杨彩虹
- 作品数:8 被引量:19H指数:2
- 供职机构:石河子大学动物科技学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学轻工技术与工程更多>>
- 应用高分辨率溶解曲线(HRM)及DNA测序检测结核分枝杆菌链霉素耐药性的初步研究
- <正>引言临床常用的耐药结核检测方法是结核菌培养药敏实验(DST),但由于其检测时间长及操作复杂等不能满足临床需要,而高分辨率溶解曲线(HRM)技术是一种新的,基于基因突变的快速检测方法。因此,评价高分辩率溶解曲线(HR...
- 杨彩虹杨敏曹旭东陈创夫
- 关键词:链霉素耐药性结核分枝杆菌HRMDNA
- 文献传递
- 一种用于结核杆菌链霉素耐药快速检测引物及其试剂盒
- 本发明公开了一种用于结核杆菌链霉素耐药快速检测引物,所述引物包括如下引物的至少一组:RpslForward:5’—CCAACCATCCAGCAGCTGGT—3’RpslReverse:5’—ATCCAGCGAACCGCG...
- 曹旭东杨彩虹陈创夫于潞杨敏袁俐
- 文献传递
- 结核分枝杆菌临床分离株链霉素耐药性的检测及耐药基因突变位点分析被引量:6
- 2017年
- 为检测结核分枝杆菌链霉素(streptomycin,SM)耐药性,分析耐药基因突变,探讨DNA测序分析技术在结核分枝杆菌链霉素耐药性检测中的应用价值。采用方法:1、用传统的比例法药敏试验对49株结核分枝杆菌临床分离株进行链霉素耐药性检测。2、用DNA测序分析技术对49株结核分枝杆菌临床分离株进行链霉素耐药相关基因Rpsl和rrs的突变位点分析,筛查耐药相关突变位点。3、探讨DNA测序分析技术对结核分枝杆菌临床分离株进行链霉素耐药性检测的效率。结果:1、传统比例法药敏试验结果显示,49株实验菌株中16株为链霉素耐药株,33株为链霉素敏感株。2、Rpsl基因DNA测序。结果显示:Rpsl基因只存在一个突变位点,为第43位密码子AAG的突变,突变形式为AAG→AGG,氨基酸由赖氨酸(Lys)变为精氨酸(Arg)。rrs基因DNA测序结果发现:rrs基因共存在5个突变位点,分别为第513位碱基A突变为G、第523位碱基A缺失、第598位碱基A突变为G、第599位碱基A缺失、第612位碱基A缺失,其中第513位碱基突变只存在于链霉素耐药株中,其余4个突变位点在耐药株和敏感株中均存在。即初步认为Rpsl基因第43位密码子的突变及rrs基因第513位碱基的突变与结核分枝杆菌链霉素耐药性有关。3、分析Rpsl基因和rrs基因突变与结核分枝杆菌链霉素耐药性之间的关系,结果显示:16株链霉素耐药株中13株存在Rpsl基因第43位密码子的突变,1株存在rrs基因第513位碱基的突变。以传统的比例法药敏结果为参照,以DNA测序分析Rpsl基因或rrs基因发现Ppsl基因发生第43位密码子或rrs基因第513位碱基突变为判断菌株耐药的标准,DNA测序分析技术对结核分枝杆菌链霉素耐药性检测的敏感性为87.5%,特异性为96.97%。由此可知,初步认为Rpsl基因第43位密码子的突变及rrs基因第513位碱基的突变与结核分枝杆菌链霉素耐药性有关。用DNA测序分析结核分�
- 杨彩虹曹旭东史静雪姬祥于璐袁俐吴长新陈创夫
- 关键词:结核分枝杆菌链霉素DNA测序耐药性
- 一种用于结核杆菌利福平耐药快速检测的引物及其试剂盒
- 本发明公开了一种用于结核杆菌利福平耐药快速检测引物及其试剂盒,所述引物包括如下引物的至少一组:第一组:rpoBForwarD:CGCCGCGATCAAGGAGTTC?rpoBReverse:GCCCGGCACGCTCAT...
