周师师
- 作品数:5 被引量:1H指数:1
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- 发文基金:广西壮族自治区自然科学基金更多>>
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- 广西猪源Ⅰ型副粘病毒F基因测序分析
- 2013年
- 对广西猪源Ⅰ型副粘病毒F基因测序分析,为今后开展猪源副粘病毒的相关研究提供参考,也为有效防控副粘病毒感染奠定基础。参考GenBank发表的相关禽副粘病毒I型(Avian paramyxovirus serotype I,APMV-X)基因组序列,设计了1对特异性引物,用RT-PCR法分别扩增出病毒各F基因片段,并将目的基因片段回收纯化。测定得F基因的序列结果表明,从猪组织中分离获得1株猪源禽Ⅰ型副粘病毒,分离株F基因112~117位裂解位点的氨基酸组成为R-R-Q-R-R-F,与强毒株DQ417113、AF458012的裂解位点一致。同源性分析结果表明,分离株与标准强毒株的核苷酸同源性分别为87.5%和87.4%。猪源禽I型副粘病毒分离株为强毒株,属于基因Ⅰ型是传统型毒株,广西地区禽I型副粘病毒宿主范围呈不断扩大趋势。
- 张欣明梁丹洁李春英胡巧云欧莹周师师孙翔翔熊毅颜健华
- 猪繁殖与呼吸综合征RT-PCR检测方法的建立与应用
- 为了解猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)在广西区的流行情况,本研究根据 GenBank中所发表的PRRSV美洲型经典株、高致病性变异株及欧洲株的Nsp2基因序列,设计并合成了两对特异性引物,建立了两种RT-PCR检测方法。第...
- 周师师
- 关键词:猪繁殖与呼吸综合征RT-PCR检测流行病学
- 文献传递
- 来自5种动物禽Ⅰ型副粘病毒HN基因的序列分析被引量:1
- 2013年
- 本研究对从广西5种不同动物体内分离到的禽Ⅰ型副粘病毒毒株,进行了HN基因的扩增、克隆和序列分析.5个APMV-Ⅰ分离株HN基因的核苷酸序列同源性为94.7%~98.4%,推导氨基酸序列同源性为96.3%~99%,同源性较高;5个毒株的HN基因与国内广东、山东、福建等地的当前流行株同源性较高,但与经典毒株同源性较低;遗传分析表明HN基因相对保守,都源于同一个基因亚群.
- 潘杰冯淑萍孙翔翔张欣明李春英梁丹洁吴军曾咏芳周师师欧莹黄胜斌胡巧云徐贤坤熊毅
- 关键词:HN基因同源性
- 马源禽Ⅰ型副黏病毒HN基因的克隆与序列分析
- 2013年
- 为了解禽Ⅰ型副黏病毒的跨种传播以及对HN基因进行序列分析,运用RT-PCR方法,扩增马源禽I型副黏病毒广西分离株M10株的HN基因,将其克隆至PMD18-T载体中,进行序列测定,序列分析表明,M10株的HN基因片段长度约为2.0kb,ORF为1716个碱基,编码571个氨基酸;ORF区与参考毒株的核苷酸同源性为80.9%-99.2%,推导的氨基酸同源性为88.6%-98.6%。在同源性比较的基础上,进一步绘制禽I型副粘病毒HN基因的系统进化树,分析表明,M10株与参考毒株YG03、NDV-03、FP1等亲缘关系较近。
- 梁丹洁欧莹李春英蒋家霞张欣明孙翔翔曾咏芳周师师吴军熊毅
- 关键词:HN基因
- 马源禽Ⅰ型副粘病毒的分离与鉴定
- 2013年
- 【目的】了解广西马源Ⅰ型副粘病毒的生物特性,为今后有效防控副粘病毒在不同宿主间传播提供科学依据。【方法】用SPF鸡胚对广西百色疑似病马组织悬浮液进行病原分离培养后,经血清学试验和致病性试验鉴定,再用RT-PCR对分离株F基因进行扩增,并对扩增片段进行测序分析。【结果】分离获得的病毒能使鸡红细胞发生凝集,且这种凝集可被鸡新城疫(ND)标准阳性血清所抑制,HA和HI效价分别为27和210。分离株毒力试验结果显示,鸡胚平均死亡时间(MDT)为72 h,雏鸡脑内接种致死指数(ICPI)为1.48,属中发型毒株。分离株与禽I型副粘病毒基因Ⅶ型毒株NDV04-21、TW-96p的核苷酸同源性分别为95.9%和95.1%;基于F基因的遗传分型进化树显示,分离株与NDV04-21、TW-96p处于同一进化树分支,属于禽I型副粘病毒基因Ⅶ型;分离株F蛋白112~117裂解位点氨基酸序列与标准强毒株F48E9、HER33的一致,在第112~117位氨基酸序列为3'-R-R-Q-R-R-F-5'。【结论】广西马群已有禽I型副粘病毒存在,再次证实广西地区禽I型副粘病毒宿主范围在不断扩大。
- 李春英蒋家霞周师师梁丹洁张欣明孙翔翔欧莹曾永芳吴军熊毅
- 关键词:禽I型副粘病毒毒力试验F基因同源性