梁丹洁
- 作品数：6 被引量：7H指数：2
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- 来自5种动物禽Ⅰ型副粘病毒HN基因的序列分析被引量：1
- 2013年
- 本研究对从广西5种不同动物体内分离到的禽Ⅰ型副粘病毒毒株,进行了HN基因的扩增、克隆和序列分析.5个APMV-Ⅰ分离株HN基因的核苷酸序列同源性为94.7％～98.4％,推导氨基酸序列同源性为96.3％～99％,同源性较高；5个毒株的HN基因与国内广东、山东、福建等地的当前流行株同源性较高,但与经典毒株同源性较低；遗传分析表明HN基因相对保守,都源于同一个基因亚群.
- 潘杰冯淑萍孙翔翔张欣明李春英梁丹洁吴军曾咏芳周师师欧莹黄胜斌胡巧云徐贤坤熊毅
- 关键词：HN基因同源性
- 马源禽Ⅰ型副粘病毒的分离与鉴定
- 2013年
- 【目的】了解广西马源Ⅰ型副粘病毒的生物特性,为今后有效防控副粘病毒在不同宿主间传播提供科学依据。【方法】用SPF鸡胚对广西百色疑似病马组织悬浮液进行病原分离培养后,经血清学试验和致病性试验鉴定,再用RT-PCR对分离株F基因进行扩增,并对扩增片段进行测序分析。【结果】分离获得的病毒能使鸡红细胞发生凝集,且这种凝集可被鸡新城疫(ND)标准阳性血清所抑制,HA和HI效价分别为27和210。分离株毒力试验结果显示,鸡胚平均死亡时间(MDT)为72 h,雏鸡脑内接种致死指数(ICPI)为1.48,属中发型毒株。分离株与禽I型副粘病毒基因Ⅶ型毒株NDV04-21、TW-96p的核苷酸同源性分别为95.9%和95.1%;基于F基因的遗传分型进化树显示,分离株与NDV04-21、TW-96p处于同一进化树分支,属于禽I型副粘病毒基因Ⅶ型;分离株F蛋白112～117裂解位点氨基酸序列与标准强毒株F48E9、HER33的一致,在第112～117位氨基酸序列为3'-R-R-Q-R-R-F-5'。【结论】广西马群已有禽I型副粘病毒存在,再次证实广西地区禽I型副粘病毒宿主范围在不断扩大。
- 李春英蒋家霞周师师梁丹洁张欣明孙翔翔欧莹曾永芳吴军熊毅
- 关键词：禽I型副粘病毒毒力试验F基因同源性
- 广西猪源Ⅰ型副粘病毒F基因测序分析
- 2013年
- 对广西猪源Ⅰ型副粘病毒F基因测序分析,为今后开展猪源副粘病毒的相关研究提供参考,也为有效防控副粘病毒感染奠定基础。参考GenBank发表的相关禽副粘病毒I型(Avian paramyxovirus serotype I,APMV-X)基因组序列,设计了1对特异性引物,用RT-PCR法分别扩增出病毒各F基因片段,并将目的基因片段回收纯化。测定得F基因的序列结果表明,从猪组织中分离获得1株猪源禽Ⅰ型副粘病毒,分离株F基因112～117位裂解位点的氨基酸组成为R-R-Q-R-R-F,与强毒株DQ417113、AF458012的裂解位点一致。同源性分析结果表明,分离株与标准强毒株的核苷酸同源性分别为87.5%和87.4%。猪源禽I型副粘病毒分离株为强毒株,属于基因Ⅰ型是传统型毒株,广西地区禽I型副粘病毒宿主范围呈不断扩大趋势。
- 张欣明梁丹洁李春英胡巧云欧莹周师师孙翔翔熊毅颜健华
- 马源禽Ⅰ型副黏病毒HN基因的克隆与序列分析
- 2013年
- 为了解禽Ⅰ型副黏病毒的跨种传播以及对HN基因进行序列分析,运用RT-PCR方法,扩增马源禽I型副黏病毒广西分离株M10株的HN基因,将其克隆至PMD18-T载体中,进行序列测定,序列分析表明,M10株的HN基因片段长度约为2.0kb,ORF为1716个碱基,编码571个氨基酸;ORF区与参考毒株的核苷酸同源性为80.9%-99.2%,推导的氨基酸同源性为88.6%-98.6%。在同源性比较的基础上,进一步绘制禽I型副粘病毒HN基因的系统进化树,分析表明,M10株与参考毒株YG03、NDV-03、FP1等亲缘关系较近。
- 梁丹洁欧莹李春英蒋家霞张欣明孙翔翔曾咏芳周师师吴军熊毅
- 关键词：HN基因
- H1N1猪流感病毒广西分离株HA基因序列分析被引量：3
- 2013年
- 【目的】了解H1N1猪流感病毒广西分离株的分子特征,为广西猪流感疫情监控提供参考依据。【方法】采用RT-PCR对2011年分离获得的H1N1猪流感病毒广西分离株（A/swine/Guangxi/1/2011）的HA基因进行扩增,然后利用DNASTAR分析软件对测序基因片段进行整个阅读框架的核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性比对分析,并用MEGA4.0绘制遗传进化树。【结果】广西分离株HA基因长1701bp,编码566个氨基酸,核苷酸序列与经典SIV的同源性为88.0%~99.6%,与季节性H1N1人流感病毒的同源性为76.3%~77.3%,与欧洲类禽SIV分离株的同源性为72.9%~75.4%,与2009甲型H1N1流感病毒的同源性为99.2%~99.6%;从核苷酸遗传进化树可知,广西分离株与类禽H1N1流感病毒和人H1N1流感病毒分离株的亲缘关系较远,而与2009甲型H1N1流感病毒分离株的亲缘关系最近。广西分离毒株HA基因的裂解位点序列为IPSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子生物学特征;共有8个糖基化位点,其中6个位于HAl区,两个位于HA2区;广西分离株HA蛋白RBS位点的氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点。【结论】广西分离株（A/swine/Guangxi/1/2011）属于2009甲型H1N1流感病毒。
- 颜健华梁丹洁李春英徐贤坤胡巧云孙翔翔何奇松熊毅
- 关键词：猪流感病毒甲型H1N1流感病毒HA基因同源性
- 广西猪嵴病毒的感染状况调查与基因序列分析
- 本研究采用RT-PCR方法对从广西9个地市采集的猪肠样以及猪粪便样品进行了猪嵴病毒(PKV)的检测,从498份样品中检测出159份阳性,阳性率为31.9％,从阳性病料中挑选21株猪嵴病毒毒株进行完整的ORF基因测序分析。...
- 梁丹洁
- 关键词：流行病学基因序列分析
- 文献传递
