张曦
- 作品数：150 被引量：782H指数：13
- 供职机构：上海市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项上海市公共卫生体系建设三年行动计划上海市公共卫生重点学科建设项目更多>>
- 相关领域：医药卫生化学工程农业科学更多>>
- 上海地区2015—2018年产毒性大肠埃希菌毒力基因及定植因子携带特征分析被引量：1
- 2019年
- 【目的】分析上海地区2015—2018年产毒性大肠埃希菌(ETEC)毒力基因及定植因子(CF)的携带特征,为相关腹泻疾病防控及研究提供依据。【方法】采用多重荧光PCR的方法,对上海地区2015—2018年分离到的300株ETEC所携带的毒力基因(est,elt)及部分主要定植因子(CFA/I,CS1/PCFO71,CS2-8,CS12,CS14,CS17-19,CS21)进行检测,统计分析其在人群中的分布特征等。【结果】目标菌株中,57.00%(171/300)携带est基因,30.33%(91/300)携带elt基因,12.67%(38/300)同时携带est与elt基因;68.33%(205/300)的菌株根据所检测的14组定植因子可分为18种型别,其中最常出现的3种型别为13型(CS6,85/300),18型(CS21,65/300)和7型(CS2+CS3+CS21,17/300);出现频次最多的定植因子为CS21与CS6,其携带者在年龄分布上的差异有统计学意义,CS21携带者多为40岁及以下患者,而CS6多见于40岁以上的患者。【结论】上海地区2015—2018年检出的ETEC中est毒力基因比例较大;虽然不同年份间ETEC菌株携带的毒力基因和定植因子在构成上存在较大差异,但大多菌株携带的定植因子种类相对集中;其主要携带的定植因子为CS6(以elt为主)与CS21(均为est),并呈现出一定的年龄分布特征。
- 庄源罗嘉远陈涌高芬张曦陈敏
- 关键词：腹泻毒力基因
- 上海市松江区手足口病的病原学及序列特征的研究被引量：2
- 2014年
- 目的分析2010年-2012年上海市松江区手足口病的流行病学特征和主要病原体肠道病毒的基因型别。方法收集从松江区各医疗机构送检的疑似手足口病的样本,采用荧光定量RT-PCR方法对采集的1 207份HFMD进行肠道病毒(Enterovirus,EV)核酸检测;对部分EV71的VP1区进行序列测定和分析,用MEGA软件进行病毒基因特征分析,通过Blast服务器比对进行EV型别鉴定,通过序列比对了解松江区HFMD病毒的基因型别。结果松江区各乡镇均有病例报告,地区分布无显著特点;<5岁的婴幼儿为疾病高发年龄段;5月-7月为发病高峰期,肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)和柯萨奇A16(Coxsackie Virus 16,CoxA16)为主要病原体,基于VP1区序列分析表明松江区EV71毒株与C4a亚型毒株有最近的亲缘性和最高的同源性。结论 2010年-2012年上海市松江区流行的HFMD主要病原为EV71和CoxA16,其中EV71属于C4a亚型。
- 陆利君唐益明王嘉瑜陈洪友张曦杨丽华
- 关键词：肠道病毒71型手足口病VP1基因
- 上海市鼠伤寒沙门菌单相变异株的鉴定和耐药谱分析被引量：7
- 2018年
