杨焕明 作品数:30 被引量:178 H指数:7 供职机构: 浙江大学沃森基因组科学研究院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家科技部专项基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 自动化与计算机技术 更多>>
传染性非典型肺炎患者不同病程粪便标本中SARS-CoV的分离与鉴定 2004年 目的:从粪便标本中分离并鉴定SARS-CoV. 方法:粪便浸出液接种Vero-E6细胞,盲传至出现明显的细胞病变效应(CPE),并能稳定传代.采用电镜法和RT- PCR技术鉴定细胞培养物中的SARS-CoV(本实验均在BSL-3实验室完成). 结果:大部分样本用Vero-E6细胞盲传3代后发现明显的CPE,并能稳定传代.电镜负染检查,出现CPE的细胞可查见病毒颗粒;培养物上清RT-PCR扩增均为阳性.粪便样本直接用RT-PCR检测,阳性率仅为50%,细胞培养的检出率为73%. 结论:采用细胞培养结合RT-PCR技术检测粪便标本SARS- CoV比粪便标本直接RT-PCR的阳性率高. 田薇 邓亚军 吴清发 王绪敏 杨玲 张峰 刘晨辉 包其郁 汪建 杨焕明 刘明旭关键词:传染性非典型肺炎 粪便标本 SARS-COV 冠状病毒是引起广州地区严重急性呼吸综合征(SARS)的主要病因 被引量:4 2003年 为查找引起广州地区流行的严重急性呼吸综合征(SARS)的病原体,采集患者漱口液及尸解标本,用组织培养法接种人胚肺细胞、MDCK细胞、Hep-2细胞和鸡胚分离病毒,用间接免疫荧光法检测患者恢复期血清IgG抗体,确定分离的病原是SARS的主要病因,再用套式RT-PCR、免疫电镜法鉴定病原。结果用人胚肺、Hep-2细胞在75份漱口液和3例尸解组织中分离出13株病原体,经套式RT-PCR扩增出110bp的特异产物,经测序证实为冠状病毒。制备冠状病毒的抗原,检测30份SARS病人恢复期血,其中26份血清IgG抗体阳性。同时检测30份普通发热病人血清作对照,IgG抗体全部阴性。由此证明,经组织培养分离到的病原体是引起SARS的致病因子,用分子生物学方法测序后证实为冠状病毒。 狄飚 何丽娟 周端华 高阳 吴新伟 杨卫路 王鸣 杜琳 刘宇飞 邱季春 陈小双 陈芳 张玮 鲁恩洁 杨焕明 毕胜利关键词:冠状病毒 严重急性呼吸综合征 SARS 病毒分离 逆转录-聚合酶链反应 生命的解码:DNA、“人类基因组计划”与基因组学 2006年 “我们,美国、英国、日本、德国、法国与中国的政府首脑.骄傲地向全世界宣告:我们六国的科学家已经完成了人类生命的分子指南——由30亿个碱基对组成的人类基因组的关键序列图。
——六国政府首脑《人类基因组联合宣言》 杨焕明关键词:人类基因组计划 基因组学 生命 DNA 解码 碱基对 严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒刺突蛋白基因片段的表达及其初步应用 被引量:6 2003年 SARS virus spike gene fra gment was expressed by Ecoli expr ession systemThe fragment enclose s major neutralization epitope of the virusThe expressed protein wa s purified and an ELISA method was set upBy using the recombinant,tw elve patients’ sera were detected The recombinant SARS coronavirus s pike protein offers an efficient wa y for serological diagnosis and is useful for epidemiological survey and vaccin e 伊瑶 段淑敏 张明程 周永东 高阳 杨焕明 董小平 毕胜利关键词:严重急性呼吸综合征 SARS 冠状病毒 刺突蛋白 基因片段 严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒N蛋白基因的表达及其初步应用 被引量:4 2003年 SARS coronavirus N gene w as expressed by Ecoli expression systemThe expressed protein was p urified and an ELISA method was se t up for detection of SARS virus i nfected patient’s serum antibodyT he recombinant SARS coronavirus N protein offers an efficient way fo r serological diagnosis and is use ful for epidemiological study and vaccine 张明程 段淑敏 伊瑶 周永东 高阳 杨焕明 董小平 毕胜利关键词:严重急性呼吸综合征 SARS 冠状病毒 N蛋白 基因表达 人类基因图奠定生命科学基础 2000年 被称为物理学世纪的20世纪始于人们对原子结构的认识,最为辉煌的成就是原子弹的爆炸与人类登月的成功,以最简单的无机硅制成的芯片使人类进入了信息时代。 