肠道内硫酸盐还原菌(sulfate-reducing bacteria,SRB)的数量变化,为研究SRB与肥胖的关系提供参考。方法 20只Wistar大鼠随机分为2组(每组10只),一组饲喂高脂饲料(HFD组)18周,另一组饲喂正常饲料(NCD组,即对照组)18周。以编码腺苷酰硫酸还原酶α亚基的基因(aprA)作为分子标记,通过荧光定量PCR的方法检测两组大鼠在0、8和18周,肠道内SRB的数量变化;同时,以16S rRNA基因作为标记基因定量大鼠肠道内总菌的数量,以计算肠道内SRB在总菌中的比例变化。结果分组饲喂8周后,高脂饲料饲喂组大鼠的体重与正常饲料组相比显著升高。对SRB的定量结果显示,饲喂8周和18周,高脂饲料组大鼠肠道内SRB的数量和含量与正常饲料组相比显著升高。结论大鼠肠道中的硫酸盐还原菌与饮食诱导的肥胖密切相关,为进一步研究SRB在肥胖及其相关代谢疾病的发生发展中的作用提供了依据。
- 冯雨佳张旭刘辰雷殷晓晨赵立平陈峰庞小燕
- 关键词:硫酸盐还原菌肥胖大鼠荧光定量PCR