罗红梅
- 作品数：92 被引量：577H指数：14
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学理学更多>>
- 丹参倍半萜合酶基因SmTPS21、其克隆引物、表达载体、催化产物及应用
- 本发明公开了一条参与合成丹参次生代谢产物——β‑榄香烯的萜类合酶基因序列(SmTPS21)；本发明所提供的SmTPS21基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述基因编码的蛋白质具有SEQ ID No.2所示的...
- 罗红梅刘琬菁
- 龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析
- 龙骨马尾杉[Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching]为石杉科(Huperziaceae)马尾杉属植物,又称龙骨石松、大千金草、大伸筋草、裤带藤等,始载于《云南植物研究》,主要分布于热带地区,...
- 张鑫罗红梅殷秀梅宋经元
- 文献传递
- 基于高通量测序454 GS FLX的丹参转录组学研究被引量：93
- 2010年
- 本研究应用新一代高通量测序技术454GS FLX Titanium对2年生丹参根的转录组进行测序,研究其基因表达谱,挖掘其功能基因。获得46722表达序列标签(express sequence tags,EST),序列平均长度414bp,与Sanger测序的长度相当。所得序列与GenBank丹参EST合并拼接,获得18235条unigene,其中,454高通量测序发现了13980条新的unigene。数据库中的序列同源性比较表明,其中73.0%(13308条)与其他生物的已知基因具有不同程度的同源性。通过BLAST与Gene Ontology分析获得了可能参与丹参酮合成的序列27条(编码15个关键酶),参与丹酚酸合成的序列29条(编码11个关键酶),细胞色素P450序列70条,转录因子序列577条。454高通量测序技术作为药用植物功能基因组研究的重要手段可在丹参功能基因的发现中发挥重要作用,这些基因的发现为丹参酮和丹酚酸类化合物生物合成研究奠定了基础,同时也为丹参的转录组研究提供了基础数据。
- 李滢孙超罗红梅李西文牛云云陈士林
- 关键词：丹参表达序列标签转录组
- 一种用于预测丹参花色的SNP分子标记及其应用
- 本发明提供一种预测丹参花色的SNP分子标记及其应用。基于丹参基因组F3′5′H基因的全长cDNA序列，所述SNP分子标记位点在该基因序列的1230bp位点；本发明还提供一种用于检测所述分子标记的引物和使用所述分子标记预测...
- 罗红梅严黎刘琬菁
- 文献传递
- 丹参萜类合酶基因SmTPS11、其克隆引物、表达载体、催化产物及应用
- 本申请公开了一条主要参与合成丹参挥发性产物石竹烯等多种倍半萜的萜类合酶基因序列(SmTPS11)；本申请提供的SmTPS11基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列以及SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。基于丹...
- 罗红梅刘琬菁
- 文献传递
- 用于质谱分析的丹参蛋白/多肽序列数据库的构建
- 2013年
- 丹参是我国传统中药材,目前已从中鉴定出数十种具有药用功效的化合物成分。针对丹参药用成分合成机制的蛋白组学研究可为丹参品种遗传改良提供理论依据。本研究以Illumina高通量测序手段获取的不同组织丹参转录组拼接序列为基础,构建了可用于蛋白组学分析的丹参特异的蛋白/多肽序列数据库,为后期开展丹参蛋白组学研究提供了基础。
- 徐海滨宋经元钱俊汪波谢丽芳罗红梅
- 关键词：丹参质谱分析数据库
- 食蟹猴体内、外感染SIVmac251后产毒水平的比较研究
- 2005年
