付琳 作品数:34 被引量:112 H指数:6 供职机构: 贵州省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 贵州省自然科学基金 贵州省卫生厅优秀医学青年科技人才基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列分析 2011年 目的对贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列进行分析。方法提取核酸,PCR扩增,测序分析、比对。结果同源性分析和系统发育树都说明了相同(或相近)年份的毒株核苷酸序列同源性较高,亲缘关系较近;不同年份的毒株核苷酸序列的同源性较低,亲缘关系较远;3株H3N2毒株共有59各位点核苷酸替换。结论通过序列测定分析,结果表明1995-2005年纵向比较,贵州省甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列发生了变异;通过与Genbank上相应年份标准株横向比较,贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列未发生大的变异,仅有少数核苷酸的替换。 庄丽 庄妍 阎岩 胡静 付琳贵州省2000-2010年流行性感冒监测结果与分析 被引量:1 2015年 目的对贵州省2000-2010年流行性感冒(简称"流感")监测结果进行分析,了解其病原学变化趋势,为防控工作提供科依据。方法收集贵州省2000-2010年流感疫情、监测资料、调查报告等,运用流行病学方法进行分析。结果贵州省2000-2010年共分离流感病毒306株,B型占36.93%,甲型H1N1型占25.82%,季H1型占24.51%,季H3型占10.46%。15 197份流感样病例标本,PCR检测阳性率30.70%,A未分型占42.91%,甲型H1N1占36.67%,季H1占0.66%,季H3占9.95%,B型占9.07%,混合型占0.71%。204起暴发(聚集性)疫情中,甲型H1N1型占59.02%,A未分型占17.07%,季H3型12.68%,B型占7.32%,季H1型占3.9%。在甲型H1N1流感流行期,采集贵阳市人群血清本1 678份,甲型H1N1感染阳性率19.19%,流行后期采集14 228人血清标本,抗体阳性率26.66%。结论开展流感监测,及时发现流感病毒的构成变化及新型病原,对指导防控工作有着重要的公共卫生学意义。 唐光鹏 雷明玉 王定明 庄丽 付琳 任丽娟 黄艳 庄妍 胡静 牟霞 吴昊关键词:流行性感冒 病原学 血清学 PCR技术 2012~2014年贵阳市B型流感监测结果分析 被引量:2 2016年 目的:了解2012-2014年贵阳市B型流感流行趋势,为防控B型流感提供科学依据。方法:采集流感样病例(ILI)的咽拭子,使用实时荧光定量PCR方法对流感样病例(ILI)咽拭子样进行检测。收集2012-2014年流感监测资料进行分析。结果:监测了4936份流感样病例样本,其中阳性161份,各年龄段均易感,其中30岁以下病例126份,占总阳性的78.26%。结论:2012-2014年间贵阳市B型流感主要在早冬春季流行,在流感中检出率呈逐年下降趋势,30岁以下病例占总流感阳性78.26%,揭示了贵阳市B型流感流行趋势,为贵阳市B型流感防控提供科学依据。 付琳 任丽娟 蒋维佳 庄丽 郑勤妮 万永虎 胡静 李世军 唐光鹏关键词:流感样病例 流感监测 B型流感 外周血HIV-1 DNA在艾滋病疗效评估中的应用 被引量:1 2021年 目的通过研究HIV感染者HIV-1 DNA与HIV-1 RNA及CD4^(+)T淋巴细胞间的关系,探讨外周血HIV-1 DNA在艾滋病疗效评估中的应用。方法筛选2018年6—9月贵州省贵阳市公共卫生救治中心的HIV感染者80例,采用面对面问卷调查收集患者资料,并采集患者K2EDTA抗凝血,完成CD4^(+)T淋巴细胞、HIV-1 RNA及HIV-1 DNA的检测并得出结果。通过SPSS等软件分析HIV感染者的病毒库水平,以及HIV-1 DNA与HIV临床分期、CD4^(+)T淋巴细计数及HIV-1 RNA的相关性。结果HIV感染者CD4^(+)T淋巴细胞数量越多,HIV-1 RNA含量越低,其全血中HIV-1 DNA的水平越低,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论HIV-1 DNA可反映抗逆转录病毒治疗(HAART)期间病毒库水平,提示疾病进展情况,评价治疗效果,可为贵州省艾滋病的治疗提供更精准的监测手段。 