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文明

作品数：1 被引量：1H指数：1
供职机构：中山大学更多>>
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合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇数据发掘
  • 1篇全序列
  • 1篇系统树
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇基因组全序列
  • 1篇寡聚核苷酸
  • 1篇核苷酸

机构

  • 1篇中山大学

作者

  • 1篇王军鹏
  • 1篇蓝一杰
  • 1篇张尚宏
  • 1篇熊远妍
  • 1篇文明

传媒

  • 1篇中山大学学报...

年份

  • 1篇2008
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
基因组寡聚核苷酸频率组分差异的进化信息被引量：1
2008年
利用不同基因组全序列中寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树,并与传统方法的建树结果比较,分析以寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树的可行性及适用范围。在获得194种原核生物基因组全序列寡聚核苷酸频率数据的基础上,依据寡聚核苷酸组分的保守性构建权重矩阵,对寡聚核苷酸组分差异加权,并尝试用绝对值距离、Lance距离、欧氏距离三种方法计算距离矩阵,再用距离法构建系统树。结果显示,该方法对科以下分类单位的建树与传统方法的建树基本一致,而对科以上的分类单位较难区分。首次利用寡聚核苷酸频率保守性进行加权,通过非比对的算法用基因组全序列建树。
熊远妍王军鹏蓝一杰文明张尚宏
关键词：基因组全序列寡聚核苷酸系统树数据发掘生物信息学
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