邵俊杰
- 作品数：8 被引量：88H指数：4
- 供职机构：上海市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：上海市医学重点学科(专科)建设项目上海市卫生局青年科研基金上海市卫生局科技发展基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2006年上海监测点婴幼儿腹泻标本中诺如病毒基因分析被引量：4
- 2007年
- [目的]了解2006年上海监测点婴幼儿病毒性腹泻散发病例中诺如病毒基因型别及核酸变异情况。[方法]应用一步法RT-PCR扩增89份病毒性腹泻标本中诺如病毒核酸,测序后应用基因分析软件包对核酸序列进行分析。[结果]12条核酸序列经测序和比对均属于诺如病毒GII基因组,其中3条核酸测序序列与2006年德国公布的序列同源性相近;其余9条核酸测序序列与2004年中国、2004、2005年日本、2006年荷兰公布的序列同源性相近。[结论]2006年上海地区婴幼儿中存在诺如病毒GII基因组散发病例,并以GII4基因型为主。
- 滕峥张曦翁康生邵俊杰赵百慧
- 关键词：诺如病毒基因组基因型
- 双重RT-PCR检测轮状病毒和诺瓦克病毒核酸方法建立被引量：2
- 2006年
- 目的:建立快速且简便的常见腹泻病毒筛检和诊断方法,为及时明确病因、控制病原体的传播以及采取有效的治疗措施,防止抗生素滥用提供病原学依据。方法:对建立的一步法双重RT-PCR进行灵敏度、特异性、重复性分析。并应用该方法对28份疑似病毒性腹泻监测标本进行轮状病毒和诺瓦克病毒核酸检测,同时用普通RT-PCR方法、乳胶凝集法和基因序列分析进行检测结果验证。结果:检测出轮状病毒核酸6份,诺瓦克病毒核酸2份,验证符合率达100%。结论:一步法双重RT-PCR检测轮状病毒和诺瓦克病毒核酸的方法建立,不仅节省了检测过程中的人力、试剂和时间,更重要的是提高了应急筛检的能力,为病毒性腹泻病及时防控和治疗赢得时间。
- 滕峥张曦邵俊杰卢伟
- 关键词：轮状病毒诺瓦克病毒
- 上海市手足口病常见病原体基因分析被引量：18
- 2008年
- 滕峥邵俊杰朱兆奎赵百慧陈敏
- 关键词：常见病原体手足口病基因分析肠道病毒71型爆发疫情柯萨奇病毒
- 2009～2011年上海市手足口病流行病学和病原学特征被引量：24
- 2013年
- 为分析2009～2011年上海地区手足口病流行病学特征和病原构成，从国家疾病监测信息报告管理系统获取上海市2009～2011年手足口病流行病学资料；采用实时荧光反转录聚合酶链反应（RT-PCR）对来自上海18个区（县）的6676例手足口病病例标本进行肠道病毒核酸检测，对其中257份标本进行病毒分离；对27份人肠道病毒71型（HEV71）毒株进行VPl基因序列全长测定和分析。结果显示，2009～2011年上海市18个区（县）均有手足口病病例报道，地区分布元显著差异；≤5岁的婴幼儿为疾病高发年龄段；4～11月为发病高峰期。HEV71和柯萨奇病毒A组16型（CAl6）为主要病原，不同地区病原构成有所不同。实时荧光RT—PCR对6676例病例标本进行核酸检测，其中肠道病毒通用核酸检测阳性率为69．61％，HEV71和CAl6阳性率分别为38．83％和21．26％。对257份HEV71核酸阳性标本进行病毒分离，获得毒株57株，分离阳性率为22．18％。对其中27株进行VPl基因全长测序，均属C4a基因亚型。
- 邵俊杰王嘉瑜滕峥潘浩陈洪友匡小舟俞雪莲朱兆奎张曦
- 关键词：肠道病毒人肠道病毒71型手足口病
- SYB GRreenⅠ实时PCR检测甲肝病毒方法的建立与初步应用被引量：4
- 2007年
- 目的:建立一种快速、特异的SYBR GreenⅠ实时PCR方法检测甲肝病毒。方法:对SYBR GreenⅠ实时PCR检测甲肝病毒方法的反应条件、反应体系进行优化,同时与传统RT-PCR方法进行灵敏度比较,提高该方法的特异性、灵敏性。并用该方法对甲肝病毒毒株、脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒(1～6型)毒株、贝类水产品标本进行检测。结果:SYBR GreenⅠ实时PCR与传统RT-PCR检测甲肝病毒方法的灵敏度无明显区别,但检测时间缩短了1/2。该方法能特异检测出甲肝病毒,不能扩增脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒(1～6型)毒株,对农贸市场40份贝类水产品进行甲肝病毒核酸检测,检出3份。结论:建立的SYBR GreenⅠ实时PCR方法用于甲肝病毒检测具有特异、灵敏、快速等优点,可用于甲肝的病原学监测。