方星 张信辉 刘水青 郑燕 杨兴林 付琳 柳兴凤关键词:人类免疫缺陷病毒 抗逆转录病毒治疗 2013-2014年度贵州省冠状病毒感染状况调查 目的对贵州省呼吸道症候群病例的冠状病毒HCOV-OC43型、HCOV-229E型、HCOV-HKU1型、HCOV-NL63型、SARS-COV冠状病毒和MERS-COV冠状病毒的感染状况进行检测。方法提取病毒核酸RNA,... 庄丽 万永虎 付琳 郑勤妮关键词:冠状病毒 文献传递 贵州省2014-2017年H7N9禽流感病毒HA和NA基因特征分析 被引量:4 2018年 目的 分析2014-2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因的分子特征和感染风险。方法 对2014-2017年贵州省获取的18例确诊人感染H7N9病例和6份环境样本分离的H7N9病毒株的HA和NA基因进行扩增,运用生物信息学软件解析其变异和遗传进化。结果 2014-2015年贵州省2株毒株与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013疫苗株HA和NA基因的同源性最高,分别为98.8%~99.2%和99.2%;2016年2株和2017年14株与A/Hunan/02650/2016疫苗株同源性最高,分别为98.2%~99.3%和97.6%~98.8%;2017年其余6株与A/Guangdong/17SF003/2016疫苗株同源性最高,为99.1%~99.4%和98.9%~99.3%。所有毒株均属于长江三角洲分支,但主要聚集为3个次分支。2017年贵州省西部有6株毒株(含2例人感染病例毒株)裂解位点存在插入突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,具备高致病性禽流感病毒的分子特征;受体结合关键位点存在A134V、G186V和Q226L突变,NA蛋白颈区“QISNT”均缺失,毒株A/Guizhou-Danzhai/18980/2017发生耐药突变R294K,9株毒株NA蛋白糖基化位点发生NCS42NCT突变。结论 2014-2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因存在遗传差异,关键位点的变异增强了病毒对人体的易感性和毒力,部分毒株发生耐药突变,其感染与致病风险增加。 万永虎 庄丽 郑勤妮 任丽娟 付琳 蒋维佳 唐光鹏 张德著 李世军关键词:血凝素基因 神经氨酸酶基因 分子特征 贵州省首例人感染高致病性禽流感H7N9突变株血凝素分子特征与溯源分析 被引量:1 2018年 目的了解贵州省人感染H7N9禽流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因的分子特征、溯源和疾病风险,为高致病性禽流感H7N9病毒的预防和控制提供依据。方法采用实时PCR对5株高致病性禽流感H7N9毒株标本(1株人感染鼻咽拭子标本,4株活禽市场环境标本)进行核酸的提取、HA基因的扩增和测序,运用生物信息学软件对H7N9禽流感病毒HA基因的同源性、遗传进化、受体结合关键位点、致病相关位点和糖基化位点变异情况进行分析。结果贵州省威宁县人感染H7N9禽流感病毒HA基因与当地活禽市场环境中H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%和99.6%,而4株活禽市场环境中的H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为100.0%和100.0%。与2017年广西人感染的A/Guangxi/5/2017毒株同源性最高,分别为99.7%~99.9%和99.4%~99.8%;与2016年底广东环境中分离的毒株A/Environment/Guangdong/ C16283222/2016同源性为99.0%~99.2%和98.9%~99.2%,而与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013候选疫苗株的同源性为96.8%~97.0%和95.8%~96.2%。与广西毒株A/Guangxi/5/2017遗传进化距离最近。5株毒株HA蛋白裂解位点突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,为高致病性禽流感突变株;受体结合关键位点均发生了G186V的突变,均未发生Q226L突变,5株毒株均发生的新突变为A363S,仅感染人的毒株发生的突变是R56K和I297V;5个潜在糖基化位点中仅421NWT和493NNT发生位置后移的变异。结论贵州省威宁县5株H7N9禽流感病毒均为高致病性禽流感突变株,候选疫苗株匹配保护效果可能已经降低,HA蛋白裂解位点、G186V和新的突变位点的变异可能增强了H7N9禽流感病毒对人体的易感性和致病性。 