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- 小肠结肠炎耶尔森菌
- 本书从病原学、免疫学、流行病学、临床学以及分子生物学等诸方面对小肠结肠炎耶尔森菌进行了描述;编译了“耶尔森菌毒力质粒和抗宿主基因组”作为重要内容,同时就小肠结肠炎耶尔森菌实验室检测技术进行了介绍。
- 汪华主编
- 关键词:小肠结肠炎耶尔森氏菌
- 2009—2023年赤峰地区小肠结肠炎耶尔森菌的调查分析
- 2025年
- 目的了解内蒙古赤峰地区小肠结肠炎耶尔森菌在不同宿主中的分布及病原特征,为该病预防控制和科学研究提供科学依据。方法选择赤峰市部分地区,采取随机抽样方法,分别采集鼠类、家畜、家禽样品和腹泻病人粪便,按常规方法从样品中分离、培养和鉴定菌株,并进行血清和生物分型,同时采用PCR方法测定毒力因子,根据检测结果对本地区小肠结肠炎耶尔森菌的危害进行评估。统计学概率分析采用χ^(2)检验。结果2009—2023年累计检测人和动物样品5157份,共分离小肠结肠炎耶尔森菌66株,总检出率1.28%;其中来自猪62株(占93.93%),鼠3株(4.55%),鸡1株(1.52%),猪的检出率明显高于其他宿主(χ^(2)=196.47,P<0.05),猪咽拭子的检出率显著高于猪粪(χ^(2)=92.89,P<0.05)。血清型、生物型包括:O∶3/3,O∶5/1A,O∶4/4三个型别,致病性的0∶3/3型携带了ail、ystA、yadA、virF、rfbc五种毒力基因;菌株检测出阳性菌的地区有松山区、敖汉旗、阿鲁科尔沁旗和翁牛特旗。结论2009—2023年在赤峰市采集的猪、鼠和鸡体样本中不同程度携带小肠结肠炎耶尔森菌,来自猪样本中检出了三种类型的病原菌,其中O∶3/3型致病菌对人群有潜在致病风险。建议做好当地小肠结肠炎耶尔森菌病的防控工作、强化卫生监督和进一步扩大范围开展小肠结肠炎耶尔森菌的监测工作。
- 董丽于慧霞王立新陈彩玉李萌萌王鑫景怀琦毕书锋王化彬
- 关键词:小肠结肠炎耶尔森菌
- 云南省小肠结肠炎耶尔森菌噬菌体分离及应用价值研究
- 2025年
- 目的分离小肠结肠炎耶尔森菌噬菌体并研究其生物学及基因组特性,探索其应用价值。方法以小肠结肠炎耶尔森菌(CMCC52301)作为宿主菌,分离丽江野鼠鼠疫疫源地齐氏姬鼠盲肠中的噬菌体,经纯化、增殖与浓缩后透射电子显微镜观察形态,并用双层平板法测定噬菌体宿主谱;提取噬菌体DNA并测序,对原始测序数据进行组装及可视化分析,并开展基因组功能注释、噬菌体分类地位、系统发育树、基因组共线性分析等。结果分离到1株小肠结肠炎耶尔森菌噬菌体,命名为vB_Yen_YN301-151,其有头及可伸缩的尾部;该噬菌体仅裂解小肠结肠炎耶尔森菌,不能裂解其他测试菌株;且裂解温度在37℃时较21℃时呈现更透明的噬菌斑;该噬菌体基因结构为双链DNA,基因组长度为51176 bp,GC含量为46.96%;共预测编码基因95个,包括15种结构形态相关蛋白、9种参与复制与代谢蛋白、3种DNA组装功能蛋白、1种噬菌体裂解相关蛋白、67种假定蛋白。经鉴定,该噬菌体属Caudoviricetes纲Drexlerviridae科,系统发育树上与vB_YenM_534、vB_Yen_X1、vB_YenM_281和vB_YenM_531聚成一簇,且与PY100、vB_YenM_25和vB_Yen_X1具有良好的共线性。结论成功分离的vB_Yen_YN301-151是一种新型噬菌体,属Drexlerviridae科,基因编码蛋白多为假定蛋白;仅裂解小肠结肠炎耶尔森菌,具有宿主特异性,有作为诊断噬菌体应用于小肠结肠炎耶尔森菌筛查的潜力。
- 紫绍贵毛春鹏刘攀杨丰义张海鹏王鹏钟佑宏
- 关键词:细菌噬菌体小肠结肠炎耶尔森菌生物学特性基因组
- 1株牦牛源小肠结肠炎耶尔森菌全基因组测序及功能预测分析
- 2025年
