赵峰
- 作品数：122 被引量：246H指数：8
- 供职机构：中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中国科学院“百人计划”更多>>
- 相关领域：环境科学与工程生物学电气工程理学更多>>
- DNA/RNA提取及处理方法对评价沉积物中纤毛虫分子多样性的影响
- 2022年
- 环境DNA(eDNA)技术结合高通量测序已广泛应用于评价微型生物多样性与群落构成。相较于eDNA,RNA在环境中易降解,环境RNA(eRNA)可更准确地反映群落近期生命活性状态。理论上,基于eRNA检获的生物多样性要低于eDNA检获的总体多样性。但前期已发表研究显示同一站点eDNA获得的多样性低于eRNA检获量,推测可能原因包括:1)样本量不同;2)RNA中存在DNA污染。为验证假设,本研究以陆架区2个站位沉积物中的纤毛虫为实验对象,系统性比较4种DNA/RNA提取方法:DNA直接提取(0.9 g沉积物),大样本量DNA直接提取(2 g),DNA洗脱法(2 g),RNA直接提取法(2 g);以及3种RNA提取后的处理方法:无DNA酶反转录,含DNA酶反转录,先纯化RNA再反转录。研究结果表明,大样本量(2 g)DNA直接提取法所检获的可操作分类单元(OTUs)约为小样本量(0.9 g)的2倍。相同样本量下,DNA洗脱法检获的OTUs最多,而DNA直接提取检获的OTUs低于有/无DNA酶反转检获的数量,先纯化再反转录所获得OTUs最少。就群落构成而言,DNA洗脱法和RNA纯化可有效降低浮游类群比例,可更真实展现底栖群落的构成。综上,建议使用DNA洗脱法评价沉积物中微型生物的总体多样性;采用eRNA研究具有生命活性的生物群落时,反转录之前可纯化RNA,以获得更加准确的具有生命活性的群落信息。
- 李龙召黄平平徐奎栋赵峰
- 关键词：EDNA纤毛虫分子多样性
- 一种快速去除与回收铬污染土壤中六价铬的方法
- 本发明公开了一种快速去除与回收铬污染土壤中六价铬的方法。本发明采用工业上廉价的高温烧制的碳材料，操作过程为：将最大含水量的碳材料埋在最大含水量的铬污染土壤中；24小时后将碳材料取出，放入水中超声洗脱1小时，回收六价铬；洗...
- 王超曹昌丽赵峰
- 文献传递
- 微生物燃料电池生物阴极被引量：18
- 2012年
- 微生物燃料电池(microbial fuel cells,MFCs)利用微生物处理废水的同时产电,是一种清洁可再生能源技术。近年来新兴起的生物阴极是指阴极室中的功能微生物附着在电极表面形成生物膜,电子由电极传递给微生物并发生相应的生物电化学反应;是微生物燃料电池研究的一个重要方向。本文根据厌氧、好氧操作体系的不同将生物阴极进行分类;归纳总结了微生物组成、电极和分隔材料的研究进展,探讨了生物阴极在去除污染物和生成高附加值产品中的实际应用,并提出了其将来发展的可能方向。
- 陈立香肖勇赵峰
- 关键词：微生物燃料电池生物阴极生物膜电极材料
- 近海水体环境DNA沉降对沉积物中纤毛虫分子多样性评估的影响被引量：2
- 2020年
- 在陆架海区沉积物中,DNA高通量测序技术可检获大量浮游寡毛类和舞毛类等非底栖纤毛虫,这些源于水体的环境DNA(eDNA)如何影响对沉积物中纤毛虫分子多样性的评估,以及影响程度如何尚不明确。本研究选取了黄海冷水团中的两个站位,通过提取水体和沉积物中DNA和RNA,并采用直接提取法和洗脱法提取沉积物DNA,结合DNA和cDNA测序技术,探讨了水体和沉积物中纤毛虫分子多样性的关系。研究表明,基于洗脱DNA法、直接提取DNA法和cDNA法获得的沉积物中纤毛虫OTUs数分别为451、312和324个,其中211个OTUs同时由三种方法检获;而164个OTUs仅通过洗脱DNA法检获,其中89%为相对丰度低于0.1%的稀有类群。直接提取DNA法所获的寡毛类和舞毛类序列数占比达46%,而在洗脱DNA法和cDNA法中占比仅为12%和10%。沉积物中检获的43%—71%的舞毛类和寡毛类OTUs与浅层水(<40m)共有,仅19%—29%与深层水(>40m)共有,且这些共有的OTUs可同时在浅层水中检获。本研究发现,对沉积物中纤毛虫分子多样性评价造成影响的浮游类群主要来自浅层水,洗脱DNA与cDNA测序均可显著降低浮游类群eDNA的影响。鉴于洗脱DNA法较之cDNA法操作更简便,且避免了反转录过程导致的偏差,因此推荐用于对近海沉积物中纤毛虫等真核微生物的分子多样性研究。
- 黄平平赵峰赵峰
- 关键词：纤毛虫海洋沉积物分子多样性
- 一株快速产脂肽解淀粉芽孢杆菌的筛选及其产物特性被引量：3
- 2015年