- 目的探索在猴免疫缺陷病毒(SIV)造模之前选择适宜于制作此模型的猕猴个体的方法,以减少感染后血浆病毒水平过低的几率,从而保证实验的质量。方法测定SIV感染前实验猴外周血单个核细胞(PBMC)在试管内感染SIV后的产毒水平,并与该个体在感染同一株SIV后血浆病毒载量的水平进行比较分析,判断此法能否用于选择适于造模的实验猴。结果根据14只食蟹猴的结果,体外与体内的病毒水平符合比为10/14,体内病毒载量偏低的猴6只(6/14),体外病毒水平偏低者4只,如把这4只猴排除,则余下10只猴体内病毒载量偏低的猴为3只(3/10)。结论应用检测体外PBMC病毒产量水平的方法,选择病毒水平高的猴才用于体内感染SIV。这样能部分去除体内感染的病毒载量偏低的猴。但最终的解决方法仍是建立培育遗传背景清楚的SPF实验猴群。
- 邓文娣罗红梅陈颂吴小闲符林春
- 关键词：猕猴属SIV
- 丹参酮合成相关的SmCYP81C16基因克隆和功能研究被引量：6
- 2020年
- 目的:丹参(Salvia miltiorrhiza)根中所含的丹参酮为二萜醌类化合物,而鉴定参与丹参酮合成的CYP450基因成为解析丹参酮生物合成途径分子机制的关键步骤。方法:本实验从丹参基因组和转录组数据中筛选到SmCYP81C16基因,采用RT-PCR方法克隆获得基因cDNA全长序列,利用生物信息学分析方法分析其所编码蛋白质的理化性质,预测该蛋白质二级结构、保守结构域等,建立系统发育进化树;利用实时荧光定量PCR方法检测了该基因的组织/器官表达特异性;通过遗传转化方法获得了该基因的过表达转基因毛状根株系,通过化学检测及代谢组学分析丹参酮类化合物在对照株系和过表达株系中的含量变化。利用实时荧光定量PCR方法检测了毛状根中丹参酮合成途径关键酶基因中的相对表达量。结果:SmCYP81C16基因全长1497 bp,编码498个氨基酸残基,该蛋白质相对分子质量为55.8 kDa;SmCYP81C16在丹参茎和根的周皮部高表达;通过化学检测及代谢组学分析发现,与对照株系比较,在SmCYP81C16过表达阳性株系中,丹参酮类化合物的含量升高;过表达毛状根中丹参酮合成途径关键酶基因的表达量显著上升。结论:本研究结果表明SmCYP81C16具有正向调控丹参酮生物合成的功能。本研究为利用生物技术方法提高丹参酮类化合物含量奠定基础。
- 张建红王喆陈泓宇严黎吕海舟刘琬菁徐志超罗红梅
- 关键词：丹参细胞色素P450丹参酮生物合成基因克隆生物信息学分析基因过表达
- 糖基转移酶在植物次生代谢途径中的研究进展被引量：20
- 2012年
- 糖基转移酶(GT)是能够催化糖基从激活的供体转移到特定的受体分子上的一类酶,在生物体中普遍存在,形成超基因家族。糖基转移酶广泛参与植物生命活动的各种生物学过程,尤其在植物次生代谢途径中发挥重要作用。本文概述了糖基转移酶在植物次生代谢途径中的研究进展,描述了该基因家族及其与植物次生代谢途径进化的关系,并总结了目前糖基转移酶类基因克隆的方法和新策略。
- 郭溆罗红梅宋经元孙超陈士林
- 关键词：糖基转移酶
- 龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析
- 2013年
- 目的对龙骨马尾杉Phlegmariurus carinatus法呢二磷酸合成酶(Farnesyl diphosphate synthase,FPS)基因PcFPS1编码区进行克隆及序列分析。方法根据已获得的龙骨马尾杉转录组数据,从中获得1条编码FPS的转录本,采用RT-PCR方法获得PcFPS1的编码区序列,并对PcFPS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析。结果序列分析表明,所克隆的PcFPS1基因编码区长为1 119 bp,编码372个氨基酸残基,PcFPS1与挪威云杉Picea abies的FPS具有70%的序列相似性。生物信息学预测PcFPS1蛋白基本不含跨膜区,具有萜类合酶保守结构域,不含信号肽。结论首次获得龙骨马尾杉PcFPS1基因的编码区序列,为进一步研究PcFPS1在石杉科植物萜类及甾醇类化合物生物合成途径中的功能及鉴定酶活性位点奠定基础。
- 张鑫罗红梅殷秀梅宋经元
- 关键词：次生代谢三萜克隆
