刘永亮
- 作品数：4 被引量：18H指数：2
- 供职机构：中国科学院武汉植物园更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广州市科技计划项目中国科学院科研装备研制项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学更多>>
- 广藿香八氢番茄红素合成酶PcPSY1基因克隆和序列分析被引量：1
- 2013年
- 根据已获得的广藿香转录组数据中的PSY转录本序列,利用Primer 3在线设计基因全长扩增引物,采用RT-PCR方法获得广藿香的八氢番茄红素合成酶(phytoene synthase,PSY)基因。并利用在线分析平台和生物软件对该其因进行生物信息学分析。获得的广藿香PSY1基因长1550bp,编码439个氨基酸,命名为PcPSY1,GenBank登录号为KC862310;预测了PcPSY1编码蛋白的结构与功能,且基于PSY基因利用NJ法构建了与21个不同物种间的进化树,进化树表明广藿香PcPSY1基因与桂花的PSY序列亲缘关系最近。成功克隆并分析广藿香PcPSY1基因的全长序列,为进一步阐明广藿香萜类代谢途径奠定基础。
- 欧阳蒲月刘永亮梁永枢曾少华莫小路
- 关键词：广藿香八氢番茄红素合成酶基因克隆生物信息学分析
- 黑果枸杞和宁夏枸杞中黄酮醇合酶基因的克隆及表达分析被引量：10
- 2014年
- 黑果枸杞和宁夏枸杞为枸杞属中两种重要的药用植物,具有极大的药用价值。本研究利用转录组数据克隆了黑果枸杞和宁夏枸杞黄酮醇合酶基因(Flavonol synthase,FLS),分别命名为LrFLS及LbFLS,并通过实时定量PCR(real-time quantitative PCR)分析其在两种枸杞果实四个发育时期中的表达模式。研究结果表明:LrFLS与LbFLS各编码一条由350个氨基酸残基组成的蛋白序列。蛋白序列分析表明:LrFLS、LbFLS相似度高达99%,各含有两个保守的功能域。进化分析表明,LrFLS和LbFLS同属茄科的烟草、马铃薯的FLS蛋白序列相似度最高。实时定量PCR结果表明,LrFLS在S2时期的表达量最高,在果实发育过程中呈现先升高后降低的趋势;而LbFLS在S2时期表达量最低,呈现先降低后升高的趋势。本研究为揭示黄酮醇在黑果枸杞和宁夏枸杞果实中的累积具有一定的启示作用。
- 沈笑飞刘永亮王瑛曾少华
- 关键词：黑果枸杞宁夏枸杞基因表达
- 广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析被引量：2
- 2014年
- 为了解广藿香对淀粉的利用,克隆了广藿香(Pogostemon cablin)的α-淀粉酶(alpha-amylase,AMY)基因,对其进行相关生物信息学分析。搜索本课题组建立的广藿香转录组数据库,获得AMY基因全长序列,并设计全长引物进行PCR验证;利用生物信息学软件对AMY基因进行生物信息学分析。本研究获得的广藿香AMY基因命名为PcAMY1基因(GenBank登录号为KC862311),该基因全长1 420 bp,编码422个氨基酸。基于生物信息软件分析了PcAMY1基因编码蛋白的理化特性。系统进化树分析结果表明,PcAMY1基因与牵牛(Ipomoea nil)的AMY序列同源性最高,与赤豆(Vigna angularis)、菜豆(haseolus vulgaris)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)等植物次之,与自然进化关系保持一致。PcAMY1基因在广藿香嫩茎、成熟茎、老茎、嫩叶、成熟叶、老叶中均有表达,但在老茎中表达量最高。成功克隆到广藿香PcAMY1基因,并对其进行相关生物信息学与基因表达分析。
- 欧阳蒲月刘永亮王瑛严振
- 关键词：基因克隆生物信息学分析
- 宁夏枸杞苯丙氨酸解氨酶基因的cDNA克隆及其表达分析被引量：5
- 2014年
- 为探讨宁夏枸杞（Lycium barbarum）苯丙氨酸解氨酶基因（LbPAL）的表达特征,采用PCR 法克隆了宁夏枸杞LbPAL 基因的cDNA,并用实时定量PCR 法分析了其表达特征.结果表明：宁夏枸杞的LbPAL 基因的全长cDNA 为2321 bp,包含2163 bp、编码720 个氨基酸的开放阅读框; LbPAL 与茄科其他物种的PAL 氨基酸序列及三维结构具有较高保守性;与茄科物种的PAL 聚类在同-个分支中.LbPAL 在叶、花瓣、S1 期果实的表达量较高,而在根及S2 ~ S5 期果实的表达水平较低.在NaCl 胁迫处理下,LbPAL 在根和茎中的表达量均有下调的趋势;而在叶片中,LbPAL 表达量先急剧增加而后急剧下降并趋于稳定.这为解析宁夏枸杞中类黄酮化合物的生物合成调节及生理功能提供了参考.
- 邹彩云刘永亮曾少华黎云祥王瑛
- 关键词：宁夏枸杞苯丙氨酸解氨酶基因基因表达盐胁迫
