陈丝
- 作品数:8 被引量:26H指数:2
- 供职机构:湖南农业大学园艺园林学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”湖南省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 茶树CCoAOMT基因克隆及启动子的结构分析被引量:2
- 2019年
- 茶树咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是甲基化EGCG生物合成的一种重要酶,为探明CCoAOMT基因的表达调控规律,进一步解析甲基化EGCG生物合成的调控机制。本研究采用同源克隆法获得了茶树CCoAOMT的cDNA全长序列,采用染色体步移技术(Genome walking)获得了该基因的启动子序列,并对其序列进行了生物信息学分析。结果表明,CCo AOMT全长cDNA为1 000 bp,其中开放阅读框长735 bp,编码245个氨基酸,含有caffeoyl-CoA O-methyltransferase和SAM功能结构域;进一步分离得到CCoAOMT基因上游调控序列1 624 bp,发现其含启动子核心元件TATA-box、CAAT-box及5'UTR Py-rich stretch (高水平转录顺式作用元件)、MYB (干旱诱导时的MYB结合位点)、G-box、GAG-motif、GATA-motif、GT1-motif、Sp1 (光响应元件)、CGTCA-motif、TGACG-motif (茉莉酸甲酯响应元件)等重要顺式作用元件。由结果推测,CCoAOMT基因在转录水平受各类转录因子的调控,该结论为进一步研究CCoAOMT基因的转录调控机制提供了理论指导。
- 林海燕罗勇陈丝禹双双曾泽媛刘仲华王坤波王坤波
- 关键词:茶树CCOAOMT基因克隆启动子
- 茶树WRKY转录因子的鉴定与分析被引量:2
- 2017年
- 本研究以三个不同品种的茶树叶片转录组数据为材料,通过PAFM、SMART数据库对茶树WRKY转录因子进行严格搜索与鉴定,得到45个茶树WRKY转录因子,利用生物信息学的方法分析了茶树WRKY蛋白的一级结构性质、分类、系统发生学和保守结构域等特征。结果表明,茶树基因组至少存在45个以上的WRKY转录因子,氨基酸数在44~613之间,部分WRKY不稳定,约占11%;根据WRKY结构域的数量及锌指结构特征可将其分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ三大类,GroupⅡ可分成多个亚类,有部分成员的七肽保守域和锌指结构域发生了突变;三级结构显示,茶树WRKY蛋白保守结构域含5个β折叠。采用比较转录组学的方法研究了茶树WRKY转录因子的表达模式,结果表明,不同茶树品种间存在较多的差异WRKY基因,有的呈显著上调表达趋势,有的下调表达;该研究是茶树WRKY基因进化及功能研究的理论基础,对进一步揭示不同茶树品种间差异性状的形成机理和转录调控机制具有重要意义。
- 罗勇陈丝欧淑琼石玉兰郑楚楚刘仲华王坤波王坤波
- 关键词:茶树WRKY转录因子生物信息学
- 茶树中甲基转移酶的研究进展被引量:1
- 2016年
- 甲基转移酶普遍存在于茶树中,它与茶叶类黄酮物质及咖啡碱的形成、茶树冷驯化过程中DNA甲基化模式的变化和硒代半胱氨酸的形成有关。本文综述了茶树甲基转移酶的基因研究、原核表达和催化特性研究,为以后茶树体内的甲基化修饰提供理论依据。
- 陈丝罗勇石玉兰王坤波
- 关键词:茶树基因克隆
- 茶树分子遗传图谱的研究进展被引量:1
- 2017年
- 简要概述了茶树分子遗传图谱构建方法和国内外茶树分子遗传图谱研究进展,并由此提出构建高密度茶树分子遗传图谱的措施,为茶树分子遗传图谱的构建提供参考。
- 石玉兰郑楚楚陈丝欧淑琼彭靖王坤波
- 关键词:茶树分子标记
- 茶树CCoAOMT原核表达及酶促条件优化
- 2020年
- 优化了重组茶树咖啡酰辅酶A–O–甲基转移酶基因(CCoAOMT)在大肠杆菌中的表达,采用Ni–NTA亲和层析柱对重组蛋白进行纯化。以表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)为底物,进行体外酶促反应,采用HPLC测定反应产物EGCG3"Me的生成量。结果表明,CCoAOMT在E.coliBL21中能够高效表达,最优条件为诱导温度37℃,诱导时间4 h,异丙基–β–D–硫代半乳糖苷(IPTG)浓度0.5 mmol/L;重组蛋白经Ni–NTA亲和层析柱梯度洗脱达到了较好的纯化效果;重组酶在体外能够催化EGCG,合成EGCG3"Me,底物EGCG最佳浓度为0.05 mmol/L,最适温度为37℃,最适pH值为4。
- 唐倩陈丝陈丝李勤李娟李勤
- 关键词:茶树原核表达酶促合成
- 茶叶中甲基化EGCG的分离及功能研究进展被引量:1
- 2015年
- 综述了茶叶中甲基化EGCG的分离方法和功能研究进展。茶叶甲基化EGCG分离方法有制备液相色谱(p HPLC)、高速逆流色谱(HSCCC)、Sephadex LH-20凝胶柱层析、Toyopearl HW-40S中压柱层析等,主要具有抗过敏、保护肝脏、调节肠道菌群、治疗哮喘、清除自由基等功效。
- 禹双双陈丝罗奕凡王坤波
- 关键词:茶叶
- 基于RNA-Seq的茶树CsMYB生物信息学分析被引量:5
- 2017年
- 作为植物中最大的转录因子家族之一,MYB参与多种生物学过程,本研究基于RNA-Seq技术,对获得的一条茶树MYB Unigene,将其命名为CsMYB。采用生物信息学的分析方法,对CsMYB基因片段氨基酸序列同其它植物间相应片段进行同源性和系统进化分析,并进行该基因编码蛋白的理化性质和结构功能预测,结果表明:CsMYB基因编码的蛋白含315个氨基酸,是一种亲水性蛋白,定位于其它细胞器,该蛋白不存在信号肽,是一种非分泌蛋白;其编码的氨基酸序列与葡萄的同源关系较近,与豆科植物的同源关系较远;功能结构分析表明其20~127位氨基酸之间含2个保守的HTH-MYB类型结构域,归属于R2R3-MYB家族;二三级结构分析表明CsMYB主要由无规则卷曲和α-螺旋组成,空间结构主要是螺旋和转角。分析茶树基因组MYB基因的表达模式,发现不同茶树品种间大部分差异MYB基因表达呈显著上调趋势,少部分下调表达。
- 罗勇欧淑琼陈丝石玉兰郑楚楚刘仲华王坤波黄建安
- 关键词:转录组转录因子生物信息学
- 茶黄素的生理功效研究进展被引量:14
- 2015年
- 茶黄素是红茶中的主要成分,是多酚类物质氧化形成的一类能溶于乙酸乙酯的、具有苯并卓酚酮结构的化合物总称,具有抗氧化、抗衰老、抗突变、抗癌防癌、降血糖、降血脂、防治心血管疾病等多种功效,有很好的应用价值和开发前景,已成为国内外研究的热点。本文对国内外茶黄素生理功效的研究进展进行了综述,为茶黄素的深入研究提供参考。
- 罗奕凡禹双双陈勤操陈丝王坤波
- 关键词:茶黄素生理功效