程海亮 作品数:16 被引量:13 H指数:3 供职机构: 中国农业科学院棉花研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
棉花无腺体近等基因系差异表达基因分析 被引量:4 2015年 为了揭示棉花腺体发育的分子机制,本研究利用RNA-Seq对棉花无腺体性状近等基因系Z12/Z12YW的幼嫩叶片进行转录组测序,寻找差异表达基因。转录组测序结果表明,与有腺体棉Z12相比,无腺体棉Z12YW中共有306个基因表达发生变化,其中282个基因下调,24个基因上调。差异表达基因GO(Gene ontology)功能注释显示,细胞组分、胞外基质组分的功能变化以及细胞杀伤生物学过程在腺体形成过程中发挥重要作用;COG(Cluster of orthologous groups)功能和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路显著性富集发现,棉酚等萜烯物质的合成主要受甲羟戊酸途径上游基因的表达调控。此外,本研究共筛选到13个差异表达转录因子,可能在腺体发育和棉酚合成过程中发挥关键作用。 姜鹏飞 陆才瑞 邹长松 程海亮 杨文翠 冯晓旭 张友平 王巧连 宋国立关键词:腺体 近等基因系 转录组 与棉花显性无腺体基因Gl<Sub>2</Sub><Sup>e</Sup>紧密连锁的SSR标记及其应用 本发明公开了与棉花显性无腺体基因Gl<Sub>2</Sub><Sup>e</Sup>紧密连锁的SSR标记及其应用。所述SSR标记为BS4、BS5和BS6;所述SSR标记BS4的引物对BS4由序列表序列1和序列2所示的单链... 宋国立 陆才瑞 程海亮 黄娟 邹长松 张友平 王巧连 余道乾 姜鹏飞 杨文翠文献传递 枯草芽孢杆菌NCD-2与化学杀菌剂复配对棉花黄萎病的防治效果 被引量:1 2023年 【目的】研究枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)NCD-2与化学杀菌剂复配对棉花黄萎病的防治效果,为防治棉花黄萎病提供理论依据。【方法】以棉花黄萎病致病菌大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)强致病力菌株Vd080为研究对象,采用生长速率法测定戊唑醇、氟啶胺、咪鲜胺、代森锰锌和百菌清这5种杀菌剂的毒力;用对峙培养法测定NCD-2对Vd080的毒力;筛选出与NCD-2相容性好的杀菌剂,进一步采用Horsfall法确定菌药复配比例;在室内开展盆栽试验,评价不同复配处理对棉花黄萎病的防治效果(防效)。【结果】5种杀菌剂中咪鲜胺对Vd080的抑制效果最好,其有效中浓度为0.027 mg·L^(-1),戊唑醇和氟啶胺的抑制效果次之。NCD-2对Vd080的有效抑制中浓度为2.56×10^(7)mL^(-1)(菌体浓度,后同)。0.4 mg·L^(-1)氟啶胺与2.56×10^(7)mL^(-1)NCD-2的相容性最好,达到79.19%;2.0 mg·L^(-1)氟啶胺、0.02 mg·L^(-1)咪鲜胺次之,二者与2.56×10^(7)mL^(-1)NCD-2的相容性分别为71.29%和63.20%。2.56×10^(7)mL^(-1)NCD-2与0.4 mg·L^(-1)氟啶胺、2.0 mg·L^(-1)氟啶胺和0.02 mg·L^(-1)咪鲜胺分别按照体积比3∶7、9∶1和1∶1进行复配时,增效作用最强,对Vd080的抑菌效果最好。室内盆栽试验发现,2.56×10^(7)mL^(-1)枯草芽孢杆菌NCD-2与0.02 mg·L^(-1)咪鲜胺按体积比1∶1复配时,棉花黄萎病病情指数最低,防效最好(82.81%),具有很好的增效作用(增效系数为23.46)。【结论】2.56×10^(7)mL^(-1)枯草芽孢杆菌NCD-2与0.02 mg·L^(-1)咪鲜胺按体积比1∶1复配对棉花黄萎病有很好的防治效果,且具有明显的增效作用。 