王文
- 作品数:13 被引量:140H指数:4
- 供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 汉坦病毒在温州市人与动物间的流行情况被引量:8
- 2010年
- 目的通过对肾综合征出血热(HFRS)监测分析,掌握温州市HFRS的流行规律,为制定HFRS防制措施提供依据。方法采用描述流行病学方法对温州市1981-2008年HFRS人间疫情进行分析;用鼠笼捕捉小动物调查宿主动物种群构成,采用间接免疫荧光法检测小动物肺中的汉坦病毒(HV)抗原,用PCR进行基因分型。结果 1981-2008年全市共发病383例,平均发病率为0.20/10万,死亡13例,病死率为3.39%。全市10个县(市、区)均有发病,尤以瑞安市发病最多,占总病例数的53.78%。发病呈明显的季节性,冬季(11月至翌年1月)为流行高峰,占总病例数的41.25%。病例以20~50岁人群为主,占发病总数的74.76%。宿主动物监测发现野外捕获率7.16%,室内捕获率7.88%。野外以北社鼠为优势鼠种,其次为黄毛鼠;室内以褐家鼠为优势鼠种,其次为黄胸鼠。检测422份小动物肺,HV抗原阳性9份,阳性率为2.13%。提取HV抗原阳性鼠肺组织中的病毒RNA,基因分型全部为汉城病毒(SEOV)。结论调查结果提示应采取加强监测、防鼠灭鼠、疫苗接种等综合防控措施,以有效预防HFRS的流行。
- 林献丹郭文平王文张孝和陈祎谢海斌郑刚廖晓伟陈胜则胡永卫郑晓春李万仓倪庆翔张永振
- 关键词:肾综合征出血热发病率汉坦病毒基因分型
- 河北省2株汉城病毒的遗传特征分析
- 2010年
- 目的 对河北省2株汉城病毒(SEOV)进行基因分型及系统进化分析.方法 用RT-PCR法扩增SEOV Li株和LF18株的S与M全基因片段;利用DNAStar软件分析S与M基因片段核苷酸序列同源性;利用Phylip软件构建系统进化树.结果 Li株与LFl8株的全S基因片段均由1772个核苷酸组成,开放阅读框(ORF)的位置均为43~1332核苷酸,编码429个氨基酸的核蛋白.2株病毒的M片段全基因序列均由3653个核苷酸组成,ORF的位置均为49~3450核苷酸,编码1133个氨基酸的糖蛋白前体.2株病毒的糖蛋白前体有62个半胱氨酸残基以及6个糖基化位点.2株病毒的全S、M基因片段的核苷酸序列与包括疫苗株L99、Gou3、Z37在内的已知SEOV的同源性分别为87.6%~99.2%和83.6%~97.3%.全S和全M基因片段构建的系统进化树显示2株病毒均为SEOV第Ⅲ亚型.结论 Li株和LF18株都属于SEOV,为SEOV的第Ⅲ亚型.河北省汉坦病毒的流行毒株的遗传特征与疫苗株Z37相似.
- 郭文平林献丹王文李明慧朱会宾张永振
- 关键词:系统进化分析
- 对分离自褐家鼠的汉滩型和汉城型病毒的毒力测定
- 2009年
- 目的比较分离自褐家鼠的汉滩病毒(HTNV)CGRn5310株和汉城病毒(SEOV)HR54株的毒力差异,探索汉坦病毒(HV)“溢出”到非宿主动物后的毒力变化。方法选取从贵州省褐家鼠中分离的CGRn5310株HTNV和从河南省褐家鼠分离的HR54株SEOV,用不同稀释度的病毒悬液经脑内接种于昆明乳鼠,观察小鼠发病症状,测定其半数致死量(LD50),并用免疫荧光法检测脑与肺组织内HV特异抗原。结果接种2株病毒后的小鼠生长缓慢,均出现不同程度的神经症状。CGRn5310株的LD50是10^-6.42,HR54株的LD50是10^-4.51。在死亡小鼠的脑与肺组织中均能检测到HV特异抗原,而对照组脑与肺组织内未检测到病毒抗原。结论从褐家鼠中分离到的CGRn5310株HTNV的毒力大于从褐家鼠中分离到HR54株SEOV,这可能意味着HV“溢出”到非宿主动物后毒力变化较小。
- 段正秀李明慧于娟王文郭文平张永振
- 关键词:汉坦病毒汉滩病毒毒力
- 褐家鼠携带2株汉坦病毒的遗传特征分析被引量:3
- 2010年
- 目的 分析来自内蒙古自治区呼和浩特市和河南省杞县两地褐家鼠标本中的汉坦病毒(HV)遗传特征,研究其与已知HV及疫苗株之间的关系.方法 提取病毒总RNA,用反转录-聚合酶链式反应法扩增阳性标本中HV的全M、S基因片段,测序后进行序列特征和系统发生分析.结果 成功扩增出2株HV(NM133株和Q12株)的全M、S基因片段,并测定序列.2株病毒的S基因片段核苷酸序列全长分别为1770nt和1772 nt,均仅有1个开放读码框(ORF),编码429个氨基酸,M基因片段核苷酸序列全长均为3654 nt,编码1133个氨基酸.2株HV与绝大部分已知的汉城病毒(SEOV)具有很高的同源性;但与汉滩病毒(HTNV)等其他型HV同源性较低.2株病毒的核蛋白、糖蛋白氨基酸序列与疫苗株Z37具有一致的二级结构.另外,在用全S和M基因片段核苷酸序列所构建的系统进化树中,2株病毒被分在SEOV的Ⅰ亚型,与Hb8610、R22、HB55、L99以及K24-e7的亲缘关系最近.结论 2株病毒为SEOV的Ⅰ亚型,与包括疫苗株Z37在内的已知SEOV具有很高的同源性和一致的二级结构,提示当前的疫苗能有效预防SEOV引起的肾综合征出血热.