- 从新疆油田采出水中筛选获得1株快速产生物表面活性剂的芽孢杆菌菌株BQ-2。16S rRNA基因序列分析显示,该菌株与解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）的序列相似性为99%。以20 g·L-1的葡萄糖为碳源,5 g·L-1的Na NO3为氮源,BQ-2在好氧条件下培养8 h即可将发酵液的表面张力由69.7 m N·m-1降至25.9 m N·m-1;第20～24 h,表面活性剂产量迅速增加,在第40 h达到最高产量655.4 mg·L-1。薄层层析和红外光谱分析结果显示,BQ-2的发酵产物为脂肽类生物表面活性剂。该表面活性剂的临界胶束浓度（CMC）为30 mg·L-1,且对新疆原油等供试有机化合物具有较好的乳化活性。BQ-2发酵液在广泛的温度（20～121℃）、盐度（Na Cl浓度为30～250 g·L-1）和p H（4～12）条件下保持稳定活性。BQ-2产生表面活性剂迅速,产量较高,且产物环境稳定性好,在微生物采油和污染环境修复领域具有较大的应用潜力。
- 班允赫张潆月史荣久赵峰梁小龙韩斯琴张阳张颖
- 关键词：生物表面活性剂解淀粉芽孢杆菌脂肽快速发酵微生物采油
- 希瓦氏菌Shewallena oneidensis MR-1合成硒纳米棒被引量：2
- 2015年
- 【目的】探索采用希瓦氏菌合成硒(Se)纳米棒,并阐明合成底物Se(IV)的浓度与细菌培养时间对生物合成的影响。【方法】将希瓦氏菌Shewallena oneidensis MR-1接种至Luria-Bertani(LB)液体培养基,分别以Se(IV)浓度0.1、1、10和100 mmol/L的Na2SO3作为电子受体,厌氧培养并绘制生长曲线。再将希瓦氏菌接种到含最适Se(IV)浓度的LB培养基中,在厌氧培养后第24和72 h离心获取沉淀。采用扫描电镜、X射线能谱和X射线衍射对沉淀进行分析。【结果】在Se(IV)浓度1 mmol/L的培养基中培养24 h形成的纳米棒沉淀截面直径约80 nm,长度2-3μm。而培养72 h形成的沉淀较大,超出纳米物质范畴。采用X射线能谱和X射线衍射确定纳米棒组成为单质Se。【结论】本研究为生物合成Se纳米棒提供了一种可行的方法。希瓦氏菌最适宜在1 mmol/L Se(IV)浓度下以及在对数生长期大量合成Se纳米棒,具有潜在应用价值。
- 邓欢郑志勇赵峰
- 关键词：扫描电镜X射线衍射
- 全基因组重测序研究长期铬胁迫对希瓦氏菌MR-1的影响机制被引量：1
- 2019年
- 在实验室纯培养条件下,设计了希瓦氏菌MR-1在恒定浓度Cr(Ⅵ)和Cr(Ⅲ)环境中长期胁迫120d实验,探讨了胁迫后的菌株对Cr(Ⅵ)的还原能力和生长情况,采用电化学分析仪表征其电化学性质的变化,并且利用全基因组重测序技术分析了不同条件胁迫后不同阶段的菌株基因变异信息.结果表明,Cr(Ⅵ)长期胁迫下明显提高了菌株对Cr(Ⅵ)的耐受性和还原能力,在38h左右能完全还原初始Cr(Ⅵ)浓度55mg/L;在电位-0.2V还原峰附近,细胞色素c与核黄素的结合作用有明显差异;通过重测序结果发现, Cr(Ⅵ)长期胁迫下的菌株发生突变的基因点位明显高于Cr(Ⅲ)环境.Cr(Ⅲ)环境胁迫下的非同义突变基因主要集中在葡萄糖转化及合成相关功能的基因、编码呼吸链酶和合成ATP酶的相关基因、编码信号转导和跨膜转运蛋白相关基因,Cr(Ⅵ)环境胁迫120d后,主要涉及细胞膜组分基因,转运蛋白、信号转导相关基因,DNA合成、修复相关基因和氧化还原活性相关.
- 肖长烨肖勇赵峰
- 关键词：电化学性质
- 基因工程菌Pseudomonas stutzeri ER厌氧产鼠李糖脂培养基优化及物模驱油效果
- 赵峰满都拉史荣久梁小龙韩斯琴张颖
- 微氧环境中电化学活性微生物的分离与鉴定被引量：2
- 2014年
- 电化学活性微生物在金属、碳等元素的生物地球化学循环,以及生物能源合成中具有重要作用.与微生物燃料电池厌氧阳极相比,微氧阳极能够捕集更多电能.但是相比于厌氧阳极中功能微生物的广泛研究,微氧阳极中的功能微生物还未被分离和研究.本研究采用传统好氧分离技术从微生物燃料电池微氧阳极分离获得3株纯菌Aeromonas sp.WS-XY2、Citrobacter sp.WS-XY3和Bacterium strain WS-XY4,其中WS-XY2和WS-XY3属于变形菌门,WS-XY4初步鉴定为新种.循环伏安、计时电流结果表明3株菌均具有电化学活性,且具有相似的直接胞外电子传递机制.3株菌在微生物分类学和电化学性质上的异同,表明微氧阳极能够定向筛选具有相似电化学性质的电化学活性微生物.微生物燃料电池微氧阳极具有更高效多样的功能微生物,可能是微氧阳极性能优于厌氧阳极的一个原因.因此,进一步针对微生物燃料电池微氧阳极中功能微生物的研究,将有助于阐明微氧阳极提高微生物燃料电池电能捕集的微生物机制.
- 吴松肖勇郑志勇郑越杨朝晖赵峰
- 关键词：微生物燃料电池循环伏安
- 电化学技术在水污染控制与资源化中的应用
- ＜正＞随着社会经济的迅猛发展,水环境资源受到了越来越多的破坏,排放到水中的污染物种类越来越多,对人类健康危害极大。水中污染物的监测应及时,准确全面的反映水的质量;同时,污染物的资源化是实现可持续社会发展的一个重要。20世...
- 赵峰
- 文献传递
