丁辉
- 作品数:18 被引量:18H指数:3
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- 相关领域:生物学自动化与计算机技术文化科学更多>>
- 抗冻蛋白活性的吸附动力学模型被引量:1
- 2004年
- 根据抗冻蛋白溶液中抗冻蛋白分子与冰晶表面相互作用特点,提出抗冻蛋白与冰晶表面相互作用模型.进而,利用饱和分数与抗冻活性之间的关系,给出抗冻活性与抗冻蛋白浓度的理论关系.根据此关系做出了与实验数据符合较好的抗冻活性与抗冻蛋白浓度关系的理论曲线.另外,对抗冻蛋白分子与冰晶表面相互作用的特点作了进一步的讨论.
- 丁辉李前忠
- 关键词:抗冻蛋白抗冻活性
- 基于基因对的模型训练方法、装置、设备及存储介质
- 本发明提供一种基于基因对的模型训练方法、装置、设备及存储介质,涉及基因对识别技术领域。具体实现方案包括:获取并处理训练样本集;处理是指将训练样本集的多个训练样本由基因表达矩阵格式处理为包括每对逆转基因对的表达模式所对应编...
- 丁辉谢雪琴林昊邓科君
- λ噬菌体溶源/裂解转换调控与定态熵
- 2012年
- 被λ噬菌体感染的大肠杆菌是研究生物基因调控网络的重要模板之一.根据该调控系统操纵子与调控蛋白相互作用特点,利用热力学配分函数描述调控蛋白与操纵子的结合概率,在给出该调控系统的动力学分岔的基础上,计算系统各定态的热力学熵.结果显示,溶源态和裂解态较鞍点和分岔点具有更低的熵值,且溶源态的熵最低,说明处于溶源态的系统具有更高的生物序.
- 冯维丁辉林昊罗辽复
- 关键词:Λ噬菌体分岔
- 神经网络模型训练方法、装置、电子设备及存储介质
- 本公开提供了一种神经网络模型训练方法、装置、电子设备及存储介质,涉及生物信息技术领域。具体为:获取数据集,该数据集中的数据为包含Kcr位点的蛋白质序列数据;根据数据集基于初始模型,得到具有识别蛋白质序列中的Kcr位点的功...
- 邓科君林昊张洪旗吕昊丁辉
- 一种基于分子指纹和机器学习的抗糖尿病药物预测方法
- 一种基于分子指纹和机器学习的抗糖尿病药物预测方法,为解决抗糖尿病药物研发过程中药物的开发成本高,耗时长的问题。先将每种药物样本转换为不同类型的分子指纹并集成,得到多个分子指纹组合;用最小冗余最大相关算法获取每种分子指纹组...
- 邓科君刘晓薇林昊丁辉
- 基于半监督学习的单细胞三维基因组数据分析方法
- 本申请提供一种基于半监督学习的单细胞三维基因组数据分析方法,涉及生物信息技术领域,该方法包括:获取第一scH i‑C数据集和第二scH i‑C数据集;第一scH i‑C数据为标注有细胞类型标签的scH i‑C数据;第二s...
- 吕昊 刀福英林昊丁辉
- 神经网络模型训练方法、装置、电子设备及存储介质
- 本公开提供了一种经网络模型训练方法、装置、电子设备及存储介质,涉及生物信息技术领域。具体实现方案包括:获取数据集,数据集中的数据包括药物靶标蛋白质序列数据和非药物靶标蛋白质序列数据;根据数据集基于初始集成学习模型,得到具...
- 邓科君张洪旗林昊吕昊丁辉
- 细菌σ^(54)启动子序列分析与预测被引量:3
- 2015年
- 对实验确定的168条σ54启动子序列进行保守性分析,获得两个保守的区域-24区域和-12区域,均为最保守的功能元件。选取保守性最大的17个保守位点的三联体频数作为参数,引入伪计数构建位置权重矩阵,对168条σ54启动子进行预测,分别从编码区和汇聚非编码区共选取168条序列组成阴性集。使用Jackknife交叉验证法对模型进行检验,整体准确度达到82.0%,为σ54启动子的理论和实验研究提供新信息。
- 丁辉邓恩泽陈伟林昊
- 关键词:细菌保守性位置权重矩阵启动子
- 基于基因对的模型训练方法、装置、设备及存储介质
- 本发明提供一种基于基因对的模型训练方法、装置、设备及存储介质,涉及基因对识别技术领域。具体实现方案包括:获取并处理训练样本集;处理是指将训练样本集的多个训练样本由基因表达矩阵格式处理为包括每对逆转基因对的表达模式所对应编...
- 丁辉谢雪琴林昊邓科君
- DNA拓扑异构酶Ⅱ的多态转换模型
- 2011年
- DNA拓扑异构酶Ⅱ是一种分子马达,它利用ATP水解产生的化学能,切断一条双链DNA片段(G segment),并让另一条双链DNA片段(T segment)从缺口处通过。对DNA拓扑异构酶Ⅱ的工作循环研究将有助于阐明其工作机理。本文根据已有实验资料,利用主方程方法构建了DNA拓扑异构酶Ⅱ状态转变的随机跃迁模型,求得系统各态的稳态解。进而推导出稳态下无机磷(Pi)浓度随时间的变化,得到DNA拓扑异构酶Ⅱ的最小工作周期约为0.78秒,该结果同实验获得的DNA拓扑异构酶Ⅱ工作周期为0.5~1秒一致。该模型定量地分析了DNA拓扑异构酶Ⅱ的动力学行为。
- 丁辉林昊冯娟
- 关键词:主方程稳态无机磷