彭赟
- 作品数:4 被引量:20H指数:2
- 供职机构:海南大学农学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 香蕉miRNA及其靶基因的生物信息学预测被引量:1
- 2016年
- 利用生物信息学方法预测香蕉中的miRNA,即通过将miRBase数据库中的已知植物的miRNA与香蕉EST和GSS数据库进行BLAST比对搜索,筛选出潜在的miRNA,最后得到16条香蕉miRNA,分属于9个miRNA家族,其中3条来源于EST数据库,13条来源于GSS数据库,并利用在线软件psRNATarget预测其靶基因,共得到168个靶基因,分别编码多种功能蛋白,参与各生物学过程。
- 彭赟龙海飞贺瑞徐敏曾灿彬骆娟齐钊闫臻阮云泽何朝族汤华
- 关键词:香蕉MICRORNA靶基因生物信息学分析
- 香蕉在枯萎病诱导下microRNA的差异表达研究
- miRNA(microRNA)是一类非编码的单链小分子RNA,约18-25nt长度,主要对靶基因进行转录后调控。miRNA的表达比编码基因更加迅速,翻译过程不受影响,对目标基因的调控效率较高,在植物的生长发育、逆境胁迫、...
- 彭赟
- 关键词:香蕉枯萎病MICRORNA靶基因
- 文献传递
- 低氮胁迫下香蕉硝酸盐转运蛋白MaNRT2基因的克隆与表达分析被引量:2
- 2016年
- 氮素是植物生长发育所必需的大量元素,也是限制植物产量的首要因素,硝酸盐转运蛋白NRT是植物吸收和利用氮素的重要蛋白。笔者以香蕉为实验材料,通过RNA-Seq测序,筛选得到一个显著差异表达的高亲和硝酸盐转运蛋白基因NRT2;通过PCR克隆获得1 509 bp的c DNA序列,生物信息学预测其编码502氨基酸,含有MFS结构域,属于NRT2基因家族,命名为MaNRT2;RNA-Seq和qRT-PCR的结果显示,MaNRT2基因的表达具有显著的组织特异性,在根中远高于叶片;低氮胁迫处理后,MaNRT2在叶片中表达量上升,在根中表达量反而下降,表明MaNRT2与香蕉氮元素的吸收转运密切相关。
- 贺瑞彭赟刘扬曾灿彬徐敏齐钊闫臻骆娟阮云泽何朝族汤华
- 关键词:香蕉低氮胁迫转录组测序基因表达分析
- 基于ISSR标记的海南油茶种质资源遗传多样性分析被引量:17
- 2016年
- 油茶是世界四大木本油料之一,在中国广泛种植。中国油茶种质资源极为丰富,不同地区油茶存在遗传上的显著多样性。为了掌握油茶资源的遗传多样性,本研究运用ISSR分子标记技术,对来自海南、广西、江西共55份油茶资源进行多态性和聚类分析,分析各品种资源间的遗传关系。研究结果表明:(1)从100条ISSR引物中筛选出13条引物进行PCR扩增,共扩增出110条DNA条带,多态性条带107条,多态率达97.3%。(2)当相似系数为0.612时,广西(5株),江西(4株)油茶品种与海南品种(46株)具有遗传的亲缘关系,但是有较大的遗传差异性。(3)海南品种油茶在亲缘系数为0.676时可分为7个居群,但主要是澄迈、省农科院、琼海聚类的居群占优,说明海南种虽然亲缘性较高,但仍有地区的差异性。
- 刘扬彭赟贺瑞李连胜唐光华王辰尧徐敏曾灿彬汤华
- 关键词:油茶ISSR分子标记