王燕超
- 作品数：13 被引量：35H指数：4
- 供职机构：广州医科大学更多>>
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- 单精子测序结合PCR-反向点杂交技术在1例东南亚缺失型α地中海贫血患者胚胎植入前遗传学检测中的应用
- 2023年
- 目的探讨单精子测序结合PCR-反向点杂交(PCR-reverse dot blot,PCR-RDB)技术在东南亚缺失型α地中海贫血胚胎植入前遗传学检测中的应用价值。方法选取2020年4月24日就诊于广州医科大学附属第三医院妇产科的一对东南亚缺失型α地中海贫血携带者夫妇,针对男方无法提供家系成员样本的情况,本案例采用上游法结合显微操作移液管挑选其5份单精子样本并进行全基因组扩增,通过PCR-RDB技术确定男方单精子样本的地中海贫血基因分型,在--^(SEA)区域的上下游1 Mb范围内选择单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)作为遗传标记,进行二代测序分析构建双亲单体型。对6份囊胚活检样本进行全基因组扩增后行二代测序,通过单体型分析胚胎是否携带致病变异,并选取非患病囊胚进行移植。孕20周抽羊水进行产前诊断,验证与单基因病胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing for monogenetic disease,PGT-M)结果是否一致。结果女方的致病变异来源于其母亲,男方5份单精子样本的地中海贫血基因分型结果显示有4份为野生型。单精子测序筛选出男方有效位点10个,女方家系连锁分析得到女方有效位点6个,PGT-M结果显示4枚囊胚为αα/--^(SEA),2枚为--^(SEA)/--^(SEA),产前诊断结果显示胎儿基因型为αα/--^(SEA),与PGT-M结果一致,并于孕40周分娩一健康女婴。结论对于家系不全的男性东南亚缺失型α地中海贫血携带者,可采用单精子测序结合PCR-RDB技术筛选SNP位点,通过连锁分析行PGT-M。
- 何健淳黎青王燕超冼嘉嘉张敏聪何文智马晓燕叶国新王晓蔓李少英
- 关键词：植入前诊断
- 307例非缺失型α-地贫的基因型及血液学特征分析被引量：2
- 2020年
- 目的分析广州地区地中海贫血筛查人群非缺失型α-地贫的发生率、基因突变型、构成比和临床特征。方法分析本院近5年诊断为非缺失型α-地贫的患者307例。对所有患者均行地贫基因、血常规和血红蛋白电泳检测。结果 307例非缺失型α-地贫以ααWS/αα最为常见,非缺失型α-地贫患者的MCV值与MCH值整体比正常个体低,携带ααQS等位基因的患者血液学临床表现最重,ααCS较ααQS轻,ααWS的表现最轻。非缺失型HbH病患者中,--SEA/ααCS与--SEA/ααQS均出现血红蛋白H及血红蛋白Barts条带,而--SEA/ααWS未发现。结论在非缺失型α-地贫筛查中,实验员留意受检者的MCV值和MCH值及血红蛋白电泳结果,疑似携带者须做进一步基因检测。
- 冼嘉嘉冼嘉嘉王燕超王燕超李少英何文智马晓燕黎青黎青
- 关键词：血常规血红蛋白电泳
- 三核苷酸重复引物PCR和甲基化特异性多重连接探针扩增技术在脆性X综合征产前诊断中的应用被引量：4
- 2017年
- 目的探讨脆性X综合征(FXS)产前基因诊断的方法。方法采用三核苷酸重复引物PCR法(TP-PCR)及甲基化特异性多重连接探针扩增技术(MS-MLPA)检测2个FXS家系及30例正常对照胎儿样本FMR1基因CGG重复数、AGG排布及FMR 1基因Cp G岛甲基化状态。结果正常对照FMR1基因(CGG)n重复数介于23~40之间,频数最大的重复数为29,AGG排布式以9A9A9最为常见。2个FXS家系中前突变等位基因向子代遗传过程中均发生了CGG扩展。正常对照及前突变携带者FMR1基因Cp G岛均为低甲基化状态,全突变患者Cp G岛为高甲基化状态。结论 TP-PCR和MS-PCR联合应用能够检出胎儿FMR1基因CGG重复数和Cp G岛甲基化状态,从而判断胎儿是否为脆性X综合征患儿,为优生干预提供可靠的依据。
- 何文智李少英王晓蔓王燕超马晓燕冼嘉嘉刘海波王鼎黎青
- 关键词：产前基因诊断
- 广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因
- 马晓燕李少英何文智王燕超王晓蔓冼嘉嘉黎青
- CDAN1基因突变导致的胎儿期非免疫性水肿的家系遗传学分析
- 2021年
