吕耀娟
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：江苏大学基础医学与医学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- URI1蛋白生物信息学分析及在人体组织中的表达被引量：1
- 2013年
- 目的分析人非经典前折叠素RPB5相互作用因子1(URI1)蛋白的特性、结构和变异体,观察URI1蛋白在人组织中的表达。方法通过多种网络分析工具,预测和分析URI1的基本特性及结构。用人组织微阵列免疫组化染色方法检测其在多种组织/细胞中的表达。结果 URI1编码1个535个氨基酸的蛋白质,该蛋白质性质不稳定,无跨膜片段,N末端无信号肽,非分泌型蛋白质,其mRNA在组织中广泛表达。URI1具有11个潜在的泛素化位点,其中6个为高度可信,5个为中度可信。有48个潜在的磷酸化位点(35个在丝氨酸位、11个在苏氨酸位、2个在酪氨酸位)。在第287氨基酸位有一糖基化位点,在第291、371氨基酸位也可能发生糖基化修饰,未发现乙酰化位点。蛋白质结构预测α螺旋(H)占39.63%,N端具有1个PFD功能域。URI1在多种组织/细胞广泛表达并存在明显差异表达,与基于高密度微阵列技术的BioGPS mRNA表达谱数据吻合。结论用生物信息学技术预测了URI1蛋白的结构和功能,为URI1蛋白的相关研究提供了信息。
- 谷俊侠冉德园梁玉婷乔龙威李晓云吕耀娟郑其平
- 关键词：变异体生物信息学
- 牛血清清蛋白在小鼠骨肉瘤模型PCR基因分型中的应用
- 2013年
- 目的验证在PCR反应体系中加入牛血清清蛋白(BSA)可否提高小鼠骨肉瘤模型floxed Rb1基因杂合子和纯合子的检出率与准确率。方法以小鼠骨肉瘤模型子代小鼠基因组DNA为模板,进行Rb1基因的PCR基因分型。对在PCR反应体系中添加适量浓度(0.16 mg/mL)的BSA与不加BSA的PCR基因分型结果相比较。PCR引物序列涵盖Rb1基因外显子19两侧或3'端的LoxP序列。结果反应体系中添加BSA后,可成功获得PCR扩增条带:单一650 bp或247 bp(野生型)、单一700bp或295 bp(floxed Rb1基因纯合型)以及650 bp和700 bp(或247 bp和295 bp)混合条带(floxed Rb1基因杂合型),而反应体系中未加BSA的则无PCR扩增条带产生。结论 BSA可显著提高floxed Rb1基因的扩增效率,增加了该基因杂合子和纯合子的检出率并排除了假阴性结果,对于难以扩增的靶基因序列的PCR基因分型具有借鉴意义。
- 谷俊侠乔龙威梁玉婷冉德园吕耀娟郑其平
- 关键词：RB1基因