- 目的了解2013—2015年上海市流行的鼠伤寒沙门菌单相变异株的基因型和耐药谱。方法对2013—2015年上海市疾病预防控制中心细菌检测实验室保存的1 179株分离自腹泻患者的沙门菌进行血清分型复核,结合聚合酶链反应(PCR)筛选、鉴定鼠伤寒沙门菌单相变异株。采用PCR检测鼠伤寒沙门菌单相变异株基因型。采用改良纸片扩散法对鼠伤寒沙门菌双相株和单相株进行14种抗菌药物体外药物敏感性试验,参考美国临床实验室标准化协会(CLSI)标准判断结果。结果 1 179株沙门菌中共检出鼠伤寒沙门菌单相变异株52株,在沙门菌和鼠伤寒沙门菌中的阳性率分别为4.4%和23.3%,病例来源主要为上海郊区,且以青中年人群为主。在52株鼠伤寒沙门菌单相变异株中,有44株(84.6%)fljB基因缺失;在8株fljB基因未缺失株中,有2株(3.8%)基因型为fljB+fljA-hin-,6株(11.6%)为fljB+fljA+hin+。药物敏感性试验结果显示,耐3类以上抗菌药物的单相株有40株(76.9%),耐4类以上抗菌药物的单相株有36株(69.2%),并且鼠伤寒沙门菌单相株对氨苄西林-链霉素-磺胺类药-四环素(ASSu T)的耐药率(61.54%)和对氨苄西林-氯霉素-链霉素-磺胺类药-四环素(ACSSu T)的耐药率(19.23%)均远高于双相株(10.6%)(P<0.05)。结论上海市鼠伤寒沙门菌单相变异株检出率较高且人群分布不均,多重耐药性严重,在疾病防控中应注意合理布局资源和使用药物。
- 吴雯屠丽红张雯霞张曦陈敏
- 关键词：鼠伤寒沙门菌耐药性基因型
- 人感染H7N9禽流感病毒的抗体反应
- 研究背景:2013年3月,在我国上海和安徽等地发现了一种新型禽流感病毒—H7N9的流行,随后在多个省份发现相关病例。鉴于H7N9病毒具有引发大流行的风险,了解机体对这种新病毒的免疫反应特征,对于揭示其致病机制以及指导疫苗...
- 郭丽张曦任丽丽俞雪莲陈丽娟周红莉高昕滕正李建国胡佳玉吴超肖霞朱依依王全意庞星火金奇吴凡王健伟
- 关键词：抗体反应中和抗体血凝抑制试验
- 文献传递
- 一株2011年出现的季节性甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因特性的研究
- 2012年
- 本文通过比较2011年分离培养的1株季节性甲型H1N1流行性感冒(简称流感)病毒(A/Shanghai/1167/2011(H1N1))与历年季节性甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)基因,追溯该病毒的基因变异与来源,探讨该毒株的出现对流感防控工作的意义。采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增病毒的HA和神经氨酸酶(NA)片段,并进行测序;应用分子生物学软件对获得的序列进行分析,绘制基因进化树;同时,通过血凝抑制试验检测2011年下半年健康人群中该流感病毒的抗体水平。结果显示,A/Shanghai/1167/2011(H1N1)的HA基因序列与世界卫生组织(WHO)2007～2008年季节性甲型H1N1流感病毒疫苗株A/Brisbane/59/2007(H1N1)最接近,同源性达99.2%,与新型甲型H1N1流感病毒A/California/07/2009疫苗株同源性仅为72.4%。其HA基因裂解位点为PSIQSR↓GLF,尚未出现高致病性的分子特征。HA片段共编码557个氨基酸,有9个潜在的糖基化位点,序列与2009年前WHO疫苗株A/NewCaledonia/20/1999(H1N1)、A/SolomonIslands/3/2006(H1N1)和/Brisbane/59/2007(H1N1)相比,分别有15、12和4处不同,这些差异分布在Sa、Sb、Ca1、Ca2、Cb5个抗原决定簇的氨基酸差异分别有5、5和2处。该毒株在健康人群血清的抗体阳性率为34.33%,几何平均效价(GMT)为10.38。A/Shanghai/1167/2011(H1N1)是2011年出现在上海地区的一个季节性甲型H1N1流感病毒毒株,其抗原变异与既往季节性甲型H1N1流感病毒相比不大,但在以A(H1N1)pdm09为主要流行株的年份检测到散在发生的既往季节性甲型H1N1流感病毒毒株应当引起重视,其在人群中的抗体水平较低,易引起流行,需要提高对类流感人群中此种毒株的持续监测。
