谢军华
- 作品数：17 被引量：121H指数：7
- 供职机构：上海市血液中心更多>>
- 发文基金：上海市卫生局资助项目上海市公共卫生重点学科建设项目上海市卫生局科研基金更多>>
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- 中国南方汉族人群MICA-TM基因座等位基因分布被引量：5
- 2004年
- 目的 调查中国南方汉族人群 MICA基因穿膜区 ( TM)基因座多态性分布。方法 应用聚合酶链反应和荧光( 6-FAM)自动化技术 ,对中国南方地区 1 0 6例无亲缘关系汉族人群样本检测 MICA-TM,计算基因频率、基因型频率、个体鉴别力、期望杂合性、多态性信息含量和非父排除率。结果 MICA-TM基因型分布符合 Hardy-Weinberg平衡 ,共检出MICA-TM5个等位基因 ,即 A4、A5、A5 .1、A6和 A9;MICA-TM A5基因频率 ( 0 .2 877)最高 ,A4基因频率 ( 0 .1 3 2 1 )最低 ;A5 -5 .1和 A5 -5基因型分布频率分别为 1 4.1 5 %和 1 0 .3 8%。结论 MICA-TM基因座适合作为中国人群的遗传标志 ,可用于人类学、遗传病的基因连锁分析。
- 马庆陈亮郭晓俊谢军华陆琼张景怡冯明亮
- 关键词：基因座
- 推荐HL-A、B特异性指定的复核表
- 2004年
- 张工梁嵇月华季芸杨剑豪谢军华郭晓俊孙继丽傅敏杨颖
- 关键词：HLA-AHLA-B特异性抗原人类白细胞抗原血清学检测
- 20596名汉族造血干细胞供者HLA多态性统计学分析被引量：20
- 2006年
- 目的了解中国汉族人群中HLA-A,B,DRB1基因和单体型频率分布特征。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物和序列特异性寡核苷酸探针技术,对20596名健康汉族无关供者进行HLA基因分型,并翻译为相应的抗原特异性;采用最大数学预期值算法(expectation-maximization,EM)计算HLA基因和单体型频率,并统计相关的遗传参数。结果20596名汉族无关供者中,频率>0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A2、A11、A24,B46、B13、B60,DR9、DR12、DR4、DR15;频率>0.05的A-B、B-DRB1单体型为A2-B46、A33-B58、A30-B13、B46-DR9、B13-DR7,频率>0.03的A-B-DRB1单体型为A30-B13-DR7、A2-B46-DR9、A33-B58-DR17;频率>7.27×10-5的有意义两座位单体型中,A30-B13、A69-B52、A33-B58、B8-DR17连锁不平衡强度最高(RLD>0.8)。结论中国汉族人群HLA基因和单体型多态性较为丰富,其频率分布数据和相关遗传参数为临床移植供者的选择、资料库志愿者招募策略的制定提供了重要参考。
- 孙继丽杜可明傅敏孙瑛金晔谢军华季芸杨健豪稽月华张铮毛臻刘达庄钱开诚
- 关键词：汉族人群基因频率单体型频率PCR-SSOP
- 4082名上海骨髓库汉族无关供者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究被引量：12
- 2012年
- 目的了解上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1在高分辨分型水平上的等位基因及单体型频率分布特征。方法采用PCR-测序分型技术(Sequence-based typing,SBT)对4 082名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库上海分库汉族造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型频率。结果 4 082例样本中,共观察到204个HLA等位基因,其中频率>0.1的HLA-A、B、DRB1等位基因分别有A*11∶01、A*24∶02、A*02∶01、B*46∶01、DRB1*09∶01、DRB1*15∶01。