郭政 作品数:143 被引量:277 H指数:8 供职机构: 哈尔滨工业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 黑龙江省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 自动化与计算机技术 电子电信 更多>>
受累亲属对连锁分析 被引量:1 1994年 受累亲属对连锁分析郭政,何颖受累亲属对连锁分析是通过受累亲属标记位点的基因分布来检验标记等位基因与致病基因的分离是否独立,从而推断两者是否连锁的一种统计方法。若标记等位基因与致病基因的分离不独立,则这一结论就提供了两者遗传位点连锁的一种依据。同目前常... 郭政 何颖关键词:基因连锁 致病基因 细胞遗传学 全文增补中 微阵列数据揭示基因在癌样本中广泛表达 2012年 癌的发生与发展过程涉及大量基因的异常表达。在目前基因表达谱分析中采用的标准化方法通常假设在疾病中差异表达的基因的比例很小并且差异上、下调的比例大致相等。这个被研究者所广泛采用的标准化的前提假设尚未被充分地论证过。通过分析胰腺癌的两套表达谱数据,我们发现在胰腺癌样本中基因表达的中值显著高于正常样本,提示传统的标准化假设并不适用于胰腺癌表达谱数据。采用标准化数据会导致错误地判断大量的差异下调的基因并失查许多差异上调的基因。采用原始数据分析发现在胰腺癌中的基因表达有广泛上调的特征,为深入研究胰腺癌的发生和发展机制提供了新线索。 王栋 黄燕 程立新 李朋飞 顾云燕 吴瑞红 王明月 李宾 王晨光 郭政关键词:胰腺癌 微阵列 利用癌功能类从癌基因组突变谱中识别癌基因 2008年 从大规模癌样本基因突变扫查数据中识别癌基因具有重要的意义.一些重要功能的改变对于癌的发生发展是必需的,因此将它们定义为癌功能类,并从GO(Gene Ontology)中选择一组显著富集已知癌基因的细致功能类来代表它们.为了评价以癌相关功能类作为特征识别癌基因的效果,将已知的蛋白激酶癌基因定义为阳性金标准,而将其他的蛋白激酶基因定义为阴性金标准.结果表明,与利用选择压力作为特征的方法比较,利用癌相关功能类作为特征的方法可以更有效地识别癌基因.进一步结合癌相关功能类与基因非同义突变个数可以产生更可靠的预测结果.最后,将46个注释到癌相关功能类并且其非同义突变个数至少为3的蛋白激酶基因预测为癌基因,预测精确率达到0.42. 李彦辉 郭政 彭春芳 刘庆 马文财 王靖 姚晨 张敏 朱晶关键词:突变谱 癌基因 GENE ONTOLOGY 蛋白质功能 根据基因表达谱筛选间接互作蛋白质进行蛋白质功能预测 2006年 利用基因表达谱数据,通过计算互作蛋白质的表达相关系数,来筛选、优化蛋白质互作网络。结果显示,利用经过筛选的互作数据,根据邻居计数法和卡方法进行功能预测的预测效果明显提高,距离待测蛋白质较远的邻居也包含着与待测蛋白质功能一致的信息。 高磊 朱明珠 郭政 李霞关键词:基因表达谱 基因功能 按一级吸收(一级并行)米氏过程消除药物的给药方案评价 2000年 讨论了消除符合( 一级并行) 米氏过程药物的多剂量血管外给药方案的评价方法。应用研制的给药方案设计与评价计算机分析系统。 王秋红 李晶 郭政关键词:药物动力学 给药方案 米氏消除 苯妥英钠 一种基于移动稍带的5G物联网络架构及其数据传输方法 本发明提出了一种基于移动稍带的5G广域物联网络架构及其数据传输方法,所述架构包括:地面终端,移动转发节点,网络接入节点和核心网;终端通过低功耗无线接口与转发节点相连,转发节点通过高速无线链路连接网络接入节点,接入节点通过... 孟维晓 李阳 何晨光 郭政 张海英 闫富朝利用GeneHub软件多角度分析基因功能相关与表达相关的联系 被引量:2 2006年 我们研制的GeneHub软件可以用来评价基因功能分类体系中各个功能单元的表达相关性的显著性,从而筛选与实验条件相关的功能单元。采用不同的相似性测度与不同的数据集,使用GeneHub研究了分别按染色体定位、蛋白质细胞位置与互作、代谢通路、信号传导通路等五个方面分类的基因的表达相关性,结果显示按照这些不同的方面分类的基因显著共表达,并且这种共表达现象往往受相关实验条件影响。为基因表达谱分析中广泛采用的假设“功能相关的基因表达相关”提供了进一步的实验证据。 王晨光 郭政 李霞 余辉 徐建震关键词:基因芯片 基因表达 基因功能 数据库 遗传病复发风险估计的计算机方法 1997年 本文介绍单基因遗传病复发风险分析计算机方法并给出了应用例子。程序使用方便,是遗传咨询的一个有用的辅助工具。 郭政 王宏志 刘权章 刘捷关键词:遗传病 复发风险 计算机 决策森林分析大型IBD谱定位酒精依赖症相关基因(英文) 2006年 Objective: To extract the relevant SNPs for alcoholism using sib-pair IBD profiles of pedigrees.Methods: We used the ensemble decision approach, a supervised learning approach based on decision forests, to locate alcoholism relevant SNPs using genome-wide SNP data. Results: Application to a publicly available large dataset of 100 simulated replicates for three American populations (http://www.gaworkshop.org/) demonstrates that the proposed approach has successfully located all of the simulated true loci.Conclusion: The numerical results establish the proposed decision forest analysis to be a powerful and practical alternative for large-scale family-based association study. 李霞 饶绍奇 张薇 郭政 姜伟 杜磊关键词:单核苷酸 酒精中毒 医学信息学 系谱 酒精依赖症 基于蛋白质互作评价差异表达基因的重复性 被引量:2 2011年 利用高通量基因表达谱数据可以识别在肿瘤与正常组织中差异表达的基因,为研究癌机理提供重要的线索。目前,在研究同种癌型的不同实验中发现的差异表达基因的交叠比例很低。这种高通量基因表达谱数据低重复性的现象严重制约了基因芯片在癌症研究中的应用。然而,已有研究表明从研究同种癌型的不同实验数据中得到的不交叠的差异表达基因倾向于扰动相同的功能。因此,在评价差异表达基因重复性时,应考虑其在生物学功能上的一致性。本文结合基因共表达和蛋白质互作关系,设计了功能重复性指标来评价差异表达基因列表的可重复性。通过分析两套卵巢癌数据,发现对同种癌型得到的差异表达基因具有很高的功能一致性(p<0.0001)。结果表明,在功能水平上评估差异表达基因的一致性具有合理性。 任丽萍 章琳 洪贵妮 郭政关键词:差异表达基因 共表达