- 沈佳仁赵百慧高烨俞雪莲王嘉瑜袁政安吴凡谢晓红陶力新张曦
- 关键词：流行性感冒病毒
- 耻垢分枝杆菌中DNA损伤与SOS反应的实验研究被引量：2
- 2014年
- 目的探讨基因毒性物质介导的DNA损伤引起分枝杆菌SOS反应的作用。方法选择耻垢分枝杆菌为分枝杆菌模式细菌,通过紫外线损伤试验检测耻垢分枝杆菌对紫外线的敏感性,通过2倍稀释法测定利福平和氧氟沙星的最小抑菌浓度(MIC)。分别用紫外线和次抑菌浓度(1/2MIC)抗生素处理耻垢分枝杆菌,在不同时间点收集菌液,以看家基因sigA为内参,采用实时定量PCR相对定量方法检测dnaE2、recA和recX等SOS基因表达水平的变化。结果紫外线暴露45s后耻垢分枝杆菌的存活率为50%,利福平和氧氟沙星的MIC分别是32μg/ml和1μg/ml。耻垢分枝杆菌dnaE2和recX等SOS基因表达水平在紫外线下暴露45s后即开始上升,recA的表达水平在紫外线暴露3h后显著上升。耻垢分枝杆菌dnaE2和recX基因表达水平在1/2MIC的利福平作用后1h或在1/2MIC的氧氟沙星作用0h后上升,recA的表达水平在1/2MIC的利福平或氧氟沙星作用3h时显著升高。结论紫外线、抗生素等基因毒性物质可以导致耻垢分枝杆菌DNA损伤及SOS基因表达水平上升。
- 吴雯梅建沈鑫张曦陈敏
- 关键词：耻垢分枝杆菌基因损伤RECA
- 用于脉冲场凝胶电泳指纹图谱分析的分区条带计数法的建立被引量：1
- 2014年
- [目的]建立操作简便、软件依赖性低、结果易于交流的脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱分析新方法。[方法]按PulseNet标准操作规程,对44株副溶血性弧菌进行PFGE分型试验,分别利用分区条带计数法和BioNumerics软件对图谱进行分析,并以型别数、成簇数和Simpson’s多样性指数(DI)对2种分析方法进行比较。[结果]分区条带计数法可将44株菌分为32个型(DI=97.6%),能发现5簇。BioNumerics聚类分析可分为29个BN型(DI=95.5%),能发现4簇。在发现菌株成簇的能力上,2种分析方法的差异无统计学意义。[结论]条带计数法能大大减少肉眼观察的图谱数量,具有操作简便、成本低、对软件依赖性小、结果显示简单直接的特点,能直观反映菌株条带的分布特征,因此应能满足分型信息共享与交流的要求。
- 陈洪友屠丽红陈敏宋元君张曦
- 关键词：分子分型指纹图谱脉冲场凝胶电泳
- 2019—2020年上海市住院儿童病例发热呼吸道症候群病原谱研究被引量：7
- 2022年
- 目的了解上海市儿童住院病例中呼吸道症候群的病原谱及临床特征,为疾病的预防及临床诊断提供参考。方法利用荧光定量PCR结合熔解曲线的判定方法对634份下呼吸道吸取物标本进行22种病原体检测,采用卡方检验对不同检出率进行统计分析。