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软鳍新光唇鱼MC4R基因多态性与生长性状关联性分析
2025年
【背景】软鳍新光唇鱼(Neolissochilus benasi)是重要的水产种质资源,但在培育过程中存在个体间生长速度差异较大的问题。【目的】筛选与软鳍新光唇鱼生长性状显著相关的分子标记,推动其生长性状的改良。【方法】本研究对与摄食、能量代谢、生长发育密切相关的黑素皮质素受体-4(MC4R)基因开展研究,通过PCR-Sanger测序技术进行单核苷酸多态性(SNP)检测和分型,并将SNP位点与其生长性状进行关联性分析,挖掘软鳍新光唇鱼生长性状关联的SNP标记。【结果】MC4R基因2个拷贝共存在15个SNP位点,其中第1个拷贝有1个SNP位点,第2个拷贝有14个SNP位点。15个SNP位点中仅G227A为错义突变,氨基酸类型由缬氨酸(V)变为异亮氨酸(I),其余位点均为同义突变;群体遗传分析结果显示,除第1个拷贝SNP位点G669C遗传参数值较低外,MC4R基因第2个拷贝的SNP位点期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)分别为0.860±0.027和0.503±0.001,多态信息含量(PIC)为0.373~0.375,属于中度多态性,表明该群体的遗传多样性处于中上水平;关联性分析显示,MC4R基因2个拷贝15个SNP位点中,13个位点对软鳍新光唇鱼的生长性状具有不同程度的影响:位点G227A、A322G、C364T、G403A、T451C、G457A、G472A、T484C、G520A、T583C、G736A、C775G与体长、体质量显著相关(P<0.05),且均以纯合子为优势基因型,分别为AA、GG、TT、AA、CC、AA、AA、CC、AA、CC、AA、GG型;位点C664T仅检测到CC和CT两种基因型,并以杂合子CT型为优势基因型,与体质量显著相关(P<0.05)。【结论】本研究初步筛选了15个与软鳍新光唇鱼生长性状相关联的候选SNP位点,为今后其生长相关机制和分子标记的进一步解析,以及生长性状的改良提供了科学依据。
唐智慧殷艳慧潘晓赋吴安丽张源伟王茉王晓爱
关键词:SNP
SEC16B、DNAJC27、FTO和MC4R基因多态性与汉族学龄前儿童超重肥胖的关联性
2024年
目的研究SEC16B基因rs633715、DNAJC27基因rs713586、FTO基因rs11642015和MC4R基因rs6567160多态性与汉族学龄前儿童超重肥胖的关联性。方法选取2022年来自“早期儿童营养包干预长期营养健康作用评估”项目监测点的河南省和贵州省749名2~6岁汉族儿童为研究对象,分成超重肥胖组和正常对照组。采用KASP SNP分型技术对rs633715、rs713586、rs11642015和rs6567160进行基因多态性检测。使用χ^(2)检验分析4个位点的基因型多态性分布,使用多因素Logistic回归模型分析4个位点与学龄前儿童超重肥胖的关联性。结果rs633715和rs6567160的基因型多态性在河南省和贵州省学龄前儿童中的分布有统计学意义(P<0.05)。rs633715位点的CC纯合突变型和隐性模型与学龄前儿童患超重肥胖的风险有关[OR及95%CI分别为2.915(1.163~7.305)和2.997(1.226~7.323),P<0.05];rs713586位点的TC杂合突变型和显性模型与学龄前儿童患超重肥胖的风险有关[OR及95%CI分别为2.362(1.054~5.289)和2.362(1.054~5.289),P<0.05]。rs11642015和rs6567160位点的多态性与学龄前儿童超重肥胖的关联无统计学意义。rs633715和rs713586的累积效应分析结果显示,携带风险基因型的数量与学龄前儿童患超重肥胖的风险存在正向关联(P趋势<0.01)。结论在汉族学龄前儿童中,SEC16B基因rs633715和DNAJC27基因rs713586位点的多态性与超重肥胖易感性有关,且SEC16B基因rs633715和DNAJC27基因rs713586位点的多态性对学龄前儿童超重肥胖易感性有累积效应,携带风险基因型的数量与儿童超重肥胖风险呈正向关联。
彭锣兰宫照龙韩超陈梁凯石丽丽赵金鹏王梦瑶陈晨卓勤霍军生李岩
关键词:FTOMC4R基因多态性超重肥胖
CYP2D6、MC4R、DRD2、ANKK1基因多态性对氯氮平个体化治疗的影响
2024年
目的研究CYP2D6、MC4R、DRD2、ANKK1基因多态性对氯氮平个体化治疗的影响。方法选取2022年4月~2023年10月在我院就诊的100例服用氯氮平的患者,采用高效液相色谱法测定氯氮平的血药浓度,扩增阻滞突变系统-聚合酶链式反应(ARMS-PCR)检测CYP2D6、MC4R、DRD2和ANKK1基因的突变及多态性。通过研究药物代谢动力学CYP2D6、MC4R、DRD2、ANKK1相关基因的多态性,比较不同基因型患者氯氮平血清药物浓度及泌乳素、总胆固醇的差异。结果CYP2D6^(*)10(100C/T)、CYP2D6^(*)14(1758G/A)、MC4R rs489693(C/A)、ANKK1 rs1800497(G/A)、DRD2 rs4436578(C/T)不同基因型患者的氯氮平血清药物浓度对比具有明显差异(P<0.05),且CYP2D6快代谢者和中代谢者的氯氮平血清药物浓度对比具有明显差异(P<0.05)。CYP2D6^(*)10(100C/T)、CYP2D6^(*)14(1758G/A)、MC4R rs489693(C/A)、ANKK1 rs1800497(G/A)、DRD2 rs4436578(C/T)不同基因型患者的总胆固醇水平对比具有明显差异(P<0.05),且CYP2D6快代谢者和中代谢者的总胆固醇水平对比具有明显差异(P<0.05);DRD2 rs4436578(C/T)不同基因型患者的泌乳素水平对比具有明显差异(P<0.05),但其他基因型患者的泌乳素水平对比无明显差异(P>0.05)。结论CYP2D6、MC4R、DRD2、ANKK1的不同基因型对氯氮平的代谢水平及不良反应存在影响。在采用氯氮平治疗前,应先检测患者的CYP2D6、MC4R、DRD2、ANKK1基因型,并制定个性化的治疗方案,以提高临床疗效。
吴梅丹李绍玲袁云仙温世怡
关键词:CYP2D6MC4R基因多态性氯氮平个体化治疗
一种MC4R R165Q点突变肥胖小鼠模型构建及其应用
本说明书实施例提供一种MC4R R165Q点突变肥胖小鼠的构建方法,该方法包括:基于CRISPR‑Cas9基因编辑技术,将小鼠MC4R 165位的R突变为Q,得到MC4R R165Q点突变肥胖小鼠,该小鼠呈现明显的早发性...