- 王文林献丹郭文平李明慧张永振
- 关键词:汉坦病毒基因分型
- 中国北方地区蜱携带荆门蜱病毒的分子流行特征分析被引量:1
- 2020年
- 目的通过对中国北方地区采集蜱中的荆门蜱病毒(Jingmen tick virus,JMTV)进行基因组扩增并进行系统进化分析,阐明中国北方地区JMTV的分子流行特征。方法采集蜱样本,制备蜱悬液提取总RNA,使用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)进行JMTV检测和基因组扩增,与已知的JMTV进行序列比较及系统发生分析。结果通过对采集于3个省级行政区〔中国西北地区的新疆维吾尔自治区(新疆)博乐市、东北的辽宁省沈阳市和北京市昌平区〕的277只蜱样本进行JMTV筛查,获得阳性样本67只,阳性率为24.2%;并获得4株接近全长的JMTV基因组序列,系统进化分析显示:这4株病毒在节段1、节段2、节段4与已知的新疆啮齿类中发现的JMTV聚集在一个进化分支上;但在节段3构建的进化树中,2株病毒与新疆啮齿类JMTV聚集在一起,而另2株与中国其他地区的蜱源性JMTV聚集在一起,提示可能存在基因重排。结论同源性分析显示,新发现的4株JMTV与已知的中国地区JMTV同源性最高,具有遗传多样性。
- 余竹梅熊衍文王文张永振
- 关键词:系统进化分析同源性
- 浙江省啮齿动物携带心病毒的遗传特征研究被引量:2
- 2016年
- 目的了解我国浙江省的啮齿动物携带心病毒情况,并分析其遗传特征。方法用反转录-聚合酶链反应选啮齿动物粪便标本中的心病毒,扩增其全基因组;利用Lasergene软件分别对多聚蛋白、P1蛋白、2C+3CD蛋白序列与Gen Bank下载的序列进行同源性分析;分析其基因组与多聚蛋白的特征;利用Phy ML软件构建系统发生树。结果浙江省啮齿动物携带心病毒。毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白与心病毒B的同源性分别为71.9%~85.4%、65.2%~89.8%与78.3%~95.4%,属于心病毒B;毒株Wencheng-Rn416的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白与Boone心病毒的同源性分别为92.5%、85.3%与96.9%,属于心病毒C。系统发生分析也表明毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3与心病毒B的亲缘关系最近,Wencheng-Rn416与Boone心病毒的亲缘关系最近。系统发育分析发现啮齿动物在心病毒的起源与进化过程中起着重要的作用,并且可能发生跨种间传播而感染人。结论我国浙江省啮齿动物携带心病毒,并可能跨种间传播到人。
- 郭文平林献丹王文李明慧王淼若邢建光郑剑孙肖瑜倪庆翔张永振
- 关键词:系统发生分析
- 浙江省龙泉市汉坦病毒宿主动物自然感染状况研究被引量:4
- 2011年
- 目的调查浙江省龙泉市肾综合征出血热(HFRS)疫源地小动物中汉坦病毒(HV)的自然感染情况及其流行的基因型。方法用鼠笼在龙泉市查田镇、小梅镇、小梅镇黄南村捕鼠。捕获的小动物进行分类鉴定并解剖取肺脏,用间接免疫荧光法(IFA)检测肺组织中HV抗原,用RT-PCR对HV抗原阳性的样本扩增部分S片段核苷酸序列并测序,构建系统发生树进行基因分型。结果共捕获小动物319只,其中野外312只,室内7只。黑线姬鼠和东方田鼠为野外优势鼠种。肺组织标本中共检测到9份抗原阳性,带病毒率为4.97%,用部分S片段(620~999nt)的核苷酸序列构建系统发生树,结果表明均为汉滩病毒(HTNV),并与Z251分离株的亲缘关系最近。结论龙泉市野外主要存在以黑线姬鼠为宿主的HTNV感染,且携带率较高。
