李根亮
- 作品数：54 被引量：97H指数：5
- 供职机构：右江民族医学院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金广西研究生教育创新计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 科研项目趋动型课堂教学模式在生物化学和分子生物学教学中的实践研究
- 2022年
- 科研型教学模式是培养学生科研素养的有效途径,但参与科研项目是否有利于促进学生的学习成绩,这有待进一步研究。我们在生物化学和分子生物学教学过程中实施了一种改进型的科研型教学模式,即科研项目趋动型课堂教学模式。在这一教学模式中,我们将教学内容分成8大模块、9个讲座、6个实验,课程中充分结合学生的兴趣和需要,让学生学会科研数据的分析方法,让学生有充分的获得感。通过比较参与与不参与科研项目设计和实验的学生的期末考试成绩,分析参与科研项目对学生成绩的可能影响,同时比较学习态度对学习成绩的影响。结果发现,参与科研项目和学习态度好的学生的成绩均明显优于不参与科研项目和学习态度不好的学生(P<0.05)。研究结果表明,科研型课堂教学模式能很好地调动学生学习积极性,值得推广应用。
- 李根亮唐玉莲唐玉莲孙丽双李书李曙波
- 关键词：生物化学分子生物学
- 肝癌模型小鼠中线粒体源外泌体基因的差异性表达分析
- 2020年
- 目的探讨线粒体源外泌体基因参与肝细胞癌(HCC)病理过程的可能分子机制。方法通过RNA-seq和生物信息学手段,分析HCC中差异表达的线粒体源外泌体基因(DEMEs)及其生物学功能。结果HCC组织中共鉴定出93个DEMEs,其中74个表达下调,19个表达上调。表达下调的DEMEs经功能富集,共富集到4个生物学过程(biological process,BP)、4个细胞组分(cellular component,CC)、2个分子活性(molecular function,MF)、1个信号通路(KEGG pathway,KG)和4个蛋白位点序列特征(UP_SEQ_FEATURE,US)。它们参与了氧化还原、脂质代谢等过程,且大量DEMEs还具有线粒体转运肽功能。而上调表达的DEMEs,除了富集到1个CC,即线粒体组分,还发现其中一些参与了跨膜转运、对过氧化氢和对机械刺激的反应过程,有些还具有转移酶活性和ATP结合能力,并参与癌症的发生和转移等病理过程。结论线粒体源外泌体基因在HCC肿瘤组织与非肿瘤组织存在差异性表达,生物信息学分析显示这种差异性表达的基因涉及多个生物学过程,提示它们可能通过多种途径影响HCC的发生。
- 龙晓芳李根亮唐玉莲倪安妮陆瑞群李曙波韦海闻蓝丹陈荣彬
- 关键词：肝细胞癌外泌体线粒体差异表达基因
- 试从矛盾论的角度浅析如何做好研究生导师被引量：1
- 2016年
- 由导师和研究生构成的科研团队系统的构成基础是该系统要素间的"同",矛盾则是各不同要素间在"同"基础上相互联系中因"异"而产生的时空竞争,是各要素在维持或拓展新时空过程中遇到阻力的外在表现,也是该系统发展的动力源泉。导师要在认识该系统种种矛盾的基础上不断提高利用这些矛盾的能力,并通过有效释放各矛盾产生的张力,调控并维持该系统的动态平衡,最大化其对环境的做功,即培养人才、传播知识、创新科技和服务社会。
- 李根亮
- 关键词：研究生导师矛盾论
- 基于小鼠肝细胞癌全转录组测序的Cbx3基因上调表达机制分析
- 2022年