王计秋贾胜宁光刘瑞欣李丹洁
一种MC4R T312I点突变肥胖小鼠模型构建及其应用
一种MC4R T312I点突变肥胖小鼠模型构建及其应用。本说明书实施例提供一种MC4R T312I点突变肥胖小鼠模型的构建方法,该方法包括:基于CRISPR‑Cas9基因编辑技术,将小鼠MC4R 312位的T突变为I,得...
王计秋 贾胜 宁光 刘瑞欣 李丹洁
MC4R拮抗剂化合物、药物组合物及其制备方法和应用
本发明提供了一种式I所示的化合物及其消旋体、立体异构体、互变异构体、同位素标记物、氮氧化物、溶剂化物、多晶型物、代谢产物、酯、前药或其药学上可接受的盐,其具有良好的MC4R拮抗活性,安全性良好,且提高了跨膜活性和药物生物...
陆标杨方龙赵盛王思勤金磊
螺环类MC4R拮抗剂化合物、药物组合物及其在医药上的应用
本发明提供了一种式I所示的化合物及其消旋体、立体异构体、互变异构体、同位素标记物、氮氧化物、溶剂化物、多晶型物、代谢产物、酯、前药或其药学上可接受的盐。该类化合物具有良好的MC4R拮抗活性,安全性良好,且提高了跨膜活性和...
陆标杨方龙赵盛王思勤金磊
作为MC4R拮抗剂的脲类衍生物、药物组合物及其在医药上的应用
本发明提供了一种式I所示的化合物及其消旋体、立体异构体、互变异构体、同位素标记物、氮氧化物、溶剂化物、多晶型物、代谢产物、酯、前药或其药学上可接受的盐。该化合物具有良好的MC4R拮抗活性;本发明化合物不仅具有良好的生物学...
陆标杨方龙赵盛王思勤金磊
作为MC4R拮抗剂的稠环化合物、药物组合物及其在医药上的应用
本发明提供了一种式I所示的化合物及其消旋体、立体异构体、互变异构体、同位素标记物、氮氧化物、溶剂化物、多晶型物、代谢产物、酯、前药或其药学上可接受的盐。该化合物具有良好的MC4R拮抗活性;本发明化合物不仅具有良好的生物学...
陆标杨方龙赵盛王思勤金磊
黔北麻羊MC4R基因多态性及其与生长性状的关联分析被引量:1
2023年
【目的】探究黔北麻羊黑素皮质素受体-4(melanocortin receptor-4,MC4R)基因多态性及其与生长性状的关联性,为黔北麻羊的选种选育提供理论依据。【方法】选取196只6月龄黔北麻羊,利用DNA混合池结合Sanger测序筛选MC4R基因单核苷酸多态性(SNP)位点,并采用SPSS 22.0软件中的一般线性模型(GLM)对MC4R基因SNP位点与黔北麻羊生长性状进行关联分析。【结果】在黔北麻羊MC4R基因中发现4个SNPs位点:g.59345469 C>A和g.59346773 T>C位点分别位于5′-和3′-端非编码区(UTR);g.59345871 A>C位点突变导致第37位天冬氨酸(Asp)变为丙氨酸(Ala),引起RNA二级结构及蛋白质二级结构、三级结构发生明显改变;g.59346263 A>G位点突变导致第168位异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val),对RNA二级结构和蛋白质二级结构有明显影响。关联分析结果显示,g.59345469 C>A位点对黔北麻羊体重、胸围和管围均有显著影响(P<0.05);g.59345871 A>C位点对黔北麻羊体重、体高、管围和胸围均有显著影响(P<0.05);g.59346263 A>G位点对黔北麻羊体高、体重和胸围均有显著影响(P<0.05);g.59346773 T>C位点对黔北麻羊体重和胸围均有显著影响(P<0.05)。4个SNPs位点联合共检测到9种单倍型和21种双倍型,其联合对黔北麻羊体重、体高、胸围和管围均产生显著遗传效应(P<0.05),纯合双倍型H5H5(AAAAGGCC)个体的生长性状优于其他双倍型。【结论】黔北麻羊MC4R基因存在4个SNPs位点,与黔北麻羊体重和胸围均存在显著关联,可作为黔北麻羊体重和胸围的遗传标记用于分子育种。
龙安炬杨酸艾锦新翁吉梅张依裕蔡惠芬罗卫星
关键词:黔北麻羊MC4R基因生长性状

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