【目的】采用形态学观察和分子鉴定方法对甜瓜病原菌新疆株(前人鉴定为枯萎病病原菌Fusarium oxysporum(Schi)f.sp.melonis Snyder et Hansen)、枯萎病病原菌辽宁株和根腐病病原菌(Fusariumsolani(Mart.)Sacc.)进行研究,确定病原菌新疆株的种类。【结果】对病原菌新疆株进行形态学观察发现其有蓝色色素,维管束变褐不向上发展。此后又对三种病原菌进行了大亚基rDNA-D1/D2区序列分析、rDNA-ITS区序列分析,两者分析结果表明病原菌新疆株与根腐病病原菌同源性高。【结论】分子鉴定与形态学鉴定结果一致,表明病原菌新疆株为腐皮镰孢菌(Fusarium solani(Mart.)Sacc.)而非尖镰孢菌(Fusariumaxysporum(Schi.)f.sp.melonis Snyder et Hansen),是根腐病病原菌,与前人鉴定结果不同。