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王小奇

作品数：44 被引量：0H指数：0
供职机构：浙江工业大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：自动化与计算机技术文化科学生物学理学更多>>

合作作者

文献类型

  • 43篇专利
  • 1篇学位论文

领域

  • 8篇自动化与计算...
  • 2篇文化科学
  • 1篇生物学
  • 1篇理学

主题

  • 31篇蛋白质结构
  • 31篇构象
  • 27篇蛋白质结构预...
  • 24篇种群
  • 17篇搜索
  • 16篇残基
  • 11篇蛋白质构象
  • 11篇种群更新
  • 10篇能量函数
  • 9篇片段
  • 7篇采样
  • 6篇适应度
  • 6篇搜索效率
  • 6篇采样效率
  • 4篇动态切换
  • 4篇特征向量
  • 4篇切换
  • 4篇向量
  • 4篇空间搜索
  • 4篇概率函数

机构

  • 44篇浙江工业大学

作者

  • 44篇王小奇
  • 43篇张贵军
  • 22篇胡俊
  • 21篇郝小虎
  • 19篇王柳静
  • 2篇陈凯
  • 2篇李章维

年份

  • 17篇2021
  • 3篇2020
  • 15篇2019
  • 7篇2018
  • 2篇2017
共 44 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
一种基于残基特征距离的蛋白质结构预测方法
一种基于残基特征距离的蛋白质结构预测方法。首先，计算出先验知识中目标蛋白的初始残基特征距离与目标构象的特征距离误差，并将这些距离误差作为采样范围的适应度；然后，根据轮盘机制选择出适应度较高的残基范围作为有效的采样区域；最...
张贵军王小奇谢腾宇马来发周晓根胡俊
一种基于二级结构知识的蛋白质构象空间优化方法
一种基于二级结构知识的蛋白质构象空间优化方法，在遗传算法的基本框架下，对每个目标个体完成基于loop区域的交叉和基于片段组装的变异；然后，根据预测的二级结构知识和能量函数对目标个体和变异个体分别进行评价；最后，根据每个个...
张贵军王小奇马来发周晓根王柳静
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一种系综构象选择策略自适应的蛋白质结构预测方法
一种系综构象选择策略自适应的蛋白质结构预测方法，首先预测查询序列的二级结构信息，残基间接触信息，构建片段库；其次建立基于二级结构信息的相似性评分函数和基于残基间接触评价函数，设计交叉、变异、选择策略，设计基于二级结构相似...
张贵军马来发谢腾宇周晓根王小奇王柳静
一种蛋白质结构预测算法评价指标构建方法
一种蛋白质结构预测算法评价指标构建方法，利用Rosetta Abinitio协议对搜索空间进行搜索，通过对背景点的聚类找到潜在天然态区域；然后，执行待评价预测算法的迭代过程，分析每一代种群的进化状态；其次，计算种群前后两...
张贵军谢腾宇王柳静王小奇郝小虎周晓根
文献传递
一种基于特定距离约束的蛋白质结构预测方法
一种基于特定距离约束的蛋白质结构预测方法，首先利用MetaPSICOV预测查询序列的残基间距离接触信息，构建片段库；其次建立基于特定距离约束的打分函数，设计交叉变异策略；最后根据残基间距离约束分值和概率值实现种群更新，利...
张贵军马来发王小奇周晓根王柳静胡俊
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一种基于两阶段采样的蛋白质结构预测方法
一种基于两阶段采样的蛋白质结构预测方法，首先，对种群中的每个个体进行全局的9片段组装，使其形成稳定的三维结构；然后，根据相邻两代间的种群信息进行状态估计，完成全局探测与局部增强的动态切换；最后，对每个个体的loop区域进...
张贵军王小奇马来发周晓根谢腾宇胡俊
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一种基于特定片段交叉的蛋白质结构预测方法
一种基于特定片段交叉的蛋白质结构预测方法，包括以下步骤：首先预测查询序列的二级结构信息，构建片段库；其次设计基于特定片段交叉的策略，建立二级结构信息的适应度函数，设计交叉变异策略；最后根据按比例的适应度分配方法更新种群，...
张贵军马来发王小奇周晓根胡俊
一种基于局部结构比对的蛋白质构象空间优化方法
一种基于局部结构比对的蛋白质构象空间优化方法，在进化算法的基本框架下，采用基于局部结构比对的搜索策略，随机选择一个片段插入窗口，通过两个独立的结构指标将构象中原有的片段信息与片段库中的片段信息进行比对，并根据这两个结构比...
张贵军王小奇谢腾宇周晓根马来发郝小虎
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一种基于二级结构空间距离约束的蛋白质构象搜索方法
一种基于二级结构空间距离约束的蛋白质构象搜索方法，在遗传算法的基本框架下，利用目标蛋白中每个二级结构的空间长度以及相邻两个二级结构中心残基间的空间距离信息构成特征向量作为空间限制条件，使得在给定能量函数的条件下，在一个较...
张贵军王小奇马来发周晓根谢腾宇王柳静孙科
一种基于多阶段子群协同进化策略的差分进化蛋白质结构从头预测方法
一种基于多阶段子群协同进化策略的差分进化蛋白质结构从头预测方法，包括以下步骤：在差分进化算法框架下，采用Rosetta Score3粗粒度知识能量模型来降低构象空间维数；将进化种群依相似度划分为多个子种群，子种群之间协同...
张贵军郝小虎周晓根王柳静陈凯王小奇李章维
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