- 为了解小肠结肠炎耶尔森菌全基因组序列的功能特点,并丰富该菌基因组数据库信息,试验采用Illumina Hiseq技术对牦牛源小肠结肠炎耶尔森菌SHN1株全基因组进行测序、组装、总长度和GC含量分析,并采用多种生物学软件对细菌全基因组功能元件(编码基因、非编码RNA、CRISPR元件)和亚系统(前噬菌体、基因岛)进行预测分析,然后基于GO数据库、KEGG数据库、COG数据库、NR数据库、CAZy数据库进行基因功能注释,最后基于VFDB数据库和CARD数据库分别对该毒株进行毒力基因和耐药基因预测。结果表明:SHN1株全基因组DNA总长度为4965752 bp,GC含量为49%。基因组中编码基因数量为4523个,有72个tRNA、9个rRNA(其中5S rRNA 7个,16S rRNA 1个,23S rRNA 1个)、28个sRNA、17个CRISPR元件、13个前噬菌体,长度小于15 kb的基因岛共有6个。GO数据库注释得到3141个基因,富集在14060个功能条目上,其中生物学途径类的功能条目占比最高,为50.58%;其次为分子功能类的条目,占比为27.24%;最后为细胞学组件类的条目,占比为22.18%。KEGG数据库注释得到4236个基因,富集在3135个功能条目上,这些功能条目参与了40条通路,其中细胞过程类包含4条通路、295个条目,环境信息处理类包含2条通路、511个条目,遗传信息处理类包含4个通路、195个条目,人类疾病类包含11条通路、173个条目,新陈代谢类包含12条通路、1910个条目,生物系统类包含7个通路、51个条目。COG数据库注释得到3580个基因、富集在4031个功能条目上,这些功能条目可分为24类。其中氨基酸转运和代谢类包含的条目最多,占比为9.65%;其次是碳水化合物运输和代谢类及转录类,占比分别为8.21%、7.10%;细胞骨架类和RNA加工和代谢类包含条目最少,占比分别为0.05%和0.02%。NR数据库注释得到4401个基因、3576条序列,SHN1株与35个物种具有同源性,其中与耶尔森菌属中的3A生物群小肠结
- 李生强冈林环树赵猛马凯茹铁忠华莫迥冯春辉方娅琼马玉婷乔勇升仝丽娜张红见
- 关键词:小肠结肠炎耶尔森菌牦牛全基因组测序
- 辽宁省市售生肉及冷冻鱼糜制品中小肠结肠炎耶尔森菌检测及病原特征分析
- 2025年
- 为了解辽宁省市售鸡肉、牛肉、猪肉和冷冻鱼糜制品中小肠结肠炎耶尔森菌的污染情况和病原特征。2018—2021年从辽宁省超市和农贸市场采集鸡肉250份、猪肉320份、牛肉178份以及冷冻鱼糜制品128份,进行小肠结肠炎耶尔森菌检测,对分离菌株进行生物分型、血清分型、毒力基因检测、药敏试验和质谱分析。结果表明:876份样品中共检出30株小肠结肠炎耶尔森菌,检出率为3.42%(30/876);其中鸡肉检出率为7.20%(18/250),牛肉检出率为4.49%(8/178),猪肉检出率为0.94%(3/320),冷冻鱼糜制品检出率为0.78%(1/128)。30株分离菌株的生物型均为1A型;血清型O:5型为27株,O:8型为3株;检测的5种毒力基因中,ail、ystA、yadA、virF均为阴性,ystB阳性为15株。30株分离株中,耐4种药物的分离株为4株(13.33%),耐6种药物的为1株(3.33%);30株小肠结肠炎耶尔森菌对头孢唑啉、氨苄西林和头孢噻肟3种药物的整体耐药程度较高,耐药率分别为93.33%、66.67%和53.33%,30株分离株均对头孢他啶、氯霉素和庆大霉素3种抗生素100%敏感。30株小肠结肠炎耶尔森菌质谱特征分析表明,聚类为3簇,其中携带ystB基因的分离株均分布在第3簇中。辽宁省市售鸡肉、牛肉、猪肉和冷冻鱼糜制品中小肠结肠炎耶尔森菌的污染是引起食源性疾病的潜在风险因素,分离株对头孢唑啉、氨苄西林和头孢噻肟有较高耐药率。
- 王伟杰刘海霞冯怡博赵韬然张眉眉
- 关键词:小肠结肠炎耶尔森菌毒力基因血清型食源性疾病
- 一种检测小肠结肠炎耶尔森菌的系统、方法及其应用
- 本发明公开了一种检测小肠结肠炎耶尔森菌的系统、方法及其应用。所述方法包括:识别小肠结肠炎耶尔森菌基因组序列中富含AT碱基的序列作为目标序列;针对目标序列自动化、高通量地设计特异性引物;设计特定的Tm值计算公式计算反应变性...
