季芸 作品数:28 被引量:185 H指数:9 供职机构: 上海市血液中心 更多>> 发文基金: 上海市卫生局资助项目 上海市卫生局科技发展基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
PCR-SBT法HLA基因分型模棱两可结果的判读及解决对策 2009年 目的研究PCR-SBT法HLA基因分型结果判读中出现的模棱两可问题并提出解决策略。方法对306名随机抽取的组织配型患者的DNA采用PCR-序列特异性引物(Sequence Specific Primer,SSP)低分辨方法检测,同时采用PCR-SBT法进行HLA-A,B,DRB1高分辨基因分型。PCR-SBT法模棱两可结果用PCR-SSP高分辨方法复核确认。结果所有306例检测标本的高低分辨血清学抗原一致,经PCR-SBT基因测序方法检测有111份模棱两可结果,占36.3%(111/306)。其中HLA-A座位有30对等位基因存在模棱两可结果,占所有检测标本等位基因总数的3.3%;HLA-B座位有66对,占7.2%;HLA-DRB1座位有36对,占3.9%。所有模棱两可标本经PCR-SSP HLA基因高分辨分型试剂PCR-SSP等方法复核确认。结论针对PCR-SBT法进行HLA-A,B,DRB1高分辨基因分型模棱两可结果所建立的解决策略,对于提高HLA数据分型的速度和分型准确性有重要意义。 刘嬿 季芸 孙瑛 杨剑豪 毛臻 杜可明关键词:人类白细胞抗原 推荐HL-A、B特异性指定的复核表 2004年 张工梁 嵇月华 季芸 杨剑豪 谢军华 郭晓俊 孙继丽 傅敏 杨颖关键词:HLA-A HLA-B 特异性抗原 人类白细胞抗原 血清学检测 PCR-SSP在HLA低分辨中常见问题及解决措施 被引量:4 2007年 目的探讨PCR-SSP在HLA低分辨分型中常见问题的原因,提出解决的措施。方法应用盐析法提取基因组DNA,用PCR-SSP法对参加造血干细胞资料库志愿者的血样进行HLA分型,琼脂糖凝胶电泳后紫外光灯下分析判读,并进行统计学分析。结果在4800份血样标本中,4187份标本能够准确判读出结果,检出率为87.2%,其余613份样本无法判读出确定的基因型。在这613份血样标本中所遇到的问题包括有漏检占41.9%(其中单孔漏检多达90.2%);假阳性及非特异性所占比例也较大,为29.2%;模棱两可的结果所占比例为23.2%;人为因素影响分析的占4.4%;仪器因素影响分析的占1.3%。结论SSP法用于HLA分型时,有99.5%问题可找到其原因所在,并通过相应的方法加以解决。 孙瑛 傅敏 金晔 谢军华 季芸 杨剑豪 杜可明关键词:HLA PCR-SSP 假阳性 HLA-B40组等位基因多态性和血清学分型不明确标本分析 被引量:4 2002年 目的 利用DNA分型技术调查上海汉族人群HLA-B40组等位基因多态性并比较配型标本中HLA-B40抗原血清学和DNA分型的结果。方法 采用反向PCR-SSOP技术进行DNA分型,可检出HLA-B*4001-4011等11个等位基因。结果所有样本DNA分型均获成功,无假阳性和假阴性结果出现。质控DNA分型结果与UCLA结果相符。上海地区汉族人群共检出B*4001-4003、4005-400、4011等等位基因,未检出B*4004、4008-4010等等位基因。296名无关个体中HLA-B40*组等位基因频率为0.140 2。血清学方法检测HLA-B40组抗原错误率为12.82%(10/78)。结论 该技术用于HLA-B40分型分辨率高,分型结果较血清学方法更加精确,可确保HLA分型的准确。 冯明亮 马俊 季芸 陆琼 稽月华 杨颖关键词:DNA分型 血清学分型 基因多态性 等位基因 广东汉族人群MICA和MICB微卫星多态性分布 被引量:5 2004年 目的 调查广东地区汉族人群 MICA基因第 5外显子和 MICB基因第 1内含子微卫星多态性分布。方法 应用聚合酶链反应和荧光 ( 6 - FAM)自动化检测技术 ,对广东地区共 10 6名无亲缘关系样本进行 MICA和 MICB微卫星基因分型 ,并计算这两个微卫星的基因频率、基因型频率、个体鉴别力、期望杂合性、多态性信息含量和非父排除率。