- 为了探讨染色质盒蛋白3(chromobox 3,Cbx3)基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中上调表达的可能机制,通过构建小鼠HCC模型,分别取30 d的瘤体组织和癌旁组织及接种0、3、30 d未成瘤小鼠的肝组织,通过全转录组测序和生物信息学手段分析Cbx3基因在瘤体组织及各对照组织中的表达,并进一步筛选与Cbx3或其编码蛋白有蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)、竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)和靶标关系的差异(q<0.05,n=3,下同)表达基因[以下将Cbx3编码蛋白PPI涉及的蛋白的编码基因称Cbx3相关基因(Cbx3-associated gene,CAG)],并分析其功能。结果显示,与对照组相比,瘤体组织中Cbx3上调表达,且存在4个Cbx3转录本及116个CAG。其中转录本NM_007624.3尽管在各组织中皆有大量表达,但在瘤体组织的表达远高于各对照组织的。GO功能富集分析结果显示,Cbx3基因及CAG主要存在于细胞核中,共同参与HCC小鼠中表观遗传学的基因表达正调控。同时,存在mmu-miR-744-5p、mmu-miR-125b-2-3p、mmu-miR-99a-3p和mmu-miR-151-5p等4种靶向于Cbx3基因的小RNA(microRNA,miRNA),其在瘤体组织中的表达显著低于各对照组织的。另外,在瘤体组织的表达远高于各对照组织的,包括2种长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在内的31种分子与Cbx3基因互为ceRNA。研究结果表明,Cbx3基因的上调表达主要是转录本NM_007624.3的上调表达;Cbx3在HCC小鼠中的功能主要是参与表观遗传学的基因表达正调控;对照组织中大量表达从而抑制Cbx3表达的mmu-miR-744-5p、mmu-miR-125b-2-3p、mmu-miR-99a-3p和mmu-miR-151-5p等4种miRNA,由于在瘤体组织中的低表达而减弱了抑制效应进而促发Cbx3在瘤体组织中上调表达;多种分子通过ceRNA机制与Cbx3基因竞争性结合以上4种miRNA而进一步促进了HCC小鼠瘤体组织中Cbx3基因的表达。
- 钱绘张泽李书孙丽双唐玉莲倪安妮蒋利和李根亮
- 关键词：肝细胞癌转录本小RNA
- 线上线下结合的科研型模块化生化等五门课程整合的初探
- 2021年
- 课程整合和教学模式革新成为了当代大学生学生能力提高和学业负担减低的主要手段。生物化学、分子生物学、细胞生物学、遗传学、表观遗传学是生命科学和医学学科的主要基础课程。这些人为分割的各门独立课程不仅内容上有交叉重叠,而且增加学生学业负担,不利于学生科研素养和科学创新能力提高。我们通过转变教育理念和开展教学实践,将以上课程及其理论和实验内容整合成为了一门《细胞、分子和基因》课程,并配套以线上线下科研型模块化教学模式。现将课程整合的设计理念、具体实施流程、整合的实施方案(包括教学内容模块)以及整合的效果评价总结如下,以期为想要进行课程整合的其他学科提供参考。
- 李根亮唐玉莲李曙波陆瑞群蒋利和孙丽双李书
- 关键词：课程整合科研型模块教学生物化学
- 中华绒螯蟹和中国明对虾精子发生过程核组蛋白变化特征
- 根据精子核内遗传物质存在状态的不同,可将动物的精子核分为三种类型:浓缩型、半浓缩型和非浓缩型。中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)(河蟹)等十足目甲壳动物的精子核呈松散的纤维状,为非浓缩核。本研究通过电泳、...
- 康现江李根亮穆淑梅秦昆郭明申
- 关键词：中华绒螯蟹中国明对虾组蛋白免疫定位
- 文献传递
- 一种小鼠睾丸组织外泌体的提取方法
- 本发明公开了一种小鼠睾丸组织外泌体的提取方法，该方法包括以下步骤：(1)取新鲜小鼠睾丸组织用4℃预冷的含1％青‑链霉素的PBS溶液洗涤3次，冰上剪碎组织；(2)将剪碎的组织置于无外泌体完全培养基培养；(3)收集培养上清液...