结果在634份住院病例标本中,555份病原体核酸检测阳性,总阳性率为87.54%,检出的病原体主要为肺炎支原体(mycoplasma pneumonia,MP)、腺病毒(adenovirus,ADV)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)、甲型流感病毒(influenza virus A,FluA)及博卡病毒(bocavirus,BoV);多重感染的比率大于单一感染,多重感染的病原体类型是ADV、RSV、FluA或者BoV伴MP共感染;在年龄分布中,FluA在"<2岁"和"2~5岁"这两个年龄组检出率较高,RSV在"<2岁"年龄组的检出率明显高于其他两个年龄组,而冠状病毒在"2~5岁"和">5岁"的检出率要高于"<2岁"年龄组;结合临床症状的分析显示,RSV在非发热患者中的检出率高于发热患者的检出率,RSV及PIV在咳嗽患者的检出率高于非咳嗽患者的检出率,RSV在喘息患者中的检出率高于非喘息患者,RSV及FluA中的H3N2引起肺炎的概率较大;FLuA、FluB及RSV具有明显的冬春季流行高峰。结论应加强对MP、ADV、RSV、FluA及BoV等呼吸道病原体的持续性监测,了解其流行特征及致病力的变化,为儿童中呼吸道疾病的防控提供科学依据。
- 王春赵雪滕峥秦惠宏顾浩翔张泓张曦
- 关键词：呼吸道感染呼吸道合胞病毒肺炎支原体
- 上海地区碳青霉烯耐药肠杆菌科细菌的分子生物学特性研究被引量：2
- 2021年
- 【目的】分析上海市腹泻患者肠道碳青霉烯耐药肠杆菌科细菌(CRE)的耐药特征和分子分型,为该耐药菌的监测及防控提供依据。【方法】收集上海市腹泻病监测系统23家哨点医院2018年1月—2019年12月肠道门诊患者的粪便或肛拭子样本800份,采用含1μg/μL美罗培南的麦康凯琼脂培养基分离CRE菌株。使用VITEK-2 Compact全自动细菌鉴定系统和VITEK MS质谱系统进行菌种鉴定。采用微量肉汤稀释法检测菌株的最小抑菌浓度(MIC)。采用多位点序列分型(MLST)及脉冲场凝胶电泳(PFGE)对耐药菌株进行同源性分析。通过接合实验研究耐药基因的可转移性。采用全基因组测序进行耐药分子特征研究。【结果】从800份粪便或肛拭子标本中分离出7株CRE菌株,皆为产新德里金属β-内酰胺酶(NDM)的多重耐药大肠埃希菌,对多种临床常用的抗生素均耐药。分子分型结果显示,CRE菌株序列型别均不相同,PFGE呈现多样性。bla_(NDM)基因均为阳性,包括bla_(NDM-5)和bla_(NDM-13),主要型别为blaNDM-5,并可通过接合转移至大肠埃希菌EC600。【结论】肠道分离碳青霉烯耐药菌株均为多重耐药大肠埃希菌,其耐药机制均为产NDM,同时携带bla_(NDM)及其他多种耐药基因。MLST显示菌株属于不同的克隆型。耐药基因可通过接合转移实现耐药基因的水平转移。
- 高芬陈涌庄源陈洪友罗嘉远张曦陈敏
- 关键词：碳青霉烯酶肠杆菌科
- 上海市松江区急性呼吸道感染儿童肠道病毒感染状况被引量：10
- 2017年
- 目的了解上海市松江区急性呼吸道感染(ARTI)儿童中肠道病毒(EV)感染情况。方法收集2015年1—12月因ARTI在松江区中心医院就诊患儿的鼻咽拭子标本1 048份,应用荧光Real Time-PCR法检测标本中EV感染状况,应用RD细胞对EV检测阳性的标本进行病毒分离。结果 1 048份标本中检出228例EV阳性,阳性检出率为21.76%,对EV阳性标本进行病毒分离,共分离到145例EV病毒毒株,分离率为63.60%(145/228)。5—6月共检出EV病毒83份,占全年EV检出总数的7.92%(83/1 048),选择病毒分离株中荧光Real Time-PCR检测Ct值较高的40株进行测序比对,其中27株为Cox B3型,7株为CoxA_4,3株为CoxA_6,3株为CoxA_(10)。6月龄~6岁年龄段的儿童EV检出率最高。结论 2015年上海市松江区ARTI儿童中EV感染占21.76%,主要以EV-B型为主。应用分子分型技术对儿童ARTI中的EV病原体进行监测研究,可为相关疾病的流行或暴发提供实验室依据,也可为本地区儿童ARTI的诊治提供实验依据。
- 陆利君杨丽华乔雪飞俞家莉崔晓青滕峥张曦
- 关键词：急性呼吸道感染肠道病毒