万永虎 杨桃梅 郑勤妮 庄丽 任丽娟 付琳 米飞 唐光鹏 李世军关键词:血凝素基因 分子特征 贵州省黔东南州职业暴露人群禽流感病毒感染状况调查 2013年 禽流感(avian influenza,AI)是由A型流感病毒引起的一种禽类感染综合征或疾病综合征。禽流感的发病情况取决于病毒的致病性及宿主的易感性,也受环境因素、饲养营养条件及并发疾病等因素的影响,可变现为无症状感染、轻度的上呼吸道症状、产蛋量下降到急性致死性死亡[1]。 任丽娟 庄丽 付琳关键词:禽流感病毒 职业暴露人群 INFLUENZA A型流感病毒 上呼吸道症状 贵阳市2012-2015年B型流行性感冒病毒血凝素基因特性分析 被引量:6 2017年 目的了解2012-2015年贵阳市B型流行性感冒(以下简称流感)病毒的变异和流行特点,分析其与WHO推荐的疫苗株和我国的代表株匹配情况。方法将21份标本进行血凝素基因片段1(haemagglutinin 1,HA1)基因序列测定,通过DNA Star version 7.1等软件对测序产物进行分析。结果贵阳市B型流感病毒存在BY和BV两种谱系;核苷酸同源性显示,BV系与疫苗株B/Brisbane/60/2008的同源性为97.8%~99.3%;2013-2014年BY系与疫苗株B/Massachusetts/02/2012的同源性为96.2%~96.5%,与既往的疫苗株B/Wisconsin/01/2010同源性为99.0%~99.3%;2015年BY系与疫苗株B/PHUKET/3073/2013同源性为99.2%~99.5%;2012-2015年BV系与我国代表株B/Chongqing-Yuzhong/1384/2010同源性为96.8%~99.0%,BY系与种子疫苗株B/Hubei-Wujiagang/158/2009为98.2%~99.2%。与当年度疫苗株相比,2013-2014年BY系毒株有9个氨基酸位点发生变异,其中A134P位点涉及到抗原决定簇A区,N142K涉及到B区;2015年BY系毒株发生新的L198Q变异,且涉及到D区;BV系氨基酸位点替换多样,但很少涉及到抗原决定簇。结论 2012-2015年贵阳市人群中B型流感病毒在不断地发生改变,除2013-2014年疫苗株与流行株匹配性不佳以外,其余年度的匹配性均较好,能起到保护作用。 万永虎 张德著 郑勤妮 庄丽 任丽娟 付琳 唐光鹏 李世军关键词:流感病毒B型 血凝素类 基因 贵州省2016年两起乙型流行性感冒暴发疫情病毒血凝素基因特性分析 被引量:3 2016年 目的了解2016年贵州省乙型流行性感冒(流感)暴发疫情毒株变异情况,比较其与WHO推荐的疫苗株和我国代表株的匹配情况。方法将2016年贵州省铜仁地区两起流感暴发疫情病例标本中分离得到的8株毒株血凝素(HA)1基因进行扩增和序列测定,通过DNAStar等生物信息学软件对测序产物进行分析。结果2016年两起流感暴发疫情均由乙型Victoria系(BV)病毒引起。分离株核苷酸和氨基酸同源性分别是99.8%~100.0%和99.5%~100.0%,仅部分毒株的247位点发生变异;与参考株B/Victoria/2/87相比,同源性分别是91.8%~92.0%和91.5%~92.0%,有17处氨基酸位点发生了变异,其中I143V、V163I、V201I这3个位点分别涉及到了主要的抗原决定簇的B、C、D三个区域。与既往的疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,同源性分别为98.2%~98.3%和98.5%~99.0%,有3个位点发生变异。所有毒株I143V和N155D均发生变异,部分毒株T247I发生变异,其中I143V涉及到抗原决定簇B区。与我国代表株B/Chongqing-Yuzhong/1384/2010相比,同源性分别是96.7%~96.8%和97.0%~97.5%,有6个位点发生了变异,其中有5个位点分别发生了P84L、I143V、N155D、V172I和T223N的变异,部分毒株T247I发生变异,其中I143V也涉及到B区。与2015年贵州省流行的毒株相比,同源性分别为99.8%~100.0%和99.5%~100.0%,只有部分毒株在位点247发生了变异,且未涉及到主要的抗原决定簇区域。结论贵州省两起流感暴发疫情由BV系同一流行株引起,其HA基因在不断地发生变异,但未出现新的重要位点的变异,与WHO推荐的既往疫苗株B/Brisbane/60/2008匹配性相对较高,继续使用对BV系病毒能起到积极的预防作用。 万永虎 郑勤妮 庄丽 任丽娟 付琳 田飞 肖艳芳 唐光鹏 李世军关键词:流感病毒B型 暴发疫情 血凝素类 基因特性