841条A-B单体型中,70条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),8条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),17条单体型的频率高于0.01;1 027条B-DRB1单体型中,99条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),12条单体型的频率高于0.01;3 344条A-B-DRB1单体型中,681条单体型是"可靠的"(频率≥3.67×10-4),单体型频率高于0.001有135条。结论获得上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,为临床移植供者的选择、中国人群CWD表的制订、骨髓库最适库容的评估及人类遗传学研究提供参考数据。
- 杨剑豪刘嬿郑皆炜谢军华孙瑛姜跃琴唐晴钧杜可明
- 关键词：HLA-ADRB1等位基因频率单体型频率
- HLA-A,B,DRB1单体型频率计算及其在骨髓库中的应用被引量：20
- 2005年
- 目的从群体资料计算HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,并用于骨髓库寻找HLA匹配供者。方法根据HLA表型群体资料,使用最大数学预期值算法(ExpectationMaximization,EM)计算HLA三座位单体型频率。通过实例运算介绍HLA表型频率以及发现HLA匹配无关供者的概率。结果①使用DNA基因分型技术鉴定12193例无关汉族健康个体HLA表型,计算求得HLAA,B,DRB1单体型频率。②预期概率与观察结果吻合,并用于评估骨髓库的最适大小。结论使用EM算法估计大样本汉族群体HLAA,B,DRB1三座位单体型频率,结果可靠,可用于评估骨髓库的最适大小和组份。
- 孙继丽杜可明傅敏季芸谢军华孙瑛金晔杨剑豪稽月华刘达庄钱开诚赵桐茂
- 关键词：EM算法
- HLA单链分型技术在高分辨检测工作中的初步应用
- 2012年
- 目的探讨HLA单链分型技术在高分辨检测工作中的初步应用。方法对上海地区960份自愿加入中华骨髓库的志愿者血液标本,首先确认每个等位基因的血清型表达;依据蛋白表达的组特异性原理,选择组特异性引物通过HLA单链分型技术,在ABI3730xlDNA测序仪上进行DNA分型测序:其中HLAⅠ类基因对第2,3和4外显子单链单向测序,Ⅱ类基因对第2外显子单链双向测序,以得HLA高分辨分型结果;对部分区分位置在其他区域的标本,则加测2,3,4以外的外显子进行最终确认;对于呈现模棱两可高分辨结果标本,参考HLA国际命名委员会所列G组归类;无法G组归类的以CODE码表示。
- 刘嬿杨剑豪郑皆炜谢军华孙瑛杜可明
- 关键词：分型技术HLA中华骨髓库血清型
- 江浙沪汉族人群HLA-DRB1基因座遗传特征及不同人群频率分布比较被引量：10
- 2003年
- 目的 调查江浙沪汉族人群 HL A- DRB1基因座的遗传多态性 ,分析不同人群 H L A- DRB1基因频率分布特征。方法 利用聚合酶链反应 -序列特异寡核苷酸探针反向杂交和聚合酶链反应 -序列特异引物技术对江浙沪地区 6 2 6名健康无关汉族人进行 H L A- DRB1基因分型 ,可检出 DRB1* 0 10 1- 10 0 1,DRB3,DRB4 ,DRB5等等位基因 ,计算 HL A- DRB1等位基因频率并与不同人群 H L A- DRB1基因的多态性进行比较。结果 在江浙沪汉族人群中检出 HL A- DRB1* 0 10 1、 0 30 1、 0 70 1、0 90 12、10 0 1、12 0 1、12 0 2、130 1/ 0 2、130 3/ 0 4、14 0 1/ 0 4 / 0 5、14 0 2 / 0 3/ 130 5、15 0 1/ 0 2、16 0 2 1以及 0 4 xx、0 8xx等等位基因 ,其中 DRB1*0 90 12 (17.97% )、0 4 xx(12 .5 3% )、12 0 2 (11.4 2 % )及 15 0 1/ 0 2 (11.0 2 % )基因频率分布较高。江浙沪汉族人群无偏倚期望杂合性为 0 .96 34,多态性信息含量为 0 .90 2 4。结论 江浙沪汉族人群 H L A- DRB1基因具有中国汉族人群共有的遗传特征 ,但也有其自身的分布特点 ,频率分布介于南、北汉族之间。在所比较的不同人群中中国汉族人群 H L A- DRB1多态性较为丰富。