- 曹永梅陈俊江陈清艳杨政华吉玲林彦君李园园刘伟陆晓婷李雪玲陆长德王涤松李亦学
- 生鲜鸡肉中小肠结肠炎耶尔森菌膳食暴露风险评估
- 2024年
- 目的 对市售生鲜鸡肉中小肠结肠炎耶尔森菌的膳食暴露进行模型推演和初步定量风险评估。方法 危害识别和危害特征数据主要来自中国知网和PubMed数据库中2005-2023年小肠结肠炎耶尔森菌病原学特点、致病机制、流行特征等相关文献,并进行筛选;暴露评估中的初始污染数据来源于2022年潍坊市开展的生畜禽肉中小肠结肠炎耶尔森菌专项监测,生长模型、失活模型及参数来源于国内外相关研究数据,储存和解冻方式、交叉污染模型参数来源于国内相关调查研究,气象、人口资料和鸡肉消费数据来源于潍坊市统计年鉴。根据监测数据估算市售生鲜鸡肉中小肠结肠炎耶尔森菌的初始污染浓度,构建该菌的生长和失活模型,结合居民鸡肉消费量调查数据,利用@RISK软件中蒙特卡罗抽样模拟分析每餐因食用生鲜鸡肉摄入的小肠结肠炎耶尔森菌的剂量并评估其致病风险。结果 2022年共采集生鲜鸡肉230份,25份检出小肠结肠炎耶尔森菌,总检出率为10.87%。其中冷冻鸡检出率最高,为15.60%;其次为调理鸡肉和冷鲜鸡,分别为8.57%和7.69%。消费者购买生鲜鸡肉时小肠结肠炎耶尔森菌初始污染水平为-2.521 9 lgCFU/g, 90%CI为-5.65~-0.20 lgCFU/g。经模拟鸡肉运输到家庭时的污染浓度是-2.032 8 lgCFU/g, 90%CI为-4.97~0.13 lgCFU/g。冷藏储存的生鲜鸡肉中小肠结肠炎耶尔森菌的平均污染浓度最高,其次是室温储存,冷冻储藏条件下最低。通过模拟厨房内交叉污染和不完全烹饪场景,推演生鲜鸡肉中小肠结肠炎耶尔森菌污染量和迁移情况,计算得出经厨房交叉污染后,生鸡肉中小肠结肠炎耶尔森菌转移到即食食物中的量为-0.000 360 7 lgCFU/g, 90%CI为-0.002 69~0.003 47 lgCFU/g;在不合理烹饪后的污染水平为-1.021 lgCFU/g, 90%CI为-6.26~9.237 lgCFU/g。居民每餐食用生鲜鸡肉导致的小肠结肠炎耶尔森菌摄入量为2.519 5 lgCFU,90%CI为1.8
- 于明明刘德辉汪忆梦彭子欣徐进郝晓艳任志鹏
- 关键词:小肠结肠炎耶尔森菌
- 承德市生肉中小肠结肠炎耶尔森菌污染状况分析
- 2024年
- 目的了解承德市市售生肉中小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica)的污染状况,探索该菌的毒力基因分布及流行特征。方法2019—2022年采集来自承德市市售生肉样本220份,以检测小肠结肠炎耶尔森菌污染情况,并对检出菌做生化分型、毒力基因(ail,ystA,ystB,yadA,virF)检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型试验。采用占比描述分类变量,采用χ^(2)检验进行组间比较。结果共检出目标菌14株,污染率为6.36%。鲜肉、冻肉、调理类生肉样本污染率分别为8.82%(9/102)、6.58%(5/76)、0%(0/42),差异无统计学意义(χ^(2)=3.896,P=0.143)。14株检出菌均为生物1A型菌株,5株携带ystB,9株无毒力基因携带。PFGE聚类分析结果显示,检出菌的相似度为68.83%~93.35%。结论承德市市售生肉中存在一定程度的小肠结肠炎耶尔森菌污染,不同来源样本的污染状况具有较大差异。生物型与毒力基因检测结果显示检出菌可能无致病性或致病性较低。分子分型结果显示检出菌具有较高的遗传多样性。
- 刁丹红杨杨史婷婷王蒋丽郑雯文牛建栋李雁飞李雪
- 关键词:生肉小肠结肠炎耶尔森菌生物型毒力基因PFGE
- 荧光定量PCR法检测肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌
- 2024年
- 目的:进一步提高肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌的检出效率。方法:按照《食品安全国家标准食品微生物学检验小肠结肠炎耶尔森氏菌检验》(GB 4789.8—2016)进行样品处理、增菌,采用荧光定量聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)方法对增菌液进行初筛,初筛阳性的样本进行菌株分离,挑取选择性平板上典型菌落进行PCR鉴定及生化验证。结果:荧光定量PCR方法能够检出肉制品中低污染水平(1~10 CFU·mL^(-1))的小肠结肠炎耶尔森菌;352份肉制品中共检出小肠结肠炎耶尔森菌阳性样本34份,总检出率为9.66%,其中禽肉检出率为8.94%(27/302),猪肉检出率为14.0%(7/50)。结论:肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌污染率较高,采用荧光定量PCR结合传统生化分离法能提高肉制品中小肠结肠炎耶尔森菌检测效率,减少漏检。
- 于明明孙广雷汪忆梦姜丽丹沈万恒
- 关键词:小肠结肠炎耶尔森菌肉制品
- 小肠结肠炎耶尔森菌来源小细胞的构建与制备方法
- 本发明公开了一种小肠结肠炎耶尔森菌来源小细胞的构建与制备方法。其中,本发明设计了合适的方法制备Y.enterocolitica微型细胞,具体地,相对于亲本细胞,敲除minCD、敲除minCDE、或敲除minCD同时过表达...
- 陈晶瑜琚康辉