敖涛
- 作品数:4 被引量:23H指数:2
- 供职机构:中国科学院西双版纳热带植物园更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国科学院重点实验室基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 蓖麻DNA糖基化酶的序列与基因表达分析被引量:1
- 2014年
- 为揭示DNA糖基化酶在调节蓖麻生长发育和影响基因印记过程中的分子机理,本研究基于蓖麻全基因组、利用生物信息学的方法结合转录组数据和RT-PCR半定量表达分析,鉴别蓖麻DNA糖基化酶氨基酸序列的结构特征、系统发生和表达形式。结果显示:三种DNA糖基化酶(DME、ROS和DML)氨基酸均为不稳定氨基酸,具有典型的与DNA结合和碱基切除修复有关的保守结构域;系统进化分析发现三种DNA糖基化酶在植物中同源性强,而且是独立演化的结果;在不同组织的表达上,蓖麻的DME和ROS基因具有相似的表达形式,即在根、茎和叶中不表达,在胚乳中表达最高,而DML在各个组织中都未检测到基因的表达。
- 代梦媛敖涛徐伟刘爱忠
- 关键词:蓖麻脱甲基化
- 蓖麻SnRK2基因家族的鉴定和特征分析被引量:9
- 2015年
- SnRK2是一类植物特有的Ser/Thr类蛋白激酶。为研究其在蓖麻抗逆过程中的作用,基于蓖麻的基因组序列信息,利用生物信息学方法鉴定了6个蓖麻SnRK2蛋白激酶成员。分析发现这些蛋白具有亲水性属性,基因结构分析表明,植物SnRK2基因在进化过程中具有很高的保守性;系统与进化分析发现植物SnRK2蛋白在单、双子叶植物中分化显著,可能是独立演化的结果。高通量RNA-seq测序结果显示,大部分SnRK2基因在检测的各个组织中均有表达,且在不同组织间或种子发育的不同阶段没有明显的组织特异性;外源ABA处理种子后,Group 2的基因表达显著上调。进一步利用半定量RT-PCR技术检测外源(100μmol/L)ABA、(250mmol/L)Na Cl和(4℃)冷胁迫处理的幼苗,发现Group 2中的基因29908.m006067被这3种胁迫强烈激活,基因29772.m000313对ABA和冷胁迫有较强的响应。
- 敖涛胡尊红和珊胡学礼刘旭云刘爱忠
- 关键词:蓖麻蛋白激酶NACL冷胁迫
- 蓖麻种子油脂累积的生理与遗传调控机理研究
- 发展可再生生物质能源是解决人类能源危机和环境污染的重要途径.利用边际土地发展油脂类生物质能是生物质能的重要组成部分.蓖麻(Ricinous communnis L.)因为适应性强和油脂成份独特(主要有羟基化脂肪酸组成)、...
- 敖涛张洋刘爱忠
- 关键词:环境因子生物柴油
- 蓖麻GATA基因家族的鉴定和特征分析被引量:13
- 2015年
- GATA因子在植物中广泛参与了光响应调控、叶绿素合成以及碳、氮代谢等与作物产量息息相关的生物学过程。本研究基于蓖麻基因组信息,鉴定了19个蓖麻GATA家族成员,根据基因结构、蛋白结构和系统进化分析将其分为4个亚家族。理化性质分析发现GATA蛋白具有亲水性。基因和蛋白结构分析发现,蓖麻与拟南芥的GATA成员在结构上非常保守。利用高通量RNA-seq测序数据分析蓖麻GATA基因在各个组织中的表达情况,发现GATA基因主要在根和叶中表达,在种子中表达较低。进一步通过半定量RT-PCR技术检测GATA基因在黑暗下的表达情况,结果显示有三个GATA基因在黑暗处理后表达下调,预示着蓖麻GATA基因参与了光响应调控过程。这些信息为蓖麻GATA基因家族的功能分析和提高蓖麻产量提供了理论基础。
- 敖涛廖晓佳徐伟刘爱忠
- 关键词:蓖麻基因表达黑暗处理