张亚楠
- 作品数：3 被引量：11H指数：2
- 供职机构：海南大学热带农林学院更多>>
- 发文基金：公益性行业(农业)科研专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 基于COⅠ基因片段的瓜实蝇遗传多样性分析被引量：4
- 2017年
- 瓜实蝇是一种重要入侵害虫,广泛分布于热带和部分亚热带国家和地区,寄主广,危害性大。本研究对中国6个主要分布省份、19个地区瓜实蝇线粒体COⅠ基因中的部分序列进行了测定,分析了种群的遗传学关系并建立系统进化树。结果表明,在获得的640 bp的DNA序列中,可变位点16个,其中简约性信息位点7个,单变异位点9个。Fst值为0.107 88,Nm值为2.07,遗传距离为0~0.001 8。单倍型多样性云南、广西最高。聚类分析发现国内各地理种群间差异不显著。中国19个种群的瓜实蝇存在一定的遗传分化,但分化程度很低。
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- 关键词：瓜实蝇地理种群单倍型遗传分化
- 瓜实蝇DNA甲基化的MSAP体系建立与优化被引量：1
- 2016年
- 瓜实蝇[Bactrocera cucurbitae(Coquillett)]是中国重要的蔬菜害虫,但其DNA甲基化研究尚未见报道。甲基化敏感扩增多态性是研究DNA甲基化的重要技术之一。通过对酶切反应、连接、PCR扩增和引物筛选等条件优化,建立瓜实蝇MSAP反应体系,即:120μL酶切体系中加入10 U的限制性内切酶与600 ng基因组DNA,于37℃酶切反应过夜;220μL连接体系中加入T4连接酶1 U,HpaⅡ-MspⅠ-adapter接头50 pmol,Eco R I-adapter接头5 pmol,并于16℃反应12 h;3连接产物稀释后进行PCR预扩增和选择性扩增,再经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测结果。通过该体系筛选出适用于瓜实蝇基因组DNA甲基化多态性研究的6对引物;瓜实蝇MSAP体系为瓜实蝇的表观遗传学研究提供了技术支持。
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- 关键词：瓜实蝇DNA甲基化甲基化敏感扩增多态性表观遗传
- 甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)在生态学中的应用被引量：6
- 2016年
- DNA甲基化是生物体内最为重要的表观遗传修饰形式之一,在生态学上的应用越来越广泛。在收集、整理生态表观遗传学相关文献的基础上,介绍了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)的原理、优势与局限性及其在生态学上的应用和展望。MSAP因其应用广泛、操作简便等优点成为研究DNA甲基化水平的有力工具,特别是在探究生物体如何快速适应生境变化以及外来入侵生物如何突破遗传瓶颈等问题上。MSAP技术能够很好地揭示生物种群内部或种群之间的表观遗传差异,是对遗传多样性、遗传变异研究的有力补充。
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- 关键词：生态学种群变异
