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解涛
作品数:
13
被引量:121
H指数:6
供职机构:
中国科学院上海生命科学研究院生物化学研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
生物学
天文地球
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合作作者
丁达夫
中国科学院上海生命科学研究院生...
盛泉虎
中国科学院上海生命科学研究院生...
梁卫平
中国科学院上海生命科学研究院生...
叶玉珍
中国科学院上海生命科学研究院生...
陈洁
中国科学院上海生命科学研究院生...
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解涛
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丁达夫
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传媒
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生物物理学报
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生命科学
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科学通报
1篇
生物化学与生...
1篇
生命的化学
年份
2篇
2000
3篇
1998
2篇
1997
共
13
条 记 录,以下是 1-7
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相关度排序
被引量排序
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基因组序列的长程关联
被引量:2
1997年
用快速付立叶变换的谱分析方法研究了多种类型的基因组序列的长程关联性质。结果表明,含有内含子的序列有明显的长程关联,cDNA和编码区则没有此种表现;人的20余种基因组序列的长程关联随着内含子含量的增长呈正关联,而内含子含量超过80%后呈负关联。内含子的序列位置对长程关联亦有效应。
解涛
丁达夫
关键词:
基因组
基因组序列
同义密码子用语与蛋白质结构的关系
被引量:8
1998年
对大肠杆菌的54种三维结构已知的蛋白质及其对应的mRNA序列的集合的分析结果表明,绝大部分密码子与其编码的氨基酸在蛋白质α螺旋、β折叠和卷曲等三种二级结构中的偏好性没有显著的统计性差异。同时,又对Adzhubei提供的相应哺乳类数据集作了同样的偏好性检验,表明9种氨基酸的同义密码子携带蛋白质二级结构信息,与他们的结论一致。推测,这种差异可能由翻译机制的进化趋异造成的。这些结果对于真核基因在原核生物中实现高表达可能有重要的实际意义。
解涛
丁达夫
关键词:
蛋白质二级结构
蛋白质功能基团三维模体及其应用
被引量:6
2000年
用一维序列模体和三维结构模体刻画与识别蛋白质功能区是蛋白质功能预测和分子设计中的重要课题.目前三维模体的提取与搜索均以残基为单位进行,特异性有限.鉴于残基的功能基团才是其发挥功能的关键要素,提出以功能基团为单位来表征三维模体(称为功能基团三维模体),并发展了相应的搜索算法,用于阐释蛋白质功能的结构基础以及预测未知蛋白质的功能.以从胰蛋白酶(PDB代码为1mct)中提取的“三联体和氧穴”功能基团三维模体及其搜索为例,在整体结构极不相似的胰蛋白酶。枯草杆菌蛋白酶和α/β水解酶中均搜索到了此功能基团三维模体,为三者具有相似催化机制提供了解释.对一些具有“变异三联体”的酶亦能用此功能基团三维模体给予识别.对蛋白质结构库的搜索结果充分展示了其在功能预测中的应用.与其他三维模体搜索及序列模体搜索的结果相比较表明,功能基团三维模体是蛋白质功能区的更好的表示,在蛋白质功能预测中有更高的灵敏度。
叶玉珍
解涛
丁达夫
关键词:
蛋白质
后基因组时代的基因组功能注释
被引量:57
2000年
基因组功能注释是后基因组时代功能基因组学研究的热点领域 .从基因组功能注释的研究内容与研究手段出发 ,重点综述了生物信息学在该领域方法学上的研究进展 ,并展望了今后的发展前景 .
解涛
梁卫平
丁达夫
关键词:
后基因组时代
人类基因组计划
生命的第三界──三界学说的新发展
被引量:7
1997年
1977年,Woese提出生命体系应划分为三界。第一界是真核生物,第二界是原核生物,第三界是Archaea(古核生物)。产甲烷球菌(Methanococcusjannaschii)的全基因组序列测定为三界学说提供了可信的证据。
解涛
丁达夫
关键词:
生命科学
三界学说
蛋白质组信息学
被引量:25
1998年
生物信息学已经成为当代生物学和医药学的组成部分,用于巨量生物信息资源的收集、存储、处理、搜索、利用、共享、服务、研究和开发。它常由数据库、计算机网络和应用软件三大部分组成。在基因组计划中它已经发挥了不可取代的作用,而在蛋白质组计划中也日益成为强力的支...
丁达夫
盛泉虎
解涛
关键词:
质谱分析
蛋白质鉴定
数据库
蛋白质组
古核生物基因组的关联分析
1998年
以频谱分析和信息关联为分析工具,系统地考察了古核生物(Archaea)M.jannaschi的全基因组及数种真核和原核基因组的长程和短程关联特性。结果表明,古核生物的短程关联信号与真核生物的接近:即呈现10bp和11bp双峰周期信号;它的长程关联也存在。可见,古核生物的染色质包装过程和遗传信息的组织方式可能更象真核。此关联分析的结果为生命的三界学说提供了新的证据。
解涛
丁达夫
关键词:
基因组
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