- 朱兆奎张曦滕峥邵俊杰赵百慧卢伟
- 关键词：甲肝病毒实时PCRSYBR
- 上海地区部分婴幼儿腹泻标本中诺如病毒基因分析被引量：3
- 2007年
- 目的了解2006年上海哨点医院婴幼儿疑似病毒性腹泻散发病例中诺如病毒基因型别和基因特征。方法应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中诺如病毒核酸,测序后使用DNAstar基因分析软件与Genbank中的参考株进行核酸序列分析。结果13份测序结果均属于诺如病毒GⅡ遗传组,以GⅡ.4基因型为主。其中2份核酸序列与2006年德国汉堡毒株序列同源性相近,分别为86.2%和88.2%;2份核酸序列与2006年荷兰乌得勒支毒株序列同源性相近,均为83.9%;其余9份核酸序列与2004年中国广西、2004年和2005年日本东京毒株序列同源性相近,为87.3%～97.5%。结论2006年上海哨点医院婴幼儿疑似病毒性腹泻标本中存在诺如病毒GⅡ.4基因型散发病例,不同病毒株之间差异较大。
- 滕峥张曦翁康生邵俊杰赵百慧卢伟
- 关键词：诺如病毒基因型
- 2009年上海市手足口病流行病学和病原学特征被引量：24
- 2010年
- 本研究对上海市手足口病(Hand-foot-and-mouth disease,HFMD)的流行病学和病原学特征进行了分析。从国家疾病监测信息报告管理系统获取上海市2009年HFMD的流行病学数据;采用荧光定量RT-PCR方法对来自上海15个区县的799例HFMD进行肠道病毒(Enterovirus,EV)核酸检测;对部分肠道病毒71型(Enterovirus71,EV71)的VP1区和部分其它EV的VP4区序列进行测定和分析。采用Office excel软件进行简单数据统计分析,用BioEdit和MEGA软件进行病毒基因特征分析,通过BLAST服务器的在线比对进行EV型别鉴定。分析显示:上海市18个区县均有病例报告,地区分布无显著特点;小于6岁的婴幼儿期为疾病高发年龄段;4～7月为发病高峰期;EV71和柯萨奇病毒A16(Coxsackie virus A16,CA16)为主要病原,不同地区、不同月份的病原构成各不相同,CA16为轻症病例的主要病原,EV71则为重症病例的主要病原;基于VP1区序列分析,上海EV71毒株与C4a亚型毒株具有最近的亲缘性和最高的同源性;2株其它肠道病毒经鉴定属于CA2和CA10型。结果表明:EV71和CA16为2009年上海HFMD流行的主要病原,EV71属于C4a亚型;除EV71和CA16外,还存在小部分其它EV(如:CA2和CA10)引起的HFMD。
- 滕峥檀晓娟邵俊杰张勇匡小舟张曦许文波
- 关键词：手足口病肠道病毒71型柯萨奇病毒A16型流行病学病原学
- SYBR GreenⅠ实时PCR检测乙脑病毒方法的建立与初步应用被引量：10
- 2007年
- 目的建立一种快速、特异的SYBR GreenⅠ实时PCR方法检测流行性乙型脑炎（乙脑）病毒。方法对SYBR GreenⅠ实时PCR检测乙脑病毒方法的反应条件、反应体系进行优化,同时与传统RT-PCR方法进行灵敏度比较,提高该方法的特异性、灵敏性。并用该方法对乙脑病毒毒株、登革病毒（Ⅰ-Ⅳ型）毒株、90份猪血清标本进行检测。结果SYBR GreenⅠ实时PCR与传统RT-PCR检测乙脑病毒方法的灵敏度无明显区别,但检测时间缩短了1/2。该方法可检测出乙脑病毒,不能扩增登革病毒,对90份猪血清标本检测结果均为阴性。结论建立的SYBR GreenⅠ实时PCR方法用于乙脑病毒检测具有特异、灵敏、快速等优点,可用于乙脑的病原学监测。
- 朱兆奎张曦滕峥赵百慧邵俊杰李燕婷卢伟
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒实时聚合酶链反应SYBR
