庄丽
- 作品数：56 被引量：195H指数：8
- 供职机构：贵州省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项贵州省科技计划项目贵州省卫生厅科学技术基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 2013-2014年度贵州省冠状病毒感染状况调查
- 目的对贵州省呼吸道症候群病例的冠状病毒HCOV-OC43型、HCOV-229E型、HCOV-HKU1型、HCOV-NL63型、SARS-COV冠状病毒和MERS-COV冠状病毒的感染状况进行检测。方法提取病毒核酸RNA,...
- 庄丽万永虎付琳郑勤妮
- 关键词：冠状病毒
- 文献传递
- 贵州省2014-2017年H7N9禽流感病毒HA和NA基因特征分析被引量：4
- 2018年
- 目的 分析2014－2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因的分子特征和感染风险。方法 对2014－2017年贵州省获取的18例确诊人感染H7N9病例和6份环境样本分离的H7N9病毒株的HA和NA基因进行扩增，运用生物信息学软件解析其变异和遗传进化。结果 2014－2015年贵州省2株毒株与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013疫苗株HA和NA基因的同源性最高，分别为98.8%～99.2%和99.2%；2016年2株和2017年14株与A/Hunan/02650/2016疫苗株同源性最高，分别为98.2%～99.3%和97.6%～98.8%；2017年其余6株与A/Guangdong/17SF003/2016疫苗株同源性最高，为99.1%～99.4%和98.9%～99.3%。所有毒株均属于长江三角洲分支，但主要聚集为3个次分支。2017年贵州省西部有6株毒株（含2例人感染病例毒株）裂解位点存在插入突变为PEVPKRKRTAR↓GLF，具备高致病性禽流感病毒的分子特征；受体结合关键位点存在A134V、G186V和Q226L突变，NA蛋白颈区“QISNT”均缺失，毒株A/Guizhou-Danzhai/18980/2017发生耐药突变R294K，9株毒株NA蛋白糖基化位点发生NCS42NCT突变。结论 2014－2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因存在遗传差异，关键位点的变异增强了病毒对人体的易感性和毒力，部分毒株发生耐药突变，其感染与致病风险增加。
- 万永虎庄丽郑勤妮任丽娟付琳蒋维佳唐光鹏张德著李世军
- 关键词：血凝素基因神经氨酸酶基因分子特征
- 贵州省2016年两起乙型流行性感冒暴发疫情病毒血凝素基因特性分析被引量：3
- 2016年
- 目的了解2016年贵州省乙型流行性感冒（流感）暴发疫情毒株变异情况，比较其与WHO推荐的疫苗株和我国代表株的匹配情况。方法将2016年贵州省铜仁地区两起流感暴发疫情病例标本中分离得到的8株毒株血凝素（HA）1基因进行扩增和序列测定，通过DNAStar等生物信息学软件对测序产物进行分析。结果2016年两起流感暴发疫情均由乙型Victoria系（BV）病毒引起。分离株核苷酸和氨基酸同源性分别是99.8%～100.0%和99.5%～100.0%，仅部分毒株的247位点发生变异；与参考株B/Victoria/2/87相比，同源性分别是91.8%～92.0%和91.5%～92.0%，有17处氨基酸位点发生了变异，其中I143V、V163I、V201I这3个位点分别涉及到了主要的抗原决定簇的B、C、D三个区域。与既往的疫苗株B/Brisbane/60/2008相比，同源性分别为98.2%～98.3%和98.5%～99.0%，有3个位点发生变异。所有毒株I143V和N155D均发生变异，部分毒株T247I发生变异，其中I143V涉及到抗原决定簇B区。与我国代表株B/Chongqing-Yuzhong/1384/2010相比，同源性分别是96.7%～96.8%和97.0%～97.5%，有6个位点发生了变异，其中有5个位点分别发生了P84L、I143V、N155D、V172I和T223N的变异，部分毒株T247I发生变异，其中I143V也涉及到B区。与2015年贵州省流行的毒株相比，同源性分别为99.8%～100.0%和99.5%～100.0%，只有部分毒株在位点247发生了变异，且未涉及到主要的抗原决定簇区域。结论贵州省两起流感暴发疫情由BV系同一流行株引起，其HA基因在不断地发生变异，但未出现新的重要位点的变异，与WHO推荐的既往疫苗株B/Brisbane/60/2008匹配性相对较高，继续使用对BV系病毒能起到积极的预防作用。