郑德有 左东云 吕丽敏 王巧莲 程海亮 顾爱星 宋国立关键词:棉花 黄萎病 枯草芽孢杆菌 杀菌剂 棉花纤维伸长相关基因GhCML17-1的克隆与结构分析 钙调蛋白(Camlmodulin,CaM),又称钙调素,是植物细胞中胞内Ca最重要的多功能感受体蛋白,属于EF手形家族钙结合蛋白。植物Ca激活CaM并进一步结合CaM靶蛋白后,产生结构上的变化从而行使相应的植物功能。本研... 刘媛媛 左东云 程海亮 张友平 吕丽敏 刘珂 王巧连 宋国立关键词:棉花 纤维伸长 陆地棉纤维发育起始相关基因GhGTP1的克隆与结构分析 棉花纤维是由棉花胚珠外表皮细胞分化发育而成的,但是目前对棉花纤维细胞分化起始的调控机理并不清楚。本研究通过RNA-seq分析了陆地棉徐州142的转录水平,发现了1个Rab GTPases在纤维发育起始时期高效表达,可能参... 左东云 程海亮 张友平 吕丽敏 刘珂 王巧连 宋国立关键词:陆地棉 信号传递 基于10个棉花腺体相关材料转录组的EST-SSR标记开发 被引量:5 2015年 棉花是重要的经济作物,但有毒棉酚的存在,使棉子得不到充分的利用,所以低酚棉育种是棉花育种的重要内容之一。色素腺体是棉酚的储存器官,开发功能型分子标记,加密棉花遗传图谱对色素腺体和其他重要性状相关基因的研究具有重要作用。本试验以10个有腺体和无腺体材料转录组信息为基础开发EST-SSR标记,在12895条1 kb以上的Unigene中共搜索到1546个SSR位点,发生频率和平均距离分别是11.99%和15.99 kb。得到的EST-SSR中,二碱基和三碱基重复是主要的重复类型,分别占30.85%和48.97%,AT/TA和GAA/CTT分别是二碱基和三碱基的优势重复类型。对长度≥20 bp的SSR共设计合成了56对引物,在这10个材料中进行检测,能扩增出清晰条带的有38对,占67.86%,其中呈多态性的有9对,占23.68%,并对其所在的Unigene功能和表达量进行了初步分析。本研究进一步证明了棉花EST-SSR标记开发的可行性,并且为棉花高密度遗传图谱和腺体相关基因的研究奠定了基础。 程海亮 陆才瑞 邹长松 余道乾 姜鹏飞 杨文翠 张友平 王巧连 宋国立关键词:棉花 色素腺体 棉花纤维伸长期基因GhEXPA1d的克隆及表达分析 棉花是最重要的经济作物之一,棉纤维是已知纤维素纯度最高的天然资源之一,在世界纺织工业中具有重要的经济地位。同时,棉花也是研究单细胞伸长机制的一种模式作物,棉纤维是由胚珠外珠被的单个表皮细胞发育而来,发育过程大致分为4个时... 吕丽敏 左冬云 张友平 程海亮 王巧连 宋国立关键词:棉花 亚洲棉纤维发育时期的转录组分析 棉花纤维是纺织工业中主要的天然纺织原料,棉花纤维和短绒的起始发育研究一直是棉花研究中的热点。本研究对亚洲棉DPL971及其光籽突变体DPL972开花后1、3和5 d的胚珠进行转录组测序并进行差异表达基因(Differen... 冯晓旭 程海亮 左东云 张友平 王巧连 吕丽敏 刘珂 李文倩 刘媛媛 宋国立关键词:棉花 转录组测序 差异表达基因 棉花功能基因组研究进展 被引量:3 2017年 棉花是重要的经济作物。近年来棉花功能基因组研究发展迅速,高通量测序技术应用于棉花研究,二倍体和四倍体棉花基因组测序陆续完成,棉花全基因组重测序及关联分析相继涌现,大量的棉花功能基因被分离鉴定。本文回顾了棉花功能基因组研究的历程,重点介绍了棉花基因组测序和棉花栽培品种全基因组关联分析相关研究成果,并总结了棉花纤维和腺体发育中的关键功能基因及棉花抗旱、抗盐碱等功能基因研究进展,为全面了解棉花重要农艺性状形成的遗传基础和棉花遗传改良提供理论参考。 左东云 叶武威 程海亮 王德龙 张友平 王俊娟 王巧连 陈修贵 陆许可 宋国立关键词:棉花 基因组测序 纤维发育 腺体 抗逆 棉花MYC基因家族鉴定及在色素腺体发育中的表达分析 MYC转录因子在拟南芥中参与植株的发育调控、逆境响应和次生代谢物的合成等。棉花中MYC转录因子也被证实有相似的功能,其中,已经报道了2个MYC转录因子与棉花色素腺体发育相关。本研究对棉花MYC转录因子进行全基因组鉴定,分... 程海亮 左东云 张友平 冯晓旭 吕丽敏 王巧连 宋国立关键词:棉花 色素腺体 MYC 基因表达