- 王森若王文林献丹梅盛华郭文平张永振
- 关键词:肾综合征出血热汉坦病毒系统发生分析
- 中国淮阳山地区由新蜱传布尼亚病毒引起的出血热被引量:96
- 2011年
- 研究背景 2009-2010年4月至7月,我国淮阳山地区农民中出现不明原因的严重出血热样病例.方法 采集疑似病例的临床标本(血液、尿液、粪便和咽拭子),在患者所在地采集蚊和蜱.从2例患者的血液样本中分离到2株病毒,并进行全基因组测序分析.采用病毒特异的RT-PCR对其他病例及节肢动物进行病毒检测,对RT-PCR阳性病例的临床和流行病学资料进行分析.结果 从2例患者的血液及从犬身上采集到的长角血蜱中分离到1种未知病毒.全基因组测序分析发现该病毒为布尼亚病毒科的一个新成员,与白蛉病毒属最接近,是其中的一个新分支.58例疑似病例中33例RT-PCR结果阳性.病例临床特征主要表现为发热、乏力、恶心、呕吐和腹泻.主要实验室结果包括白细胞及血小板减少,凝血时间异常和肝酶升高.3例患者出现出血症状,5例死亡(死亡率15%).结论 我国淮阳山地区存在着一种严重威胁生命健康的新蜱传布尼亚病毒.对于该病毒的流行病学、地理分布,以及脊椎动物宿主的生态学等需要作进一步的研究.
- 张永振周敦金熊衍文陈小萍贺永文孙强正余滨李娟代永安田俊华覃新程金东崔志刚罗雪莲李伟卢珊王文彭劲松郭文平李明慧李振军张少敏陈晨王艳Menno D.de Jong徐建国
- 关键词:布尼亚病毒出血热蜱传RT-PCR流行病学资料疑似病例
- 中国淮阳山地区由新蜱传布尼亚病毒引起的出血热被引量:21
- 2011年
- 病毒性出血热是一种临床症状表现为急性发热和出血的疾病。病原体为人兽共患及节肢动物携带传播的RNA病毒,包括丝状病毒科(如埃博拉出血热、马尔堡出血热)、沙粒病毒科(拉沙热)、黄病毒科(如登革出血热、黄热病)和布尼亚病毒科(如克里米亚一刚果出血热、肾综合征出血热)。
- 张永振周敦金田俊华覃新程李明慧李振军熊衍文陈小萍贺永文孙强正余滨李娟代永安金东崔志刚罗雪莲李伟卢珊王文彭劲松郭文平张少敏陈晨王艳Menno D.de Jong徐建国
- 关键词:布尼亚病毒
- 内蒙古牙克石地区莫氏田鼠携带汉坦病毒的遗传特征分析
- 2012年
- 目的分析内蒙古牙克石地区莫氏田鼠携带汉坦病毒(HV)的遗传特征及其与汉滩病毒(HTNV)和汉城病毒(SEOV)型HV之间的关系,确定哈巴罗夫斯克病毒(KHAV)的自然宿主。方法采用RT-PCR检测HV核酸、特异性引物扩增S、M基因并测序及进行序列分析。结果共捕获52只莫氏田鼠,其中5只为Hv核酸阳性,带毒率为9.62%。经PCR扩增,5份HV阳性样本获得全S基因片段,2份阳性样本全M基因片段;S基因片段由1848~1861bp组成,M基因片段由3662bp组成。核苷酸序列同源性分析显示,病毒与KHAV具有高度同源性(S基因片段为92.5%~96.4%,M基因片段为88.9%~95.4%),与其他型HV的差异较大。将核蛋白(NP)和糖蛋白(GP)氨基酸序列与HTNV和SEOV进行比较,NP具有一致的二级结构,GP存在明显的差异。用全S与全M的核苷酸序列构建系统进化树,这些病毒均与KHAV聚集在一起,构成一个独立的分支。KHAV分为2个小分支,核苷酸差异〉5.3%。结论内蒙古牙克石地区存在KHAV的流行,莫氏田鼠是KHAV的自然宿主。
- 从美丽郭文平王剑波王文周润宏李明慧张居农张永振
- 关键词:汉坦病毒系统进化分析