- 万永虎郑勤妮庄丽任丽娟付琳田飞肖艳芳唐光鹏李世军
- 关键词：流感病毒B型暴发疫情血凝素类基因特性
- 贵州省H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因遗传特性分析
- 2021年
- 目的了解贵州省H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的流行与遗传变异情况,为AIV的防控提供依据。方法统计2018年10月—2019年3月贵州省活禽市场外环境AIV检出情况,对选取的H9N2亚型AIV进行基因组的提取、血凝素(hemagglutinin,HA)基因的RT-PCR扩增与测序,并对获得的HA基因序列进行同源性、遗传进化和关键位点变异分析。结果贵州省活禽市场外环境AIV检出率为52.2%,H9N2占阳性的83.7%。H9N2亚型AIV HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.6%~100.0%和91.0%~100.0%,均属于Y280亚系,G57基因型;与致病性相关的裂解位点序列均为PSRSSRGLF和LSRSSRGLF,符合低致病性AIV的分子特征;与宿主特异性相关的受体结合关键位点存在H191N、E198T/A和Q234L三个位点的突变,具有人样受体结合特征;与毒力相关的糖基化位点均具有7个,其中因突变218位点均存在一个糖基化位点缺失,313位点均存在一个增加。与人感染毒株相比关键位点未发生重要突变。结论贵州省活禽市场外环境AIV检出率较高,污染较严重,且以H9N2为优势流行亚型;H9N2亚型AIV均属于Y280亚系,G57基因型,为低致病性AIV,毒株遗传差异在增大,关键氨基酸位点存在变异,具有感染人的风险,故应加强监测该病毒的分子遗传变异情况。
- 万永虎郭华庄丽任丽娟郑勤妮蒋维佳牟鸿江李世军
- 关键词：H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因
- 醛化红细胞应用的概述被引量：3
- 2015年
- 试剂红细胞由于两方面的原因而被广泛应用：一是作为红细胞抗原直接参与抗原抗体反应,如血型分型、未知抗体的筛选与鉴定等;二是作为指示细胞,能够指示血凝（hemagglutination,HA）和血凝抑制（hemagglutination inhibition,HI）试验的结果[1]。但在应用过程中,通常都是采用新鲜红细胞。
- 万永虎杨桃梅张德著郑勤妮庄丽蒋维佳唐光鹏王昭孝
- 关键词：醛化抗原抗体反应血凝抑制免疫监测减蛋综合征
- 2008--2009年肠道病毒71型贵州省分离株的基因特征分析被引量：1
- 2010年
- 肠道病毒71型（EV71）感染主要引起手足口病，近年来，EV71病毒的流行在亚太地区呈上升趋势，其中最令人关注的就是EV71的流行引起患儿的神经症状甚至死亡。贵州省自该病纳入法定传染病管理以来发现2009年感染EV71的患儿及重症病例比2008年多。
- 阎岩王定明庄丽庄妍胡静蒋维佳
- 关键词：肠道病毒71型基因特征EV71病毒分离株传染病管理
- 贵州省首例人感染高致病性禽流感H7N9突变株血凝素分子特征与溯源分析被引量：1
- 2018年
- 目的了解贵州省人感染H7N9禽流感病毒血凝素（hemagglutinin, HA）基因的分子特征、溯源和疾病风险，为高致病性禽流感H7N9病毒的预防和控制提供依据。方法采用实时PCR对5株高致病性禽流感H7N9毒株标本（1株人感染鼻咽拭子标本，4株活禽市场环境标本）进行核酸的提取、HA基因的扩增和测序，运用生物信息学软件对H7N9禽流感病毒HA基因的同源性、遗传进化、受体结合关键位点、致病相关位点和糖基化位点变异情况进行分析。结果贵州省威宁县人感染H7N9禽流感病毒HA基因与当地活禽市场环境中H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%和99.6%，而4株活禽市场环境中的H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为100.0%和100.0%。