殷秀梅
- 作品数：9 被引量：26H指数：3
- 供职机构：西南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 蛇床及其近缘物种的ITS2分子鉴定被引量：7
- 2012年
- 目的:对传统中药蛇床子基原植物及其近缘物种的ITS2条形码序列进行分析,探讨药用植物蛇床子的分子鉴定方法。方法:采用PCR技术扩增蛇床ITS2基因片段,进行双向测序,运用CodonCodeAligner拼接后,用MEGA5.0软件进行相关数据分析,构建NJ树。应用Schultz等建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构。结果:蛇床与其近缘物种ITS2序列间存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及其ITS2二级结构均可以将蛇床及其近缘物种区分开。结论:ITS2可有效地鉴别蛇床及其近缘物种。
- 殷秀梅罗焜刘美子罗红梅
- 关键词：近缘物种DNA条形码ITS2
- 蛇足石杉1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶(HsDXR1)基因克隆及表达分析
- 基于本实验室已获得的蛇足石杉转录组数据,获得一个编码1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase,DXR)的转录本,分析其开放阅读...
- 罗红梅孙超宋经元殷秀梅牛云云向丽陈士林李榕涛李标徐晓兰林余霖胡志刚姚辉王德立何柳
- 关键词：蛇足石杉基因克隆
- 文献传递
- 龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析
- 龙骨马尾杉[Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching]为石杉科(Huperziaceae)马尾杉属植物,又称龙骨石松、大千金草、大伸筋草、裤带藤等,始载于《云南植物研究》,主要分布于热带地区,...
- 张鑫罗红梅殷秀梅宋经元
- 文献传递
- 蛇足石杉鲨烯环氧酶HsSE1基因克隆及表达分析
- 目的:对蛇足石杉鲨烯环氧酶基因(Squalene epoxidase,SE)的cDNA进行克隆及表达分析。方法:根据课题组已获得的蛇足石杉(Huperzia serrata)转录组数据中的SE1转录本序列,设计基因全长扩...
- 殷秀梅牛云云张鑫罗红梅
- 关键词：蛇足石杉
- 文献传递
- 蛇足石杉HsFPS1、HsSQS1和HsSE1基因克隆、生物信息学预测及表达分析
- 中药蛇足石杉(千层塔)为石杉科(Huperziaceae)石杉属(Huperzia)植物蛇足石杉[Huperzia serrata (Thunb.) Trev.]的干燥全草,是我国常用中药之一。民间用于治疗跌打损伤、瘀血...
- 殷秀梅
- 关键词：蛇足石杉鲨烯合酶
- 文献传递
- 蛇足石杉HsCAS1基因克隆及序列分析被引量：5
- 2012年
- 本研究对蛇足石杉(Huperzia serrata)环阿屯醇合成酶(Cycloartenol synthase,CAS)基因HsCAS1编码区进行克隆及序列分析。根据本实验室已获得的蛇足石杉转录组数据,从中获得1条具有环氧角鲨烯环化酶保守结构域的编码CAS的转录本,采用RT-PCR方法获得该基因的编码区序列,并对HsCAS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析。利用实时荧光定量PCR方法检测HsCAS1基因在蛇足石杉的根、茎、叶中的表达情况。序列分析表明,所克隆的HsCAS1基因编码区长为2,271 bp,编码756个氨基酸残基,HsCAS1与紫果冷杉(Abies magnifica)的CAS具有61%的序列相似性。生物信息学预测HsCAS1蛋白含有3个跨膜区,具有萜类环化酶等保守结构域,不含信号肽。HsCAS1在蛇足石杉的根中表达丰度高于茎和叶。本研究在国内外首次获得蛇足石杉HsCAS1基因的编码区序列,为进一步研究HsCAS1在石杉科植物甾醇合成途径中的功能及鉴定酶活性位点奠定基础。
- 罗红梅张鑫牛云云宋经元陈士林殷秀梅何顺志
- 关键词：蛇足石杉甾醇次生代谢
- 龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析
- 2013年
- 目的对龙骨马尾杉Phlegmariurus carinatus法呢二磷酸合成酶(Farnesyl diphosphate synthase,FPS)基因PcFPS1编码区进行克隆及序列分析。方法根据已获得的龙骨马尾杉转录组数据,从中获得1条编码FPS的转录本,采用RT-PCR方法获得PcFPS1的编码区序列,并对PcFPS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析。结果序列分析表明,所克隆的PcFPS1基因编码区长为1 119 bp,编码372个氨基酸残基,PcFPS1与挪威云杉Picea abies的FPS具有70%的序列相似性。生物信息学预测PcFPS1蛋白基本不含跨膜区,具有萜类合酶保守结构域,不含信号肽。结论首次获得龙骨马尾杉PcFPS1基因的编码区序列,为进一步研究PcFPS1在石杉科植物萜类及甾醇类化合物生物合成途径中的功能及鉴定酶活性位点奠定基础。
- 张鑫罗红梅殷秀梅宋经元
- 关键词：次生代谢三萜克隆
- 蛇足石杉HsFPS1、HsSQS1和HsSE1基因克隆、生物信息学预及表达分析
- 中药蛇足石杉（千层塔）为石杉科（Huperziaceae）石杉属（Huperzia）植物蛇足石杉[Huperziaserrata(Thunb.)Trev.]的干燥全草，是我国常用中药之一。民间用于治疗跌打损伤、瘀血肿痛、...
- 殷秀梅
- 关键词：蛇足石杉鲨烯合酶生物信息学预测基因克隆
- 文献传递
- 蛇足石杉鲨烯合酶HsSQS1基因克隆和序列分析被引量：15
- 2012年
- 鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)是植物萜类化合物生物合成途径的关键酶。本研究根据课题组已获得的蛇足石杉(Huperzia serrata)转录组数据中的SQS1转录本序列,设计基因全长扩增引物,利用RT-PCR方法获得蛇足石杉SQS1基因的全长cDNA序列;利用实时荧光定量PCR方法检测了HsSQS1基因在蛇足石杉根、茎、叶中的表达情况;对HsSQS1基因进行生物信息学分析,并预测HsSQS1编码蛋白的结构与功能。研究结果表明,克隆获得的蛇足石杉SQS1基因长为1 263 bp,编码420个氨基酸,命名为HsSQS1,GenBank登录号JQ004938。HsSQS1基因在蛇足石杉的根中表达丰度高于茎和叶。本研究成功克隆并分析了蛇足石杉SQS1的全长序列,为进一步阐明蛇足石杉三萜代谢途径奠定基础。
- 殷秀梅白志川牛云云罗红梅陈士林
- 关键词：蛇足石杉鲨烯合酶