- 陈创夫曹旭东杨敏袁俐于潞杨彩虹张辉包海洋吴长新
- 文献传递
- 一种用于结核杆菌异烟肼耐药性快速检测的引物及其试剂盒
- 本发明公开了一种用于结核杆菌异烟肼耐药性快速检测引物及其试剂盒,所述引物包括如下引物的至少一组:第一组:katG Forward:5’—TCGTATGGCACCGGAACC—3’ katG Reverse:5’—CAGC...
- 曹旭东杨敏杨彩虹于潞陈创夫袁俐吴长新
- 文献传递
- 应用高分辨率溶解曲线(HRM)及DNA测序检测结核分枝杆菌链霉素耐药性的初步研究
- 杨彩虹杨敏曹旭东陈创夫
- 结核分支杆菌Ag85家族蛋白的原核表达及免疫反应性的初步探究
- 通过原核表达系统获得结核分枝杆菌Ag85家族(Ag85A、Ag85B、Ag85C)蛋白并评价该家族蛋白在血清诊断学上的免疫反应性,筛选出灵敏性特异性较好的抗原为结核病的诊断提供参考依据。Ag85家族蛋白是结核分枝杆菌分泌...
- 姬祥杨彩虹何金科马旭升徐锦凤童志霞曹旭东陈创夫
- 关键词:结核分支杆菌原核表达免疫反应性
- 高分辨率熔解曲线技术用于结核分枝杆菌临床分离株异烟肼耐药性的快速检测被引量:13
- 2017年
- 目的评价高分辨率熔解曲线分析技术(high-resolution melting curve,HRM)检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性的应用价值。方法 1)通过传统比例法药敏实验对本实验室保存的49株结核分枝杆菌进行异烟肼耐药性分析。2)进一步对该结核分枝杆菌进行异烟肼耐药相关基因KatG基因和inhA基因进行异烟肼耐药决定区测序分析,筛查突变位点。3)根据筛查到的突变位点设计高分辨率熔解曲线分析所用的特异性引物,对异烟肼耐药基因耐药决定区进行高分辨率熔解曲线分析检测DNA突变,评估用高分辨率熔解曲线分析技术对结核分枝杆菌异烟肼耐药性检测的效率。结果 1)比例法药敏结果显示,49株实验菌株中20株为异烟肼耐药株,29株为异烟肼敏感株。2)测序分析结果显示:(1)KatG基因出现了4种突变形式,分别是234单位点突变;234、315双位点突变;234、463双位点突变;234、315、463三位点联合突变。(2)inhA基因检测到3种突变,即-8位、-15位、-152位。3)(1)对耐药株的基因突变进行分析发现:20株异烟肼耐药株中11株存在KatG基因第315位密码子的突变、占异烟肼耐药株的55%;6株存在inhA基因-15(4株)位碱基、-8(1株)位碱基、-152(1株)位碱基的突变,共占异烟肼耐药株的30%;2株同时存在基因KatG315密码子和inhA-15位碱基的突变,占异烟肼耐药株的10%;1株均未检测到KatG基因和inhA基因的突变,占异烟肼耐药株的5%。通过基因突变检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性的敏感性为95%、特异性为100%。(2)用高分辨率溶解曲线检测实验菌株耐药基因突变的结果显示,18株存在基因突变,24株不存在基因突变,检测的灵敏度为94.7%、特异性为80%。(3)以高分辨率熔解曲线检测到突变为耐药的判断标准,检出19株为耐药株,24株为敏感株。以比例法药敏结果为参照,检测的灵敏度为95%、特异性为82.76%。结论高分辨率溶解曲线用于结核分枝杆菌
- 杨彩虹杨敏于璐包海洋吴长新曹旭东陈创夫
- 关键词:结核分枝杆菌DNA测序耐药性异烟肼