与2017年广西人感染的A/Guangxi/5/2017毒株同源性最高，分别为99.7%～99.9%和99.4%～99.8%；与2016年底广东环境中分离的毒株A/Environment/Guangdong/ C16283222/2016同源性为99.0%～99.2%和98.9%～99.2%，而与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013候选疫苗株的同源性为96.8%～97.0%和95.8%～96.2%。与广西毒株A/Guangxi/5/2017遗传进化距离最近。5株毒株HA蛋白裂解位点突变为PEVPKRKRTAR↓GLF，为高致病性禽流感突变株；受体结合关键位点均发生了G186V的突变，均未发生Q226L突变，5株毒株均发生的新突变为A363S，仅感染人的毒株发生的突变是R56K和I297V；5个潜在糖基化位点中仅421NWT和493NNT发生位置后移的变异。结论贵州省威宁县5株H7N9禽流感病毒均为高致病性禽流感突变株，候选疫苗株匹配保护效果可能已经降低，HA蛋白裂解位点、G186V和新的突变位点的变异可能增强了H7N9禽流感病毒对人体的易感性和致病性。
- 万永虎杨桃梅郑勤妮庄丽任丽娟付琳米飞唐光鹏李世军
- 关键词：血凝素基因分子特征
- 贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列分析
- 2011年
- 目的对贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列进行分析。方法提取核酸,PCR扩增,测序分析、比对。结果同源性分析和系统发育树都说明了相同(或相近)年份的毒株核苷酸序列同源性较高,亲缘关系较近;不同年份的毒株核苷酸序列的同源性较低,亲缘关系较远;3株H3N2毒株共有59各位点核苷酸替换。结论通过序列测定分析,结果表明1995-2005年纵向比较,贵州省甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列发生了变异;通过与Genbank上相应年份标准株横向比较,贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列未发生大的变异,仅有少数核苷酸的替换。
- 庄丽庄妍阎岩胡静付琳
- 贵州省A(H1N1)亚型流感病毒HA基因系列分析
- 2011年
- 目的了解贵州省A(H1N1)流感病毒血凝素抗原的基因变异情况。方法对贵州省分离的部分A(H1N1)流感病毒株利用聚合酶链反应进行扩增,将扩增产物进行序列测定,然后进行基因系列分析。结果 2001-2005年贵州省分离的A(H1N1)流感病毒株有以下位点发生变异:202G(R、203D(N、225R(K2、68M(R。202、203(RBS的左侧壁)、225在受体结合位点。结论我省2001-2005年分离的A(H1N1)流感病毒株基因特性已发生变异。
- 庄妍庄丽胡静阎岩王定明
- 关键词：流感病毒A型血凝素基因抗原性
- 2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及NA基因遗传特性分析
- 2021年
- 目的分析2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及神经氨酸酶(Neuramini dase,NA)基因的遗传特性,为H3N2亚型流感病毒的防控提供科学依据。方法采集2017-2019年贵州省13家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本,进行荧光定量PCR的检测,以自然年度为监测周期进行统计分析。H3N2亚型核酸阳性的标本进行狗肾胚细胞(MDCK)分离病毒,收集培养液提取病毒RNA,进行RT-PCR特异性NA基因扩增,扩增产物纯化后进行测序,用MAGE7.0软件和Clustal W2软件进行同源性、遗传进化和耐药位点分析。结果2017-2019年,贵州省采集ILI咽拭子标本分别为15553、15164和15348份,H3N2亚型阳性率分别为5.12%(797/15553)、0.80%(122/15164)和7.67%(1177/15348),呈交替流行趋势;高峰期主要出现在1-3月和10-12月。2017-2019年H3N2亚型NA基因核苷酸同源性为97.5%~100%,在进化树上主要分成2个分支,所有毒株NA基因关键位点均未发生突变。结论贵州省H3N2亚型流感病毒呈年度周期性流行,多发于冬春季节,为更好防控流感,应及时掌握流行趋势,需加强监测并及时分析病毒基因特征变异情况。
- 郑勤妮庄丽任丽娟万永虎
- 关键词：流感病毒H3N2亚型NA基因