- 李根亮罗绿景刘会婷唐玉莲孙丽双李书黄师莫茵茵陈峥宇
- 翻转课堂理念的趣味教学在医学生物化学课程的应用初探被引量：2
- 2017年
- 目的:探索翻转课堂理念的趣味教学在医学生物化学课程中的效果。方法:在课程中进行传统教学法及趣味教学法对比研究,通过考核评价教学效果,并通过网络问卷调查学生满意度。结果:趣味教学组的学生总体满意度高达99%,显著高于传统教学。趣味教学并没有显著影响学生的考试成绩(P>0.05)。结论:翻转课堂理念的趣味教学法虽然没有提高学生成绩,但极大的提高学生上课的热情及自学能力,有效地改善学生对生物化学的厌学情绪,值得进一步研究。
- 肖娟李朝敢李根亮李曙波黄小敏胡红柳农嵩宾晓芸
- 关键词：趣味教学医学生物化学
- 肝细胞癌模型小鼠中外泌体来源RNA剪接基因的功能及差异表达分析
- 2020年
- 目的:探讨模型小鼠肝细胞癌组织(TM)内差异表达的外泌体来源RNA剪接基因(exosome-derived RNAsplicing-related DEGs,ERDs)的变化图谱及AS、SNV和INDEL与基因表达的关系。方法:以健康小鼠肝组织(生理微环境,PM)、模型小鼠无瘤体肝组织(细胞癌前微环境,PTM)和模型小鼠肝细胞癌组织(肿瘤微环境,TM)为材料,分别提取各组样本中的总RNA进行RNA-seq和生物信息学分析,并通过RT-qPCR验证实验结果。结果:与PTM比较,TM中有158个高表达的ERDs;与PM比较,TM中有141个高表达的ERDs;两类对比样本中有21个相同的ERDs在TM中高表达。这21个ERDs主要参与了4个生物学过程(BP)、5个细胞组分(CC)、2个分子功能(MF)和1个信号通路(KEGG pathway)。其功能主要富集在剪接体的功能上,尤其是在剪接体执行剪接过程中ploy(A)RNA结合、核来源的第二步剪接小体的催化作用以及剪接体snRNP组装。结论:TM中高表达的ERDs主要通过poly(A)RNA结合异常,介导错误的RNA剪接和剪接体snRNP组装,可能导致mRNA错乱剪接进而影响模型小鼠肝细胞癌的发生发展。同时,引起基因多态性的可变剪切(AS)、单核苷酸位点变异(SNV)及插入缺失标记(INDEL)与TM中高表达的RNA剪接具有关联性。
- 阮文慧唐玉莲倪安妮李根亮李曙波陆瑞群黄海玲
- 关键词：外泌体RNA剪接剪接体肝细胞癌
- 肝细胞癌源血液相关外泌体组分通过补体和凝血级联参与肿瘤组织天然免疫被引量：4
- 2020年
- 目的:探索肝细胞癌(HCC)来源血液相关外泌体组分参与天然免疫的可能机制。方法:以肝细胞癌模型小鼠的瘤体组织和癌旁肝组织为实验材料,分别提取各组织中的总RNA,通过RNA测序(RNA-seq)和生物信息学手段分析两样本中HCC源血液相关外泌体差异表达基因,并用RT-qPCR验证实验结果。结果:发现在瘤体组织和癌旁肝组织中存在81个HCC源血液相关外泌体差异表达基因。对这些差异表达基因功能富集,共富集到10个生物学过程、4个细胞组分、3个分子功能和2个KEGG通路。进一步分析发现它们主要参与天然免疫反应、血液凝固、炎症反应等生物学过程,以及受体结合、丝氨酸型肽酶活性等分子功能。其中33个HCC源血液相关外泌体差异表达基因参与了补体和凝血级联信号通路。结论:HCC源血液相关外泌体组分可能主要以受体结合、丝氨酸型肽酶催化活性等,通过补体和凝血级联信号途径,参与HCC组织中的天然免疫反应。
- 凌玉金唐玉莲倪安妮廖成传刘明慧梁祯妮李曙波陆瑞群李根亮
- 关键词：肝细胞癌血液外泌体补体天然免疫