20世纪也孕育了另一门科学——生命科学,它始于人类重新认识生命的基本规律之一的遗传规律。 杨焕明关键词:基因组计划 生命科学 SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析 被引量:23 2003年 严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病。对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定,并与其他已知病毒进行了比较分析。该病毒基因组全长为29.725kb,含11个可读框(ORFs),由1个稳定区和1个可变区组成,其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶,包括两个ORFs;可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs),分别编码病毒的4个结构蛋白(S,E,M,N蛋白)。此外,可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs)。此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致。通过与已知RNA病毒的序列比对,可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae)。与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示,已在30个核苷酸位置上检出序列差异,总体突变率为0.1%,其中15个变异位点在编码区,可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变)。S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异,而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应.与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化。进化分析表明,SARS病毒可能不是来源于人类,但没有证据证明是人为制造的。为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在,仍需进行更深入的研究。 秦鄂德 祝庆余 于曼 范宝昌 常国辉 司炳银 杨保安 彭文明 姜涛 刘伯华 邓永强 刘洪 张雨 王翠娥 李豫川 甘永华 李晓萸 吕富双 谭刚 曹务春 杨瑞馥 汪建 李蔚 徐祖元 李彦 吴清发 林伟 陈维军 唐琳 邓亚军 韩玉军 李昌峰 雷蒙 李国庆关键词:冠状病毒 基因组 系统发生学 1%人类基因组数据库系统 1%人类基因组数据库系统,以一种系统化、图形化和全面性的方式展示了我国承担的1%人类基因组计划的序列数据和相关注释信息.该数据库系统包括数据可视化模块、搜索引擎模块、数据分析模块和输入输出模块等,主要运用了oracle8... 黄小兵 董伟 王俊 杨焕明 陈峰 胡光强 康宁 段举 洪星 李涛 肖宇翔 秦海鸥关键词:基因组数据库 人类基因组计划 生物信息学 文献传递 个体基因组学——生物医学的新时代、生命伦理的新挑战 被引量:5 2009年 杨焕明关键词:生物医学 基因组学 生命伦理 生物恐怖袭击 流感病毒 基因组序列 家蚕(Bombyx mori)全基因组框架图 被引量:1 2008年 我们在此报告了家蚕(Bombyx mori)的基因组序列框架图,它覆盖了所有已知家蚕基因的90.9%。我们估计的基因数是18510,超过黑腹果蝇报道的13379个基因。我们将家蚕基因组与果蝇、蚊子、蜘蛛和蝴蝶等进行了比较分析,揭示了它们在基因组成上同时具有相似性和差异性。 夏庆友 周泽扬 鲁成 程道军 代方银 李斌 赵萍 查幸福 程廷才 柴春利 潘国庆 许金山 刘春 林英 钱吉凤 侯勇 吴正理 李关荣 潘敏慧 李春峰 沈以红 蓝希钳 袁联伟 李田 徐汉福 杨光伟 万永继 朱勇 余茂德 沈卫德 吴大洋 向仲怀 于军 王俊 王俊 李瑞强 石剑萍 李恒 李光远 苏建宁 王晓玲 李国庆 张增金 吴清发 李俊 张庆鹏 韦宁 徐建哲 孙海波 董乐 刘东源关键词:全基因组 框架图 家蚕 黑腹果蝇 基因组成