孙清岚
- 作品数：38 被引量：34H指数：4
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家科技基础条件平台建设计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学农业科学医药卫生更多>>
- 语义网在生物安全监测领域的应用研究
- 2018年
- 近年来,随着各个学科领域数据信息的不断增长,语义网的研究及应用逐渐变成了热点及难点,一个重要的原因就是对知识共享、知识集成及知识使用的强大需求。生物安全是当今社会关注的重要问题之一,新发突发传染病、蚊虫等重要传播媒介与疾病传播等一系列安全问题影响着人类的日常生活、国家经济等。本文首先对语义网的相关技术进行介绍和总结,如RDF、本体等,并着重将语义网相关技术应用在生物安全监测领域上,利用现有的标准体系框架,建立适合生物安全监测的统一数据标准体系及数据整合与转换技术,便于进一步数据集成、数据挖掘。
- 李博戚晓鹏李言飞陈强马俊才孙清岚王松旺
- 关键词：语义网知识共享RDF本体
- 微生物分类单元整合与检索
- 2015年
- 微生物分类学是微生物从业者认识微生物,进而利用和改造微生物的一种手段;其主要的任务有分类、命名和鉴定。目前有4家机构对微生物的分类单元数据库进行着维护,同时对外提供检索。4家机构由于只维护各自的数据库,给微生物从业者在检索和对比4家机构分类单元上带来了不便。基于此,本文开发了一个微生物分类单元整合和检索平台,该平台将整合4家的分类单元数据库,同时在整合过程中提取出分类单元的变更历史信息,最后通过Web方式将整合后的数据和信息供微生物从业者使用和参考。
- 侯晓婧孙清岚马俊才
- 关键词：微生物
- 基于科学角度的冠状病毒关联数据的知识挖掘方法及装置
- 本公开提供了基于科学角度的冠状病毒关联数据的知识挖掘方法、装置、电子设备及介质。该方法一具体实施方式包括：获取第一查询数据和第二查询数据；基于预设的图结构，查找第一查询数据对应的第一节点和第二查询数据对应的第二节点之间的...
- 孙清岚范国梅史文聿吴林寰马俊才张幸姣孙秀强林思汝
- 文献传递
- 冠状病毒信息数据的处理方法、装置、电子设备及介质
- 本公开涉及冠状病毒信息数据的处理方法、装置、电子设备及介质。该方法包括：获取冠状病毒信息数据；根据预设的标准化词库，将冠状病毒元数据中字段的字段值处理为相应的标准化字段值，得到相应的冠状病毒标准化元数据；根据冠状病毒标准...
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- 物种科学名称确定方法、装置、电子设备及存储介质
- 本公开提供了物种科学名称确定方法、装置、电子设备及存储介质。该方法的一具体实施方式包括：获取目标物种的待确定名称以及对应的菌株编号集合，基于待确定名称，在物种分类数据库中查找与待确定名称匹配的第一物种信息，响应于未查找到...
- 范国梅孙清岚史文聿吴林寰马俊才
- 北京地区肉类中沙门氏菌全基因组分型及耐药分析被引量：8
- 2020年
- 目的对我国北京地区肉类产品中沙门氏菌进行分离鉴定,基于全基因组测序结果,分析其耐药基因分布情况及亲缘关系。方法以38株沙门氏菌为研究对象,对不同来源的沙门氏菌进行全基因组分析,然后通过测定菌株对15种抗生素的最小抑菌浓度,结合全基因组测序结果分析不同来源的沙门氏菌的耐药特性及多重耐药状况。结果对38株沙门氏菌进行15种抗生素耐药性检测,其中34.2%为多重耐药株,68.4%的沙门氏菌对喹诺酮萘啶酸耐药,42.1%分离株对氨苄西林耐药。基于全基因组测序结果,对38株沙门氏菌进行分型为12种型别,其中88.2%的肠炎沙门氏菌与标准菌株ATCC9184亲缘关系较近。结论全基因组耐药基因和毒力基因与耐药表型有一定的关联,为监控北京地区的沙门氏菌耐药基因和毒力基因的传播方式提供理论基础。
- 畅晓晖张捷亓合媛石嵩杨向莹杨磊赵琢李小林史文聿孙清岚马俊才陈广全
- 关键词：沙门氏菌全基因组测序耐药基因耐药表型
- 菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质
- 本公开提供了菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质。该方法的一具体实施方式包括：接收终端设备发送的菌株基因组注释查询请求，其中，菌株基因组注释查询请求包括待查询菌株测序项目标识，在菌株基因组注释数据库中查询菌株...
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- 文献传递
- 微生物信息分析结果处理方法、装置、电子设备及介质
- 本公开提供了微生物信息分析结果处理方法、装置、电子设备及介质。该方法的一具体实施方式包括：响应于接收到终端设备发送的生物信息分析请求，向终端设备发送预设生信分析工具名称列表和预设数据参考库名称列表，响应于接收到终端设备发...
- 孙清岚史文聿范国梅吴林寰马俊才
- 文献传递
- 微生物菌株信息的标准化处理方法、装置及电子设备
- 本公开提供了微生物菌株信息的标准化处理方法、装置及电子设备。该方法的一具体实施方式包括：获取微生物菌株的原始信息；对微生物菌株的菌株编号进行处理，得到相应的标准化菌株编号；对微生物菌株的菌种名称进行处理，得到相应的标准化...
- 范国梅孙清岚史文聿吴林寰马俊才
- 一种基于流感病毒刺激的细胞差异基因数据分类系统
- 本发明涉及一种基于流感病毒刺激的细胞差异基因数据分类系统，它包括数据处理模块，数据处理模块采集训练样本集数据，依据训练样本集中每个样本的基因数据进行多因素数据分割生成二次数据；数据分类模块读取数据处理模块生成的二次数据，...
- 刘文军李晶孙清岚马俊才
- 文献传递
