王艳丽
- 作品数：2 被引量：5H指数：2
- 供职机构：重庆师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家级大学生创新创业训练计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 重庆地区蜜蜂微孢子虫的鉴定及分子遗传多样性分析被引量：3
- 2015年
- 采用PCR扩增、克隆与测序的方法,对重庆东南地区引起意大利蜜蜂(意蜂)蜂群出现明显下降趋势的病原微孢子虫的遗传标记基因SSU r DNA(小亚基核糖体脱氧核糖核酸,small subunit ribosomal DNA)和ITS(内转录间隔区,internal transcribed spacer)以及3个单拷贝座位分子标记肌动蛋白基因(Actin),热激蛋白基因(Hsp70)和RNA聚合酶基因(RPB1)进行分子水平扩增及测定,并与国内外不同地理分布的蜜蜂微孢子虫种群进行了分子遗传多样性比较及单倍型分析。结果显示,该蜜蜂微孢子虫分离种群为东方蜜蜂微孢子虫,命名为CQYX。序列分析表明东方蜜蜂微孢子虫重庆分离群与其它地理种群之间的遗传多样性水平上无差异性。高频单倍型为重庆CQYX地理群与其他不同地理种群所共有,并分化成不同的低频种群特异性单倍型,表明重庆CQYX种群和其他不同地理来源的东方蜜蜂微孢子虫种群具有共同的遗传起源,并经历了近期的快速扩增。本研究有助于进一步在分子水平上探讨意蜂中东方蜜蜂微孢子虫的地理起源。
- 张素贞何超王艳丽马振刚张小燕周泽扬许金山
- 关键词：单倍型
- 家蚕微孢子虫中小RNAs的全基因组鉴定与分析(英文)被引量：2
- 2015年
- 【目的】家蚕Bombyx mori微粒子病是蚕业生产上的毁灭性病害,家蚕微孢子虫Nosema bombycis是该病的病原,可经卵垂直传播和经口水平传播。为了探索家蚕微孢子虫中对重复元件的抵御以及对基因转录调控的潜在方式,本研究拟在基因组水平上对该物种的小RNAs进行全面系统的分析,鉴定与转座子相关的小RNAs和潜在的miRNAs。【方法】从感染家蚕微孢子虫的家蚕中肠中提取总RNA,分离小片段RNA并反转录后,进行Solexa高通量测序。通过生物信息学方法对小RNAs进行分类及功能注释,鉴定起源于家蚕微孢子虫不同类型转座子的小RNAs,并对潜在的miRNA进行预测分析。【结果】家蚕微孢子虫小RNAs的长度主要是24和25 nt,其中大部分序列表现出5'末端的尿嘧啶偏好性。家蚕微孢子虫中存在丰富的与转座子相关联的小RNAs,并且与转座子标准序列匹配的反义小RNAs明显多于正义小RNAs。同时,鉴定获得了31个候选miRNAs,部分为Nosema属的其他孢子虫中所共有,暗示其在微孢子虫基因组进化上具有保守性。【结论】首次鉴定到家蚕微孢子虫的转座子相关性小RNAs,暗示小RNAs在家蚕微孢子虫基因组对转座子防御过程中起到作用,31个潜在的miRNAs为家蚕微孢子虫miRNAs的功能验证提供了后续靶标。
- 潘秋玲李田何强马振刚范晓东张小燕王艳丽周泽扬许金山
- 关键词：家蚕微孢子虫小RNA转座子MIRNA基因组