- 目的对一例因不明原因胎儿期水肿的流产组织进行临床和遗传学分析,为该家系产前诊断以及遗传咨询提供可靠的理论依据。方法采集孕妇外周血进行血常规、Rh血型和TORCH检测。采集羊水细胞用于细胞培养和G显带核型分析。提取胎儿引产组织基因组DNA行全基因组拷贝数变异测序;采用Agilent's SureSelect XT Human All Exon V6进行文库制备和外显子捕获,并使用Illumina NovaSeq 6000对胎儿及其家系成员DNA行全外显子组测序(trios-WES),并利用SIFT、I-mutant2、PolyPhen-2及PROVEAN生物信息学软件对变异位点进行蛋白功能预测。利用Alpha Fold 2和PyMOL软件对CDAN1的结构进行建模和可视化分析;用Sanger测序对先证者及家系成员进行突变检测和验证。结果胎儿17周超声提示胎儿全身皮下广泛水肿,右侧胸腔大量积液,肝脾增大,胎盘增厚,心包缺损。染色体核型分析检测和染色体拷贝数变异测序结果均正常;全外显子组测序显示CDAN1基因:c.2140C>T(p.Arg714Trp)和c.1264_1265delCT(p.Leu422Glyfs*16)复合杂合突变,分别来自先证者父亲和母亲,生物信息学预测为可能致病性突变,对应的疾病为先天性红细胞生成障碍性贫血1型。结论全外显子组测序结果显示,该胎儿为先天性红细胞生成障碍性贫血(CDAN1基因突变)导致的胎儿期非免疫性水肿,其中CDAN1基因c.1264_1265delCT为首次报道的突变。
- 王燕超黎青黎青李少英孙筱放张敏聪李少英何文智
- PCR荧光探针法在Y染色体微缺失检测中的应用被引量：3
- 2018年
- 目的比较无精子症因子(azoospermia factor,AZF)PCR荧光探针法与多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测法的结果吻合度。方法收集2016年6月至2017年6月来我院就诊的208例男性不育患者外周血。根据WHO 2010年第5版精液分析操作指南将208例患者分为正常精子症组、无精子症组和少精子症组。用PCR荧光探针法对208例男性不育患者检测Y染色体无精子症因子,然后采用多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测208例不育患者Y染色体无精子症因子。结果在208例不育男性患者中,正常精子症组有100例,无精子症组47例,少精子症组61例。PCR荧光探针法检测Y染色体无精子症因子,少精子症组1例AZFc区(SY254/SY255)缺失,无精子症组1例AZFabc区缺失,正常精子症组未发现基因缺失类型。多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测法结果与PCR荧光探针法检测结果一致。结论 2种方法检测的患者无精子症因子基因的结果吻合度一致。与多重聚合酶链反应结合琼脂糖凝胶电泳检测法相比,PCR荧光探针法一次上样可以做48个样本,节省了时间与成本,结果自动保存,可以作为Y染色体微缺失检测的推荐方法。
- 陈晴晴李少英冼嘉嘉王燕超黎青
- 关键词：无精子症因子Y染色体微缺失基因分析
- 应用QF-PCR技术快速诊断胎儿染色体非整倍体异常
- 李少英刘海波何文智马晓燕冼嘉嘉王燕超黎青
- Expressmarker22系统检测广东汉族人群中的标准梯度外等位基因被引量：7
- 2018年
- 【目的】分析Expressmarker22(EX22)系统检测广东汉族人群中的梯度标准物范围之外(OL)等位基因频率及序列组成,完善频率数据库。【方法】应用EX22系统对3495例广东汉族无关个体进行STR分型,统计等位基因分型OL的等位基因频率并筛选稀有等位基因。通过比对STRBase数据库和相关文献,对暂未报道的OL样本进行单基因座扩增及克隆测序。【结果】共发现分布于10个基因座中的33种OL等位基因,频率为0.3‰~4.6‰,其中稀有等位基因25种,11个未见报道。测序结果显示以核心序列的不完整重复多见。【结论】OL等位基因数据有助于提高个体识别率和非父排除率,有效补充法医DNA多态性数据,完善数据库建设。
- 马晓燕李少英何文智王燕超王晓蔓冼嘉嘉黎青
- 关键词：短串联重复序列测序
- 广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因
- 目的分析广东汉族人群21个STR基因座的稀有等位基因频率及序列组成,为进一步研究基因多态性提供基础数据。方法检测3495例广东汉族无关个体的21个STR基因座分型,统计等位基因分型标准物之外(Of f-Ladder,OL...
- 马晓燕李少英何文智王燕超王晓蔓冼嘉嘉黎青
- 文献传递
- 染色体核型分析联合QF-PCR技术在产前诊断中应用
- 目的：本研究通过对产前诊断大样品的分析,对染色体核型分析联合QF-PCR 技术在产前诊断中应用进行评估.方法：采用染色体核型分析和QF-PCR 技术同时对1660 例产前诊断样本进行检测.结果：1660 例产前诊断样本(...
- 李少英叶国新何文智马晓燕冼嘉嘉王燕超黎青
- 关键词：染色体非整倍体核型分析
