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中国药科大学生命科学与技术学院生物信息学教研室
作品数:
3
被引量:8
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相关领域:
生物学
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机构
3篇
中国药科大学
作者
3篇
方慧生
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彭敏
1篇
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1篇
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1篇
王旻
1篇
相秉仁
1篇
徐建平
1篇
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国外医学(药...
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2006
1篇
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酶功能分类与序列相似性研究进展
2006年
本综述就酶的序列与功能的关系在国际上最新研究进展进行了比较系统的阐述。基本的方法有Needleman-Wunsch算法、FASTA和BLAST等常见的比较序列相似性的方法。此外还介绍了最近几年出现的进化追溯法和局部三维模板法等方法。
彭敏
方慧生
基于常用得分矩阵的神经网络法预测蛋白质的二级结构
被引量:3
2006年
本文用常用的得分矩阵代替传统的Qian编码作为神经网络的输入层预测了200个蛋白质二级结构。结果表明:以常用得分矩阵作为输入层的预测结果要优于Qian编码的预测性能。在200个蛋白质中,共有9个蛋白质的预测精度达到目前国际先进水平,即80%。这说明该方法具有一定的可行性。
徐建平
方慧生
相秉仁
关键词:
神经网络
蛋白质二级结构预测
蛋白质天然构象预测的研究进展
被引量:5
2005年
继人类基因组计划完成后,如何弄清相应的基因序列的功能及其之间的关系,即比较彻底地解开生命的奥秘成为后基因组计划的主要任务。基因的功能最终主要通过蛋白质来完成,因此,如何根据已知的氨基酸序列来预测相应的蛋白质天然构象成为后基因组计划中最重要的组成部分之一,这为比较彻底界定其功能奠定分子生物学基础。本文从以下几个方面进行了详细地介绍:(1)组成蛋白质天然构象预测方法的基本元素即序列比对方法、构象空间搜索方法及有关的蛋白质数据库;(2)结构预测方法的评估与分类;(3)描述预测性能较好及有比较发展前景的预测方法;(4)天然构象预测的前景等。
方慧生
吴梧桐
王旻
余江河
郑珩
关键词:
CASP
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