结果 MICA和 MICB微卫星基因型分布符合 Hardy- Weinberg平衡。MICA A5基因频率最高为 0 .2 877,A4基因频率则最低为 0 .132 1;A5 - 5 .1( 14 .15 % )和 A5 - 5 ( 10 .38% )基因型分布频率较高。 MICB CA14等位基因频率最高为 0 .32 5 5 ,CA19、CA2 8等位基因频率最低为0 .0 0 4 7,未检出 CA2 7。 CA14 - CA14 ( 14 .15 % )基因型分布频率较高。结论 MICA基因第 5外显子和MICB基因第 1内含子微卫星适合作为中国人群的遗传标志 ,用于人类学、遗传疾病基因连锁分析。 冯明亮 张景怡 谢军华 季芸 陆琼 陈亮 杨剑豪 郭晓俊关键词:汉族人群 MICA基因 微卫星 中国南方汉族人群MICA和MICB微卫星和HLA-B基因座单体型研究 利用聚合酶链反应和荧光(6-FAM)自动化检测技术对中国南方汉族无亲缘关系样本进行MICA基因外显子5和 MICB基因内含子1微卫星基因座和HLA-B多态性及其单体型分布调查。根据群体资料估算两者间的单体型频率、连锁不平... 冯明亮 张景怡 谢军华 陈亮 陆琼 郭晓俊 杨剑豪 季芸文献传递 HLA-A,B,DRB1单体型频率计算及其在骨髓库中的应用 被引量:20 2005年 目的从群体资料计算HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,并用于骨髓库寻找HLA匹配供者。方法根据HLA表型群体资料,使用最大数学预期值算法(ExpectationMaximization,EM)计算HLA三座位单体型频率。通过实例运算介绍HLA表型频率以及发现HLA匹配无关供者的概率。结果①使用DNA基因分型技术鉴定12193例无关汉族健康个体HLA表型,计算求得HLAA,B,DRB1单体型频率。②预期概率与观察结果吻合,并用于评估骨髓库的最适大小。结论使用EM算法估计大样本汉族群体HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,结果可靠,可用于评估骨髓库的最适大小和组份。 孙继丽 杜可明 傅敏 季芸 谢军华 孙瑛 金晔 杨剑豪 稽月华 刘达庄 钱开诚 赵桐茂关键词:EM算法 中华(上海)骨髓库的HLA分布报告 被引量:38 2001年 目的 报告中华 (上海 )骨髓库中HLA血型资料 ,了解中国人群HLA分布特点。方法 用微量淋巴细胞毒试验检测 11995名志愿者的HLA A、B抗原 ,并用序列特异引物聚合酶链反应(PCR SSP)进行DNA水平的质控和对有疑问结果作复查。结果 共检出A座位特异性 2 5种 ,B座位抗原特异性 5 2种 ,有显著意义的连锁不平衡单型有 6 2种 ,其中以A2 B46、A30 B13、A33 B5 8、A11.1 B6 0、A2 4 B6 2、A2 4 B6 0等为最常见 ;检索HLA A、B、DR抗原 (基因 )匹配志愿者的“命中率”约为 1‰。结论 中国人群HLA分布有自身特点 ,而现有骨髓库HLA A、B基因的遗传特征介于南、北方汉族之间 。 张工梁 杨颖 冯喆 张雁征 冯明亮 嵇月华 陆琼 马俊 季芸 毛昕 张钦辉 杨钧仪 张瑾 袁惠章关键词:骨髓 HLA抗原 基因频率 数据收集 慢性粒细胞白血病和HLA基因的关联性研究 目的探讨慢性粒细胞白血病与HLA等位基因多态性的遗传相关性。方法采用PCR-SSOP分型技术对266 位慢粒病人进行HLA-A,B,DRB1基因分型,并以9996位上海骨髓库志愿捐献造血干细胞的健康供者作为对照,对 2组... 季芸 杨剑豪 傅敏 杜可明 孙瑛 孙继丽 金晔 谢军华 嵇月华 张铮 毛臻文献传递 PCR-SSP在HLA低分辨中常见问题及解决措施 目的探讨PCR-SSP在HLA低分辨分型中常见问题的原因,提出解决的措施。方法应用盐析法提取基因组 DNA,用PCR-SSP法试剂盒对参加造血干细胞资料库志愿者的血样进行HLA分型,琼脂糖凝胶电泳后紫外光灯下分析判读,并... 孙瑛 杜可明 傅敏 金晔 谢军华 季芸 张铮 杨剑豪 孙继丽 嵇月华 毛臻文献传递