- 冯明亮杨剑豪季芸陆剑文陆琼嵇月华谢军华杨颖
- 关键词：汉族人群HLA-DRBL基因座基因频率
- 广州地区106例汉族人群MICA和MICB微卫星基因座单体型研究被引量：12
- 2004年
- 利用聚合酶链反应和荧光(6-FAM)自动化检测技术对广东地区汉族106例无亲缘关系样本进行MICA基因外显子5和MICB基因内含子1微卫星基因座多态性及其单体型分布调查。根据群体资料估算两者间的单体型频率、连锁不平衡参数、相对连锁不平衡参数。结果显示,广州地区汉族人群MICA和MICB微卫星基因座基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡法则,共检出MICA微卫星基因座5个等位基因,MICB微卫星基因座14个等位基因。其中MICA A5基因频率最高(0.2877),A4基因频率最低(0.1321)。MICB CA14等位基因频率最高(0.3255),CA19、CA28等位基因频率最低(0.0047),未检出CA27。21种MICA-MICB单体型频率大于1％(连锁不平衡参数>0),其中单体型A5-CA14(16.73％),A5.1-CA18(8.75％),A4-CA26(3.76％),A9-CA15(3.66％)和A6-CA21(2.61％)为强连锁常见单体型(x^2>3.84,P<0.05)。
- 冯明亮张景怡谢军华陈亮陆琼郭晓俊杨剑豪季芸
- 关键词：MICAMICB微卫星基因座单体型
- 5186例上海汉族无关脐带血HLA基因多态性研究被引量：2
- 2011年
- 目的了解上海地区汉族人群脐带血供者HLA-A、B、DRB1基因及单体型频率的分布特征。方法采用基因分型技术对5 186例脐带血进行HLA-A、B、DRB1基因分型,利用最大似然性原理方法计算HLA-A、B、DRB1基因及单体型频率。结果 5 186例脐带血样本中,共观察到72种HLA基因,其中频率>0.1的HLA-A、B、DRB1基因分别为A2、A11、A24、B60、B13、B46、DR9、DR12、DR4、DR15。385条A-B单体型中,195条单体型呈现显著的正连锁不平衡(A.L.D>0),12条表现为强连锁不平衡(R.L.D>0.40),26条单体型的频率高于0.01;387条B-DRB1单体型中,159条单体型呈现显著的正连锁不平衡(A.L.D>0),7条表现为强连锁不平衡(R.L.D>0.40),20条单体型的频率高于0.01;1847条A-B-DRB1单体型中,760条单体型是"可靠的"(频率≥2.89×10-4),单体型频率高于0.005有29条。结论上海汉族新生人群脐带血HLA基因和单体型多态性较为丰富,其频率分布数据和相关遗传参数为临床移植供者的选择、脐带血库的建立及人类遗传学研究提供了重要的参考。
- 杨剑豪刘嬿孙瑛谢军华郑皆炜陆瑶杜可明
- 关键词：脐带血造血干细胞基因频率单体型频率
- PCR-SSP在HLA低分辨中常见问题及解决措施被引量：4
- 2007年
- 目的探讨PCR-SSP在HLA低分辨分型中常见问题的原因,提出解决的措施。方法应用盐析法提取基因组DNA,用PCR-SSP法对参加造血干细胞资料库志愿者的血样进行HLA分型,琼脂糖凝胶电泳后紫外光灯下分析判读,并进行统计学分析。结果在4800份血样标本中,4187份标本能够准确判读出结果,检出率为87.2%,其余613份样本无法判读出确定的基因型。在这613份血样标本中所遇到的问题包括有漏检占41.9%(其中单孔漏检多达90.2%);假阳性及非特异性所占比例也较大,为29.2%;模棱两可的结果所占比例为23.2%;人为因素影响分析的占4.4%;仪器因素影响分析的占1.3%。结论SSP法用于HLA分型时,有99.5%问题可找到其原因所在,并通过相应的方法加以解决。
- 孙瑛傅敏金晔谢军华季芸杨剑豪杜可明
- 关键词：HLAPCR-SSP假阳性
